Но об этой самой мистике не раз вспоминали уже наяву именно через 200 лет. В 1920-х годах началось массовое изъятие церковных ценностей. Тогда же серебряная рака и мощи Александра Невского были вынесены из Александро-Невской лавры. Рака была передана Государственному Эрмитажу, а сами мощи – Музею истории религии и атеизма, открытому в то время в Казанском соборе.
Строившиеся на протяжении многих лет монастырские здания создавались в стиле петровского барокко. В основе всего архитектурного комплекса лежит шестиугольник, образованный каменными двухэтажными корпусами, в которых располагались преимущественно монастырские кельи, а также служебные помещения, книгохранилище, семинария. После смерти Доменико Трезини основные работы осуществлялись архитекторами Теодором Швертфегером и Михаилом Дмитриевичем Расторгуевым.
При лавре образовалось несколько кладбищ, расположенных за пределами монастырского каре. Старейшим из них является Лазаревское кладбище, возникшее ещё во времена Петра I при церкви в честь воскрешения праведного Лазаря, находится оно за пределами острова, на территории Безымянного острова. Кладбище стало местом погребения выдающихся государственных деятелей России, а также учёных, писателей, архитекторов, художников и музыкантов. Здесь похоронены М.В. Ломоносов, Д.И. Фонвизин, А.Н. Воронихин, А.И. Захаров, скульпторы И.П. Мартос, Ф.И. Шубин, М.И. Козловский и многие другие замечательные люди.
Справа от Лазаревского кладбища расположено Тихвинское кладбище с церковью в честь Тихвинской иконы Божией Матери. На нём похоронены знаменитые русские писатели и поэты Н.М. Карамзин, В.А. Жуковский, И.А. Крылов, Ф.М. Достоевский, композиторы М.И. Глинка, А.С. Даргомыжский, М.П. Мусоргский, Н.А. Римский-Корсаков, А.П. Бородин, П.И. Чайковский и многие другие, а также художники А.И. Иванов, А.И. Куинджи, И.И. Шишкин и многие архитекторы, скульпторы, артисты. К востоку от собора располагается более позднее Никольское кладбище, с церковью во имя святителя Николая.
После Октябрьской революции лавра была закрыта. Перед самым входом в собор была устроена «коммунистическая площадка» – кладбище революционных и партийных деятелей. Во многих монастырских зданиях разместились мастерские. В 1939 году на базе существующего с 1923 года «музея-некрополя» был создан Государственный музей городской скульптуры, в ведении которого находились произведения мемориальной скульптуры в некрополях и усыпальницах Александро-Невской лавры. Мемориальная экспозиция музея размещается в здании Благовещенской усыпальницы Александро-Невской лавры. Этот выдающийся памятник зодчества петровского времени создан архитекторами Доменико Трезини и Теодором Швертфегером в 1717–1724 годах.
В 1956 году Свято-Троицкий собор был возвращен верующим. В 1985 году церкви был передан Никольский кладбищенский храм. Официальная дата возрождения монастыря – 25 ноября 1996 года.
Большую часть территории острова занимает Митрополичий сад.
Рядом с Александро-Невской лаврой находился Александровский плац. Он использовался для учений лейб-гвардии Казачьего полка.
На территории плаца в XIX веке была построена Городская барачная больница, которая размещалась в деревянных бараках (отсюда название). Но в народе иначе, как Боткинские бараки, больницу и не называли. Да и сейчас называют. Это была первая в Петербурге и в России инфекционная больница. С ней связывали множество самых невероятных и мистических историй и небылиц. Даже бытовала страшилка: мол, если что не так, отправят тебя в Боткинские бараки. Подразумевалось, что хуже ничего быть не может.
Инфекционная городская больница имени С.П. Боткина, бывшая Александровская городская барачная больница в память Сергея Петровича Боткина, основана в 1882 году как первая городская барачная больница на 300 коек. До этого времени инфекционных больных, как в Петербурге, так и во всей России лечили дома.
С самого начала к баракам были подведены водопровод и электричество. В больнице была устроена первая в России дезинфекционная камера, имелась карета для перевозки больных, производились анализы невской воды, научные исследования.
С 1889 года – Городская барачная в память С.П. Боткина больница.
В 1930-х годах реконструирована, построены каменные корпуса; тогда же получила название Клинической инфекционной больницы. Но горожане до сих пор называют её «Боткинские бараки».
В 1960-1970-х годах были возведены пять современных корпусов. Служит базой кафедр инфекционных болезней всех медицинских вузов Петербурга. С 1995 года – центр инфекционной службы города.