При подготовке к отражению агрессии высшим политическим руководством страны 8 февраля 1941 г. была проведена очередная реорганизация органов государственной безопасности. Из всех наркоматов, пожалуй, только на НКВД было возложено непомерное количество разных задач, которые снижали его эффективность в борьбе с противником. Это защита государственной безопасности, охрана общественного порядка и государственных границ, войсковая охрана особо важных промышленных предприятий и железнодорожных сооружений, руководство местами заключения, противопожарная охрана, местная противовоздушная оборона, управление шоссейными дорогами, содержание в лагерях и организация трудового использования осужденных, проведение крупнейших хозяйственных работ, освоение новых районов в отдаленных северных областях СССР, руководство архивным делом и запись актов гражданского состояния и др. Поэтому НКВД СССР был разделен на два ведомства: НКВД СССР и НКГБ СССР.
В связи с необходимостью максимального улучшения агентурной работы органов госбезопасности и возросшим объемом решаемых задач НКВД СССР, их многообразием в состав НКГБ вошли разведывательное, контрразведывательное, секретно-политическое управления, управление коменданта Московского Кремля, следственная часть и некоторые самостоятельные отделы. Главное экономическое и Главное транспортное управления были упразднены. Кроме того, из системы НКВД-НКГБ выведены особые отделы.
В совместном Постановлении ЦК ВКП (б) и СНК СССР от 8 февраля 1941 г. отмечалось: «В настоящее время, в связи с укреплением Красной армии и Военно-Морского Флота, значительным усилением их мощи и боевой готовности, ростом хорошо подготовленных и преданных делу партии Ленина-Сталина кадров командного и политического состава, ЦК ВКП (б) и СНК СССР считают целесообразным передать органы особых отделов из ведения НКВД в ведение Наркомата обороны и Наркомата Военно-Морского Флота». Третьи управления НКО и НКВМФ должны были вести борьбу с контрреволюцией, шпионажем, диверсией, вредительством и всякого рода антисоветскими проявлениями в Красной армии и Военно-Морском Флоте; выявлять и информировать НКО и НКВМФ о всех недочетах в состоянии частей армии и флота и имеющихся компрометирующих материалах на военнослужащих армии и флота. Вместе с тем, при НКВД СССР был организован 3-й отдел с функциями чекистского обслуживания пограничных и внутренних войск НКВД СССР. Постановление подробно регламентировало процесс передачи ОО НКВД в Третьи управления НКО и НКВМФ (кадры, подчинение, взаимодействие, структура, финансирование и другие вопросы) в течение пяти дней[57]
.При внимательном анализе данного постановления следует согласиться с А. Стародубцевым, утверждающем, что особые отделы передавались в НКО и НКВМФ чисто формально и аргументация их передачи выглядит малоубедительно. Они оставались тесно связанными с ШСГБ, служившие в них сотрудники госбезопасности для конкретной работы по-прежнему использовали оперативные возможности (наружное наблюдение, сбор данных о людях по месту жительства, оперативная техника) подразделений родного ведомства. Забегая вперед, отметим, что «экскурсия» особистов в структуры НКО оказалась непродолжительной: спустя почти два месяца после начала войны они снова были переданы в возрожденный НКВД СССР.
НКГБ был освобожден от проведения всякой другой работы, не связанной с решаемыми им задачами. Он должен был обеспечить ведение разведывательной работы за границей; борьбу с подрывной, шпионской, диверсионной, террористической деятельностью иностранных разведок внутри СССР; оперативную разработку и ликвидацию остатков всяких антисоветских партий и контрреволюционных формирований среди различных слоев населения СССР, в системе промышленности, транспорта, связи, сельского хозяйства и пр.; охрану руководителей партии и правительства[58]
.Руководителем НКГБ был назначен В.Н. Меркулов, Л.П. Берия возглавил НКВД. Кроме того, как зам. Председателя СНК СССР он курировал работу НКВД и НКГБ. Внешняя разведка вошла в НКГБ в качестве его 1-го Управления. Его начальником остался П.М. Фитин.