Недолго пробыв в Польше, Николай Коперник продолжил образование в Падуе, изучая в весьма знаменитом местном университете медицину, и в Ферраре, где ему была присвоена степень доктора богословия. В возрасте 30 лет он вернулся на родину, поселившись в резиденции епископа в Лидзбарке. Будучи секретарем и личным врачом своего дяди, уже тогда он проводил астрономические исследования и понял, что теория древнегреческого ученого Клавдия Птолемея неверна. Коперник собирался посягнуть на святая святых, а именно на систему устройства мира, оспорить которую никто не решался уже более тысячи лет. Суть ее в том, что Земля находится в центре Вселенной, а Солнце и другие небесные тела вращаются вокруг нее. Система Птолемея подтверждалась учением церкви, оттого и была несокрушимой.
После смерти дяди в 1512 году Николай обосновался во Фромбор-ке, где п опутно с исполнением обязанностей каноника и врача активно занимался астрономией. В башне крепостной стены находилась галерея, которую Коперник использовал как обсерваторию. Частые туманы с Вислы, создававшие трудности для наблюдений, не останавливали ученого, стоящего на пороге открытия. Коперник использовал для исследований инструменты, сделанные своими руками по собственным чертежам. Около 4 лет он работал над формированием нового учения и в 1515 году написал труд «Комментарии», где сначала описал взгляды древних ученых о движении планет, а затем изложил положения, касавшиеся гелиоцентрической системы мира. Основной мыслью здесь было то, что не Солнце вращается вокруг Земли, а наоборот, все планеты «вертятся» вокруг Солнца – центрального тела небесной системы. Эту воистину революционную рукопись при жизни Коперника не напечатали, и она считалась утерянной вплоть до XIX века, когда были найдены чудом сохранившиеся копии.
Ученому пришлось участвовать в войне с ливонцами в 1520 году: взяв на себя командование гарнизоном Ольштына, он сумел отстоять замок-крепость.
Неуклонно поднимаясь по служебной лестнице, Коперник в течение 30 лет подготавливал главный труд своей жизни – трактат «Об обращениях небесных сфер», ставший итогом наблюдений и сложных расчетов. Будучи и наблюдателем, и мыслителем, он сумел подметить, что восприятие человеком движения небесных тел аналогично восприятию перемещения предметов на Земле движущимся человеком, то есть когда кажется, что Солнце движется вокруг неподвижной Земли, в самом деле Земля вращается вокруг Солнца и вокруг своей оси.
Первый экземпляр главного труда Коперника увидел свет в 1543 году, когда автор уже стоял на пороге вечности. Доступная сначала лишь для ученых, книга, тем не менее, сразу обрела сторонников, став опасной из-за свободомыслия и способности подорвать авторитет церкви. Поэтому священнослужители поспешили занести ее в список запрещенной литературы. В дальнейшем теория Коперника послужила основой для открытия Кеплером закона движения планет и помогла Ньютону прийти к мысли, что движение планет определено притяжением Солнца.
Проведя большую часть жизни в маленьком городке на берегу Вислы, Коперник, подобно дяде, служил каноником в костеле, посвящая досуг астрономии и безвозмездному лечению больных. Однако известен он только в качестве астронома и врача. Этот образованный и разносторонний человек писал труды по исторической хронологии и тригонометрии, был грамотным экономистом, работал над составлением географических карт Польши. Коперник выпустил трактат «Об исправлении монеты», где доказал, что порча монеты не лучшим образом влияет на хозяйственную жизнь страны. Будучи знатоком греческого и латыни, он переводил и сам писал поэмы на этих языках, активно сотрудничал с зарубежными коллегами, учеными из Польши и, в частности, из Кракова. В XVI веке Ягеллонский университет был единственным заведением, где его учение преподносилось правильно и открыто. Жители Фромборка благодарны пану Николаю за изобретение и установку гидравлической машины, которая снабжала водой все городские дома.
В летопись Ягеллонского университета навечно вписаны имена выдающихся мыслителей разных эпох – тех, кто получал здесь знания, а затем становился известным на весь мир. Многие из профессоров университета поддерживали отношения с видными деятелями из Европы, таким образом способствуя проникновению и развитию идей гуманизма в своей стране.
Стоит упомянуть о мастере рукописной книги Бальтазаре Бехэме (1460–1508), также выпускнике Краковского университета, служившем городским писарем и нотариусом, а прославившемся в качестве художника-оформителя. Составленный им «Кодекс Бальтазара Бехэма», как в те времена именовали книгу, в которой отдельные тетради-сочинения заключались в один переплет, был написан на 379 листах пергамента и содержал в себе не только тексты с перечислением привилегий и цеховых уставов, но и рисунки – 27 цветных миниатюр со сценами из жизни краковских ремесленников.