Утвержденный императором устав предоставлял широкие права монахам в миссионерской и хозяйственной деятельности, что дало новый толчок строительной деятельности. Кроме церкви Покрова Пресвятой Богородицы после окончания войны на прибрежной территории были воздвигнуты: корпус для размещения братии, большой дом для школы абхазских детей, несколько зданий для трапезы, просфорни, других разных монастырских служб и для приема поклонников, устроена пристань на прочных железных сваях, заведены два пчельника и проложены дороги. Везде требовалось преодолевать большие трудности: вырубить и очистить лес, на месте которого посеяна пшеница, посажены фруктовые сады, разбиты виноградники и огороды.
В 1880 г. началось восстановление из руин древнего Симоно-Кананитского храма, причем были приняты меры для сохранения его древнего облика: развалины тщательно очистили от мусора и щебня, восстановили местами обрушившиеся стены и покрыли храм куполом в византийском стиле. Пол был сделан деревянный, а иконостас поставлен резной дубовый; многие иконы для храма прислали с Афона. Освящение храма совершил в день памяти св. апостола Симона Кананита, 10 мая 1882 г., экзарх Грузии, архиепископ Иоанникий. С. В. Булгаков писал об этой церкви в 1913 г., что «в ней заметны еще в двух местах остатки древней стенной живописи, причем один из ликов святого великомученика Георгия Победоносца сохранился весьма отчетливо почти в полной неприкосновенности». Вблизи храма был устроен беломраморный фонтан в виде креста, материал для которого привезли со Святой Горы Афонской, а воду провели из скалы, где, по преданию, была пещера св. апостола Симона. Соседняя высокая пирамидальная гора, на которой находились остатки Анакопийской крепости, была названа Иверской в честь одной из главных святынь Афона. В дальнейшем на этой горе в месте, где сохранились высокие стены еще одной древней церкви, была устроена часовня в честь Иверской иконы Божией Матери[173]
. В 1884 г. пещера св. ап. Симона Кананита, где, по преданию, уединялся и молился апостол, была освящена водосвятием, в ней прорубили вход для паломников и поставили икону святых апостолов Андрея и Симона.В первое время после ее официального утверждения в обители было всего 56 человек, почти исключительно присланных из Свято-Пантелеимоновского монастыря. Богослужение на Новом Афоне совершались по чину Святой Афонской Горы; уставы и чиноположения были такими же, как в Руссике. В 1880 г., после кончины иеромонаха Арсения (Минина), во игумена для Ново-Афонского монастыря в Руссике был избран прежний помощник эконома Свято-Пантелеимоновского монастыря иеромонах Иерон (Носков), возведенный в 1889 г. в сан архимандрита. Пребывая на Кавказе, о. Иерон вплоть до своей кончины 14 августа 1912 г. никогда не прерывал духовного и делового общения со старцами Свято-Пантелеимоновского монастыря, о чем свидетельствуют несколько тысяч страниц писем, сохранившихся в монастырском архиве. По благословению своих старцев о. Иерон 2 мая 1880 г. был пострижен в схиму[174]
.31 мая 1880 г. монастырь посетили великие князья Константин Николаевич и его сын Константин Константинович. Они осмотрели Покровскую церковь и древний храм св. апостола Симона Кананита, пожелав духовного и материального преуспеяния юной обители. Ее настоятель иеромонах Арсений вспоминал: «Константин Николаевич подробно спрашивал: когда я поступил в монашество, какие были побудительные к сему причины, сколько находился в искусе до пострижения, сколько прожил на Афоне, когда прибыл на Кавказ, какая причина поселения нашего на Кавказе, и многое иное, и об Афоне расспрашивал, с удовольствием воспоминая о своем посещении Афона, и очень милостиво распростился с нами»[175]
. В июне 1882 г. в обители побывал великий князь Алексей Александрович, внимательно осмотрев ее и древний храм св. ап. Симона Кананита, уже возобновленный и освященный[176].Оказывавший большое покровительство Ново-Афонскому монастырю, великий князь Михаил Николаевич 10 июня 1880 г. посетил его со своим сыном Михаилом Михайловичем. Покровитель обители, осмотрев ее церкви, посетил настоятельские кельи, монастырскую школу для абхазских детей и в память своего пребывания подарил древнему Симоно-Кананитскому храму большую серебряную позолоченную лампаду для образа св. ап. Симона Кананита с надписью на ее верхнем поясе: «Свет во тьме светит, и тьма не объяла его». На втором поясе лампады имелась еще одна надпись: «От Его Императорского Высочества, благоверного государя, великого князя Михаила Николаевича, в память первого посещения древней церкви Симона Кананита в Ново-Афонской обители 10-го июня 1880 г.»[177]
.