В начале лета атмосфера при дворе Пезаро все больше ухудшается. Лукреция серьезно заболела. Неуверенность Джованни Сфорца в той роли, которую ему придется играть перед неизбежностью французского вторжения, увеличивается. Он еще больше сближается со своим дядей Людовико Моро, а Александр VI решительно склоняется на сторону неаполитанского лагеря и решает участвовать в вооруженном сопротивлении французам. В Виковаро 14 июля 1494 года он изучает план обороны, составленный Альфонсом II Неаполитанским. Это встреча военачальников: король привел 1000 всадников, папа — 500 и большое войско пехотинцев. Союзники обмениваются подарками: Александр получает золотой кубок и ценные предметы стоимостью в 4000 дукатов В течение двух дней они разрабатывают стратегию, которая позволит преградить путь врагу в Романью. Александр, ничего не знающий о сделках Джованни Сфорца и его дяди, считает, что Лукреция и Джулия находятся в безопасности в Пезаро, опорном пункте неаполитанского и папского фронта. Он советует оставаться им там в предвидении близких военных действий. Лукреция подчиняется: она больна и не может уехать из Пезаро. Но Джулию призывает ее семья. Александр с беспокойством узнает, что вместе с Адриенной де Мила 12 июля она поехала по Болсенской дороге, направляясь в Каподимонте навестить своего тяжело больного старшего брата Анджело. Анджело вскоре умер, и молодая женщина решает остаться на несколько дней вместе с матерью и братом, кардиналом Александром. Именно тогда она получает повелительные послания от своего мужа: Орсо Орсини требует, чтобы она приехала в Бассанелло. Джулия сообщает об этом папе, который приказывает ей отказаться и немедленно возвращаться в Рим. Джулия мечется между двумя приказами. Чтобы выиграть время, она пишет Святому отцу, что ей необходимо получить согласие своего супруга перед тем, как она подчинится его требованию. Александр с неудовольствием воспринимает это замечание: «Неблагодарная и коварная Джулия… Хотя мы и решили, что душа у тебя и у того, кто дает тебе советы, недобрая, мы не можем поверить, что ты поступишь так коварно и неблагодарно, хотя ты так часто клялась нам, что будешь верно нам подчиняться и никогда не приблизишься к Орсини. А теперь ты хочешь поступить наперекор и отправиться в Бассанелло, чтобы загубить свою жизнь и, конечно же, для того, чтобы снова отдаться этому жеребцу. Но мы надеемся, что ты и неблагодарная Адриенна осознаете ваше заблуждение и раскаетесь. Настоящим под угрозой отлучения и вечного проклятия мы запрещаем тебе покидать Каподимонте или Марту и тем более отправляться в Бассанелло».
И действительно, время не самое благоприятное для путешествия по дорогам Италии. Новость о переходе Карла VIII через Альпы 2 сентября подобна удару грома. Вскоре становится известно, что он пересек Миланское княжество с помощью Людовико Моро. В конце октября неаполитанская армия отступает. Постепенно она оставляет Романью. Пьетро Медичи передает королю укрепленные города, которые защищали Тоскану. В начале ноября подстрекаемая французами поднимается Пиза. Карл VIII вступает во Флоренцию. Рушится господство Медичи. Доминиканский пророк Джироламо Савонарола напоминает о своем видении меча Господня, обрушивающегося на Флоренцию: этот меч есть не что иное, как король Франции, который пришел отомстить за грехи флорентийцев. Эта смесь мистики и политики, последствия которой весьма плачевны, крайне раздражает папу Борджиа. 22 ноября Карл VIII публикует торжественный манифест, провозглашающий, что цель его экспедиции в Неаполь — подготовить разгром турецкого могущества и освободить Святые места: он требует, чтобы папа предоставил ему свободный проход по землям Святого престола. Александр VI не в состоянии дать достойного ответа. Досадный случай чуть было не поставил его вне христианского мира. Папский посланник Джорджо Бузардо только что взят в плен в Синигалье; он возвращался из Стамбула с письмами Баязида II, в которых он уверяет Рим в своей поддержке против французов. Сообщение о том, что между Наместником Христа и Наместником Магомета существует договор, вызывает огромный скандал. Джанни делла Ровере, брат кардинала Джулиано, прикарманивает 40 000 дукатов содержания Джемаля, которые везет турецкий посол, сопровождающий Бузардо. Он направляет во Флоренцию вышеназванного Бузардо и перехваченные письма, в одном из которых папе предлагают деньги — 300 000 дукатов, если он умертвит своего гостя, принца Джемаля! Возмущение тем более велико, что стало известно о намерении турецких послов заключить союз с королем Альфонсом Неаполитанским, другом и союзником папы, и оказать помощь ему в борьбе против французов. Полный моральный провал, ставший следствием этого скандала, добавляется к военному поражению. Орсини, стоящий на границах папского государства, меняет линию поведения: Вирджинио Орсини, кондотьер короля Неаполя, открывает французам свои укрепленные города Ангвиллару и Браччано.