Проливные дожди сделали почти непроходимыми горные дороги, реки вышли из берегов, но Албукерке настойчиво шел вперед ускоренным маршем. Поскольку у него не было колесного транспорта и имелось относительно мало вьючных животных, его люди не могли взять с собой много пороха и патронов. Поэтому Албукерке непрестанно слал гонцов к губернатору Морайсу с требованием подготовить необходимый запас боеприпасов. 15 октября, готовясь перейти через Серра-ду-Мар, Албукерке получил послание от губернатора Рио с известием, что город пал и что теперь он просит прийти и отвоевать его. Несколько дней спустя, уже оставив позади горы, он получил от Кастро Морайса еще одно послание, что тот ведет переговоры с противником. Немедленно вслед за этим известием было получено третье послание, в котором сообщалось, что была подписана капитуляция, и для ее подтверждения были переданы врагу заложники. Все еще надеясь, что помощь не запоздает, Албукерке направился к временному лагерю Кастро Морайса. Здесь он обнаружил, что в наличии было всего лишь четыре бочонка пороха. Он также узнал, что у португальцев совсем не осталось артиллерии, что французы заняли все форты, батареи и окопы, что была выплачена большая часть выкупа и что Кастро Морайс совсем не озаботился оставить при себе французских заложников в обмен на своих. В сложившейся обстановке Албукерке с горечью осознал, что ему ничего не оставалось сделать, как только смириться с произошедшим.
Конец истории таков. Прибытие Албукерке со своими белыми бойцами, мулатами и рабами-неграми, «столь же закаленными, как и солдаты», побудило Дюге-Труэна ускорить подготовку к отплытию. Окончательно рассчитавшись с португальцами, он передал им город и форты и 13 ноября отплыл. Горожане остались благодарны Дюге-Труэну за его рыцарское обращение с женщинами и ранеными, попавшими в плен. Жители вернулись в свои разграбленные дома, и у них не было проблем в торговле с любезными французами. Дюге-Труэн также вернул иезуитам большую часть церковной утвари, которую спас от разграбления. И последнее, но не менее важное. «Благородный джентльмен» дал прибежище на своих кораблях приверженцам криптоиудаизма, которые ожидали депортации в Португалию, чтобы предстать перед судом инквизиции.
Дав разрешение горожанам и купцам на выкуп своей собственности и позволив вести торговлю золотым песком и полновесной монетой, Дюге-Труэн сумел собрать значительную денежную сумму для судовладельцев из Сен-Мало в дополнение к золотым слиткам, полученным от города. Исходя из того, что сахар и другие товары, захваченные в портовых складах, будет невозможно продать во Франции по высокой цене, он отдал следующее распоряжение: погрузить товары на два больших захваченных у португальцев судна и отправить их в плавание вокруг мыса Горн в Перу, чтобы сбыть там эти товары испанцам. Оставшиеся суда и товары были проданы португальцам по предложенной ими цене. Даже Албукерке, который был настроен против подобной торговли с французами, в итоге приобрел у них порох.
Постоянно дувшие встречные ветры заставили французского главнокомандующего отказаться от первоначального плана разграбления Баии на обратном пути во Францию. В Гвинейском заливе его флотилию задержал штиль. На широте Азорских островов его суда попали в страшный шторм (29 января 1712 г.), и два корабля пошли на дно со всей командой. Одним из них был «Magnanime», вместе с ним погиб де Курсерак и большая часть выкупа из Рио. Подобная трагедия случилась и с армадами дона Франсиско де Толедо и дона Антонио де Окендо в тех же местах в 1625 и 1631 гг. соответственно. Несмотря на гибель судов со всеми сокровищами, материальный ущерб был восполнен, когда во Францию вернулись из плавания в Тихом океане два корабля, с выгодой реализовав свой сворованный в Рио товар. Дюге-Труэн был встречен при французском дворе как истинный герой и своими отважными действиями поднял моральный дух французов в трудное для страны время.