В феврале 1919 года 3-я армия, полностью восстановив свою боеспособность, включилась в общее зимнее наступление войск Восточного фронта. В ходе боев части 3-й армии освободили ряд населенных пунктов, оставленных ими в декабре 1918 года.
Общее зимнее наступление армий Восточного фронта, начавшееся в ноябре — декабре 1918 года, не приостанавливалось, несмотря на временный отход в декабре 3-й армии и сдачу Перми. 2-я армия Восточного фронта, успешно переправившись на левый берег Камы, вела наступательные действия на кунгурском направлении.
На фронте 5-й армии в первую половину декабря бои шли с переменным успехом. Самарской группе белых удалось на время захватить Белебей. Но уже с середины декабря инициатива целиком перешла в руки советских войск. Попытки командующего самарской группой белочехов и белогвардейцев генерала Войцеховского задержать с помощью подошедших резервов — частей 12-й Уральской дивизии и французской артиллерийской части — продвижение советских войск в районе станции Чишмы были безуспешны. Части 5-й армии, несмотря на усталость и острый недостаток в снабжении, сбили белогвардейцев и интервентов с занимаемых ими позиций и устремились к Уфе.
Среди солдат белых участились случаи сдачи в плен. За несколько дней на уфимском направлении 5-й армии сдалось около 8 тысяч солдат. Попытки колчаковского командования пополнить войска мобилизованными в прифронтовых районах Урала рабочими и крестьянами не дали ожидаемых результатов. Многие призывники отказывались вступать в армию Колчака и группами уходили в леса.
31 декабря части 5-й армии освободили Уфу, а через несколько дней — Бирск.
Стремясь задержать дальнейшее продвижение советских войск, колчаковское командование в начале января 1919 года дало указание о переброске новых сил на центральный участок фронта. С конца января бои на центральном участке Восточного фронта разгорелись с новой силой. Белогвардейцы стремились не допустить советские войска к уральским горным проходам.
В результате наступательных действий 2-й и 5-й армий на центральном участке Восточного фронта была освобождена значительная территория. Советские войска подошли к Уральскому хребту — естественной преграде, отделявшей Сибирь от центральных районов Советской России. Своими действиями 2-я и 5-я армии отвлекли на себя часть белогвардейских сил, предназначавшихся для развития боевых действий на пермском направлении, и облегчили тем самым отражение наступления белых на левом крыле Восточного фронта.
На правом крыле фронта, где действовали 1-я и 4-я армии, важнейшей задачей советских войск было освобождение Оренбурга и Уральска и восстановление связи с Советским Туркестаном, положение которого осенью 1918 года стало особенно трудным.
Туркестан со всех сторон был осажден войсками интервентов и белогвардейцев. На его территории действовало немало агентов Антанты, организовавших мятежи и диверсии против Советской власти. Осенью 1918 года интервенты и белогвардейцы намеревались окончательно задушить Советский Туркестан. Они намечали осуществить это совместными усилиями армии Дутова и английских и белогвардейских войск в Закаспии. Удары с фронта должны были быть поддержаны выступлениями контрреволюционных сил внутри Советского Туркестана.
Большевики Туркестана готовили трудящихся к отпору интервентам и белогвардейцам. Руководствуясь указаниями ЦК партии, они сосредоточили основное внимание на организации и укреплении вооруженных сил. В армию было направлено большое количество рабочих. 24 сентября 1918 года в Туркестане была объявлена 10-процентная мобилизация на фронт членов профсоюзов, которая прошла с большим подъемом.
В прифронтовых районах в армию иногда уходили почти поголовно все рабочие крупных предприятий. 5 октября объединенное заседание Туркестанского ЦИК, Совнаркома и президиума Главного железнодорожного исполнительного комитета постановило провести частичную мобилизацию населения в армию и усилить агитационную работу в массах. Одновременно были приняты меры для укрепления тыла и ликвидации контрреволюционных заговоров и мятежей.
В октябре 1918 года предприняли наступление английские интервенты в Закасппи. Они выступили из района станции Каахка, куда были отброшены в августе 1918 года. При поддержке белогвардейцев и националистов из Закаспия интервенты, имея многократное превосходство в коннице и артиллерии, обходным движением захватили станции Арман-Сагад и Душак, где учинили дикую расправу над ранеными красноармейцами и железнодорожниками. Советские отряды, находившиеся между этими станциями, оказались отрезанными.
Для восстановления положения необходимо было выбить противника со станции Душак. С помощью подошедших из Байрам-Али и Мерва советских частей эта задача была выполнена.
14 октября советские войска с боем заняли поселок и станцию Душак. В районе станции советские бойцы освободили 150 жителей поселка, брошенных интервентами в подвал нефтесклада и томившихся там в ожидании смерти.