Таким образом, передача И-28 на испытания и их проведение задержалось на месяц. Естественно это не могло не вызвать негодования у нового руководства наркомата авиационной промышленности. 13 февраля 1940 г. состоялось заседание Коллегии НКАП, на котором первым вопросом обсудили ход заводских испытаний истребителя И-28. На заседании были заслушаны доклады директора завода №81 Н.В. Климовицкого и главного конструктора В.П. Яценко. Однако их доводы, объясняющие причины задержки летных испытаний, руководство НКАП сочло неубедительными. Самые строгие нарекания высказывались в адрес директора завода, так как в отсутствии главного конструктора он фактически не уделял внимания доводке опытной машины, а занимался в основном серийной программой - подготовкой производства ближнего бомбардировщика ББ-22 и выпуском необходимого задела.
Подводя итоги Коллегия отметила совершенно недопустимое отношение директора завода №81 к выполнению указаний ЦК ВКП(б) и решения Правительства об испытании самолета И-28. Досталось и главному конструктору. По мнению членов Коллегии, он не ставил решительно вопроса о задержке заводом испытаний его опытной машины ни в главке, ни в наркомате и не проявлял настойчивости в скорейшем выполнении задания Правительства.
Досталось также руководству 1-го ГУ НКАП. Ему требовалось решительно изжить существовавшее положение, при котором аппарат главка занимался лишь «регистрацией выявившихся на местах неполадок», вместо того, чтобы принимать своевременные меры по обеспечению всех условий ускоряющих испытания опытных машин и организовывать повседневный контроль их проведения на заводах.
С целью скорейшего завершения летных испытаний Коллегия приняла решение немедленно передать И-28 в НИИ ВВС КА, для чего заместителю начальника 1-го ГУ НКАП Германову предписывалось командировать на завод №81 начальника ЛИС завода №1 Б.А. Туржанского. Последнему совместно с начальником Инспекции по качеству при наркоме И.В. Дорониным и представителем ВВС КА требовалось определить условия отправки машины в НИИ ВВС КА. О проделанной работе требовалось доложить наркому не позднее 16:00. В свою очередь директору завода №81 предписывалось организовать отстрел и доводку пулеметов на станке.
После оценки вариантов доставки самолета в НИИ ВВС КА приняли решение о транспортировке его автотранспортом. 14 февраля истребитель в разобранном виде прибыл к месту назначения. А 18 февраля И-28 выполнил первый полет на лыжах. В течение двух месяцев машину отрабатывали и доводили как на земле, так и в воздухе. Также была предпринята попытка ее продувки в аэродинамической трубе ЦАГИ с целью определения действующих на убранные лыжи аэродинамических сил. Для этого 9 марта П.М. Стефановский перегнал самолет в Раменское, а 12 числа его подготовили для установки в трубу. Но, к сожалению, дело до продувки так и не дошло, и 21 марта истребитель вернулся на аэродром НИИ ВВС КА. Через неделю машину начали готовить для полетов на колесах. Всего на лыжах И-28 выполнил восемь полетов с налетом 3 ч 20 мин.
Между тем подписанный И апреля приказ НКАП №167, вышедший во исполнение решения Правительства от 10 апреля по вопросу «Об ускорении доводки и испытания опытных боевых самолетов, находящихся на испытаниях», предписывал проводившиеся совместные испытания И-28 считать окончательными государственными со сроком их завершения 15 мая. Директору завода №81 и главному конструктору требовалось подготовить самолет для дальнейших испытаний к 20 апреля.
Истребитель И-28 поступил на госиспытания своевременно после завершения ремонта и доводки самолета, которые начали 29 марта, обнаружив разрушение передних узлов крепления крыла к фюзеляжу. К сожалению, к их началу не удалось в полном объеме отработать ВМГ, и на самолет еще не было установлено отработанное вооружение.
На государственных испытаниях, которые завершились в установленный срок, И-28 с мотором М-88 и полетной массой 2730 кг показал максимальную скорость 439 км/ч у земли и 566 км/ч на высоте 7000 м. Правда, замер скоростей осуществляли с открытым фонарем, демонтировав подвижную створку, что естественно привело к снижению их максимальных показателей. Также истребитель проверили на пикировании до скорости 750 км/ч. Высоту 5000 м машина набирала за 6,0 мин, а 8000 м - за 10,6 мин. Практический потолок составлял 10800 м, время его набора - 28,3 мин. Дальность полета на скорости 0,9 от максимальной соответствовала 450 км. Разбег самолета на форсажном режиме без применения закрылков составил 325 м, а пробег с применением тормозов и выпущенными закрылками - 370 м. Вираж на высоте 1000 м машина выполняла за 26 с.