Прошло немного времени после выступления Вашингтона, и он получил возможность сам убедиться, насколько «удовлетворительно» положение негров в США. В марте 1911 года он подвергся резкому оскорблению со стороны белого, войдя в поисках своего знакомого в один дом в Нью-Йорке. Согласно распространившимся слухам Вашингтон шел на свидание с белой женщиной. Дело приняло скандальный характер, оно разбиралось в суде, и особенно сильно ударило по Вашингтону то, что суд оправдал покушавшегося на него.
Букер Вашингтон умер в ноябре 1915 года, когда ему было около шестидесяти лет. По мнению Дюбуа, он достиг расцвета своей карьеры в период с 1899 по 1906 год, но до самой своей смерти сохранил огромный личный престиж и влияние. Вашингтон был очень сложной и противоречивой личностью, отражавшей своеобразие и сложность положения негритянской буржуазии в американском обществе, которая в силу своего классового и имущественного положения тяготеет к господствующим кругам белого населения страны, но никогда не может занять среди них равноправного положения в силу расовой дискриминации, распространяющейся на все слои цветного населения США.
Определяя роль Букера Вашингтона в негритянском движений, Дюбуа писал: «Полностью воздавая ему должное, мы все же должны возложить на душу этого человека тяжелую ответственность за окончательное лишение негров избирательного права, за упадок негритянских колледжей и государственных школ и за еще большее упрочение в нашей стране кастовой системы, основанной на цвете кожи».
На протяжении всего многолетнего периода активного участия Дюбуа в негритянском движении ему постоянно приходилось вести борьбу с консервативными и умеренными кругами, которые считали, что радикализм Дюбуа может принести только отрицательные результаты для негров. Аналогичные отношения сложились у Дюбуа и с руководством НАСПЦН, особенно резкий характер борьба между Дюбуа и большинством руководителей ассоциации носила в 1913–1915 годах.
Причина обострения отношений была все та же: Виллард как руководитель ассоциации решительно настаивал на том, что Дюбуа, являясь членом руководства и главным редактором печатного органа ассоциации, обязан подчиняться ему. Дюбуа столь же решительно отстаивал свое право на независимые действия. Дюбуа был глубоко убежден, что мелочная опека и назойливый контроль над главным редактором любого издания только сковывают его творческую инициативу и приносят непоправимый вред. А раз придя к какому-либо мнению, Дюбуа всегда отстаивал его с присущей ему энергией и упорством.
Вилларду и другим белым из руководства НАСПЦН пришлось все же согласиться на требования редактора «Крайсиса». Они не могли себе позволить потерять такого ценного работника, как Дюбуа, который лучше, чем кто-либо другой в США и тем более за их пределами, знал негритянскую проблему.
Немаловажное значение имела и финансовая сторона вопроса. НАСПЦН с самого начала испытывала серьезные финансовые затруднения, и секретарям ассоциации приходилось использовать всю свою энергию, массу времени, чтобы изыскать скромные средства, необходимые для нормального функционирования организации. И тот факт, что под руководством Дюбуа «Крайсис» быстро стал самоокупающимся и даже приносящим прибыль, имел также очень важное значение. Наконец, нельзя было не учитывать и того факта, что Дюбуа был единственным негром в составе руководства ассоциации и что он привел в ее ряды участников движения «Ниагара», которое слилось с НАСПЦН после ее образования. Выход Дюбуа из руководства ассоциации превратил бы ее в подобие объединения каких-то белых филантропов, решивших облагодетельствовать негров и бороться за их права фактически без их участия.
Все эти факторы и заставляли руководителей ассоциации терпеть пребывание Дюбуа и в руководящем органе НАСПЦН и на посту главного редактора «Крайсиса».
Круг обязанностей Дюбуа в эти годы был очень обширен. Ему всегда претила роль почетного председателя, дающего общие указания и не желающего утруждать себя каждодневной кропотливой работой. Дюбуа был образцом блестящего организатора, который умеет правильно руководить людьми и сам никогда не чурается черновой работы. Ему приходилось в «Крайсисе» вести не только огромную авторскую и редакционную работу, но и выполнять массу мелких, но всегда очень хлопотливых и трудоемких административных и хозяйственных обязанностей, отнимавших уйму времени.
Дюбуа вел также огромную лекторскую работу. Он разъезжал по всем штатам страны, пропагандируя цели и задачи НАСПЦН, рассказывая своим слушателям о негритянском движении и одновременно получая новые важные факты о положении негров, о важнейших сторонах многогранной жизни страны.