Учитывая особенности корейской и китайской агентуры, ЯВМ считали, что русская эмиграция является наилучшей базой для создания сети наиболее ценной, квалифицированной агентуры и в особенности агентов, диверсантов, радистов и др. В связи с этим ЯВМ организовали сеть разведшкол и курсов, где готовились русские разведчики. Однако, несмотря на их большое количество, ЯВМ сохраняли эти кадры на период наиболее тяжелой борьбы, т. е. на случай войны Японии с Советским Союзом, не рискуя агентами в момент жесткого пограничного режима.
Большое внимание ЯВМ уделяли работе по использованию в разведывательных целях бурятского населения, ранее проживавшего в СССР или имевшего родственные связи на советской территории, а также орочен и якутов, проживающих в Хинганском горном районе.
С началом германо-советской войны японские военные миссии активизировали свою разведывательную работу по советскому Приморью и Дальнему Востоку. Руководящий состав ЯВМ был значительно обновлен и пополнен офицерами-разведчиками, прошедшими специальную подготовку и знающими русский язык. На территорию СССР стали перебрасывать большое количество агентуры с задачей проведения военной разведки, диверсии и вредительства с последующим возвращением в Маньчжурию. Наряду с этим забрасывалась агентура на длительное оседание для развертывания шпионской и вербовочной работы. Кроме засылки рядовой агентуры, усилилась заброска квалифицированных разведчиков.
ЯВМ уделяли исключительно большое внимание вопросу подбора и вербовки своей агентуры. Это объяснялось тем, что ЯВМ, кроме действующей агентуры, имели громадное количество агентов, которые зачислялись в резерв и были предназначены для использования во время войны с Советским Союзом. К ним относились граждане, прошедшие специальную подготовку в разведывательном отряде Асано, на краткосрочных курсах агентов-пропагандистов и в ряде других военизированных отрядов и формирований.
Подбор кандидатур на вербовку производился сотрудниками оперативных отделений ЯВМ лично через специальных вербовщиков, а также через подчиненные миссиям органы полиции, жандармерии, белоэмигрантские организации и формирования. С этой целью использовались резиденты, а также проверенные на практической работе агенты. Намеченные к вербовке кандидатуры обставлялись и проверялись контрразведывательной агентурой. Вербовка подобранных кандидатур производилась исходя из конкретной обстановки и характера того или иного кандидата различными методами и способами.
В процессе следствия по делам арестованных официальных сотрудников и агентуры ЯВМ было установлено, что каждый агент перед заброской его на территорию Советского Союза снабжался соответствующей легендой, которая тщательно отрабатывалась с агентом во время его пребывания на конспиративной квартире.
Непосредственно перед выходом на территорию СССР агенты проходили подготовку по существу и содержанию задания, изучали по имевшимся в ЯВМ документам и материалам район и маршрут движения. При инструктаже особое внимание обращалось на применение маскировки и методов ухищрения при переходе границы и действиях на чужой территории.
Обычно разведывательная агентура из числа китайцев и корейцев содержалась на полном иждивении ЯВМ на конспиративных квартирах и в специальных поселениях. Так, на ст. Мадаоши, муданьцзянской ЯВМ был создан специальный поселок, в котором проживала вся китайская и корейская агентура. Имея представленные ЯВМ земельные участки и сельхозорудия, агенты в свободное время занимались сельским хозяйством и огородничеством, сдавая сельхозпродукты ЯВМ. Исключение из этого числа составляли только старые заслуженные агенты из числа китайцев, корейцев и русская агентура, которым разрешалось проживать вместе с семьями в пунктах их постоянного местожительства.