В итоге к 1647 г. господствующая в парламенте умеренная группировка пресвитериан посчитала, что те задачи, которые она ставила перед собой, начиная борьбу с королевской властью, выполнены и пора искать пути соглашения с побежденной стороной. Продолжения, а тем более углубления преобразований эти круги не хотели. Гражданская война, сломавшая многие прежние стереотипы поведения, подогревшая радикальные настроения, грозила благополучию зажиточных слоев, поддерживавших пресвитериан. Не удивительно, что их лидеры стремились к достижению политической стабильности и закреплению в правовых нормах сложившегося статус-кво.
По-иному оценивали обстановку индепенденты, опорой которых была революционная армия. В наиболее концентрированном виде их программа была сформулирована сподвижником Кромвеля Генри Айртоном. В его «Главах предложений» ключевым моментом были требования, связанные со значительным расширением власти парламента: в его компетенцию включалась высшая судебная власть и контроль за армией. Предполагалось осуществить реформу избирательной системы, с тем чтобы увеличить представительство городов, а следовательно, торгово-финансовых слоев. Сегодня, в век атеизма и бутафорной религиозности, трудно представить, сколь важное значение имели религиозные вопросы в жизни людей XVII века. Сплошь и рядом они были для них важнее меркантильных экономических и политических проблем. Не случайно английская революция, социальная по своему содержанию, по форме во многом носила религиозную оболочку. Вопросы о том, какой должна быть правильная религия, какую роль и место она должна занимать в жизни людей и общества в целом, имели для англичан того времени первостепенное значение. Ясно, что Айртон, претендовавший на выражение программно-целевых установок индепендентов, не мог обойти эти вопросы. Он резко выступал против «насильственного принуждения кого-либо к принятию ковенанта» (пресвитерианства) и добивался представления независимости каждой религиозной общине.
Рядовые англичане, вступившие в армию парламента, верили, что борются за более счастливую жизнь, за обновленную Англию, где люди будут равны не только перед Богом, но и в повседневной жизни. Однако король был разбит, а светлое будущее явно не проглядывалось. «Главы предложений» отражали интересы прежде всего верхушки армии, но по сути дела ничего не давали рядовым солдатам. В их среде зрело убеждение, что необходимо углублять преобразования. На этой основе еще в середине 40-х годов возникло движение левеллеров (уравнителей), признанным вождем которых стал Дж. Лильберн. В основе его мировоззрения лежала идея равенства. Он полагал, что верховная власть принадлежит народу и исходит от него. Отсюда идея республики, власть в которой должна находиться в руках однопалатного парламента, избираемого каждые два года всеми мужчинами (кроме слуг), достигшими 21 года. Лильберн выдвигал также ряд прогрессивных социально-экономических требований: реформы налогообложения, ликвидации всех монополий, уничтожения десятины, запрета огораживания.
Серьезные расхождения внутри революционного лагеря предвещали резкое обострение политической борьбы, ставкой в которой была судьба Англии. Все участники конфликта готовились к решающему столкновению. Многое в этой ситуации зависело от позиции армии. Стремясь усилить свое положение в вооруженных силах, Кромвель и его единомышленники добились создания Совета армии, который держал войска в постоянной готовности. Пресвитериане же стремились к скорейшему роспуску армии, утверждая, что, поскольку война завершилась, содержать столь огромный военный контингент совершенно ни к чему. Конфликт между армией и парламентом нарастал.
6 августа 1647 г. армия вступила в Лондон. По инициативе Кромвеля была осуществлена чистка парламента, откуда были изгнаны лидеры пресвитериан. Большинство в этом органе перешло к индепендентам. Однако конфликт этим не был исчерпан. На заседании Совета армии произошло столкновение сторонников Кромвеля с представителями левеллеров. И те, и другие пытались навязать свои программно-целевые установки всей армии, чтобы использовать ее как таран в политической борьбе.
Споры между индепендентами и левеллерами затягивались, чем воспользовался Карл I, бежавший из плена. В феврале 1648 г. в стране вновь вспыхнула гражданская война. Однако уже в августе в битве у Пренстона роялисты были разбиты, а король опять пленен. Победоносная парламентская армия в декабре 1648 г. вернулась в Лондон. Опираясь на ее мощь и авторитет, лидеры индепендентов провели новую чистку парламента. Новый, «очищенный» состав парламента принял решение о суде над королем. Короткое судебное разбирательство завершилось вынесением Карлу I смертного приговора, и 30 января 1649 г. он был казнен, а в мае 1649 г. Англия стала республикой.