«Я, как был в то время млад и неопытен, не спросил батюшку, какие это беды и скорби, - вспоминал Иаков. - А после его кончины и желал бы знать, до уже было поздно». Наступила суббота 11 октября 1841 года. В восьмом часу утра отец Лев приобщился Святых Таин. Вскоре в его келию вошел юродивый Василий Петрович Брагузин, который жил в 180 верстах от Оптиной и находился в духовном общении со старцем. Отец Лев попросил его молиться, чтобы Господь избавил его от вечной смерти. «Авось избавит!» - отвечал юродивый.
Около 11 часов утра присутствующие заметили, что, хотя страдания умирающего не прекратились, его лицо разгладилось и просветлело. «Ныне со мною будет милость Божия», - произнес отец Лев. Простившись с братией, он оставил подле себя одного келейника, который вскоре увидел, что старец смотрит на икону Богородицы. Иаков поспешно позвал монахов, но говорить отец Лев уже не мог. Он перекрестил учеников, осенил крестным знамением себя, еще раз взглянул на икону Божией Матери и закрыл глаза. На часах было 17.30.
Три дня тело почившего иеросхимонаха стояло в соборном храме, не источая запаха тления. Руки его были белые и теплые. Все вспомнили, что незадолго до смерти старец сказал: «Если получу милость Божию, тело мое согреется и будет теплое». С утра до ночи церковь была полна окрестным народом, который шел проститься с любимым отцом и духовным наставником.
Похоронили отца Льва рядом с соборным Введенским храмом, за южным приделом святителя Николая Чудотворца. Там же был похоронен его друг, ученик и благотворитель Алексей Иванович Желябужский, умерший совсем недавно, 11 июня. При жизни отец Лев не раз говорил ему: «Мы с тобой рядышком ляжем, бок с боком». Даже надгробные памятники им поставили одинаковые -чугунные, украшенные позолотой и обнесенные решеткой. На надгробии отца Льва была сделана надпись: «Кто есть человек, иже поживет и не узрит смерти; но блажени умирающие о Господе; ей, почиют от трудов своих. Памятник сей покрывает тело почивающего о Господе с миром иеросхимонаха Леонида (Льва), понесшего благое Христово иго в монашестве 46 лет; родом был из карачевских граждан, по фамилии Наголкин. Уснул сном смерти в надежде воскресения и жизни вечныя. Оставил о себе память в сердцах многих, получивших утешение в скорбях своих. Скончался 11 октября 1841 г.; всего жития его было 72 года. Памятник сей воздвигнули усердие и любовь к нему».
Весть о смерти отца Льва болью отозвалась в сердцах всех знавших и любивших его людей. Любимый ученик и преемник его по старчеству Макарий (Иванов) писал: «Нельзя сомневаться, чтобы он не удостоился получить милость от Господа и верно будет ходатайствовать о нас, грешных, странствующих в юдоли сей плачевной и боримых страстьми душевными и телесными». Настоятель Оптиной, отец Моисей, писал: «Какие я получаю известия из девичьих монастырей! Что там было по получении писем о кончине его! Плач и рыдание и вопль мног.
В Севске учредили неусыпаемую Псалтирь до 40 дней и думали, что только некоторые приверженные будут читать, но вместо того все наперерыв бегут почтить память его славословием Божиим и молением о нем, - до двухсот человек произвольно читают. Тверская игумения пишет, что не осушает слез... Из Борисовки пишет М. Т., что всех расположенных к батюшке огорчило до зела известие о кончине его; только что-то всех надежда одушевляет об обретении им вечного блаженства, и сим разгоняется мрак печали».
После смерти отца Льва переменили мнение о нем многие его гонители. Так, схимонах Вассиан, когда-то мечтавший искоренить «лянидовщину», начал называть отца Льва «мудрецом», а епископ Калужский и Боровский Николай в 1843 году сожалел, что не ценил старца при жизни и верил нелепым слухам о нем. «И я человек, и потому мог ошибаться, поверив тому, что некоторые говорили», -признавался епископ.
...Бурный ХХ век стал самым трагическим столетием в долгой истории Введенской Оптиной пустыни. Она пала одной из первых жертв советской власти - была закрыта уже 23 января 1918 года. Вернули Церкви монастырь только во время «перестройки», 17 ноября 1987-го. За минувшие годы его территория изменилась непоправимо - были снесены намоленные храмы; те постройки, что уцелели, неоднократно перестраивались под разные нужды. Исчезло с лица земли и монастырское кладбище, в том числе и надгробие отца Льва (Наголкина)...