Свт. Николай, архиепископ Мир Ликийских, чудотворец. Чудотворный образ. В Никольском приделе собора расположена очень древняя икона святителя Николая. Во время революции 1917 годи образ охранялся государством. Есть предание, что 5 мая 1616 года на месте ныне существующего собора был построен и освещен в присутствии царя деревянный храм во имя святителя Николая. Святитель Николай почитается во всем мире. К образу святителя подходят с большой верой не только православные, но и иноверцы. Святитель и чудотворец Николай прославился великими делами благотворения. Святой является покровителем предпринимателей, путешественников и невинно осужденных.
Икона Божией Матери «Взыскание погибших».
Чтимый образ, переданный собору монахиней в 1945 году.
Икона Божией Матери «Избавление от бед страждущих».
Очень древняя и редкая икона. Празднуется 5/18 февраля.
К святыням собора в течение всего дня, и в праздничные дни, и в будни беспрерывно идут верующие не только из России, но и иностранцы.
Икона Божией Матери «Млекопитательница». В главном приделе Богоявленского собора имеется икона Божией Матери «Млекопитательница» со следующей надписью: «Сия святая икона написана и освящена на святой Афонской горе в скиту святого Пророка Илии и посылается в дар и благословение в царствующий град Москву в храм Богоявления, что на Елоховом поле. В незабвенную память 2-месячного пребывания в оном храме чудотворного образа Пресвятой Богородицы „Млекопитательницы“, принадлежащей выше сказанному скиту в бытность настоятеля архимандрита Гавриила. 1894 год».
Икона вмч. целителя Пантелеимона.
В 1996 году поистине историческим и знаменательным было пребывание в Москве честной главы святого великомученика и целителя Пантелеймона, доставленной из Свято-Пантелеимонова монастыря на Афоне. В Богоявленском соборе честные мощи святого великомученика и целителя покоились дважды – в начале и в конце их пребывания в Москве. Тысячи верующих стояли в очереди, чтобы подойти к святыне. Приводили большое количество больных, среди них были и одержимые, которые получали облегчение от тяжкого недуга.
Икона Божией Матери «Казанская»