Сейчас же все зависело от легенды Суниги. Поскольку эта легенда начала быстро рассыпаться, перспектива убедить весь мир, что ещё одна группа лётчиков Кастро дезертировала из ВВС Кубы и совершила второй налёт в понедельник, в то же самое время, представлялась президенту малореальной. После некоторых размышлений Кеннеди запретил второй удар по аэродромам Кастро. Это был ключевой момент, приведший к неудаче всей операции.
Аллен Даллес был в Пуэрто-Рико, и операцией руководил Биссел. В 9 часов вечера 16 апреля, в воскресенье, Бисселу позвонил помощник президента по делам национальной безопасности Макджордж Банди. Он сообщил, что президент решил отменить налёт бомбардировщиков В-26 на авиабазы Кастро, намеченный на следующий день.
Биссел и заместитель начальника ЦРУ генерал Чарльз Кейбелл, встревоженные решением президента поспешили в госдепартамент, чтобы просить помощи у государственного секретаря Дина Раска, убеждая его, что воздушный налёт нельзя отменять, иначе у Кастро будут самолёты, в том числе – реактивные, для ударов по высаживающимся войскам. В 10 часов вечера Раск позвонил из своего кабинета в государственном департаменте президенту Кеннеди в Глен-Ора. Он доложил, что у него находятся Кейбелл и Биссел, которые настаивают, что необходимо провести воздушный налёт, согласно первоначальному плану. Президент отказал, снова подтвердив свой запрет. Кейбелл и Биссел не стали пытаться переубедить Кеннеди по телефону. В это время флот вторжения уже подходил к месту высадки:
Биссел вернулся в свой кабинет и около 11 часов вечера передал в Хэппи-Вэлли запрет президента наносить удар по авиабазам Кастро. Начался долгий обмен телеграммами между Никарагуа и Вашингтоном. В итоге было решено, что бомбардировщики должны обеспечить авиационное прикрытие участков высадки. Непосредственные руководители операции в Хэппи-Вэлли были в недоумении, чувствуя страх из-за того, что американцы пошли на попятный.
Операция в заливе Кочинос была настолько секретной, что многие высокопоставленные лица в правительстве не были посвящены в неё. Старший дежурный по ЦРУ в то воскресенье, заместитель начальника ЦРУ по информации Роберт Эмори-младший не был официально информирован об этой операции. Ничего не знал о ней и начальник управления разведки и исследований государственного департамента Роджер Хилсмен. Второй воздушный налёт был важной деталью плана. Теперь он внезапно был запрещён президентом. Начальник главного морского штаба адмирал Арли Бёрк, корабли которого находились в районе залива Кочинос, узнал об отмене второго воздушного налёта только через десять часов — в 7 часов утра в понедельник.
Рано утром 17 апреля Кейбелл вновь поехал к Раску. Несмотря на ранний час, госсекретарь снова позвонил президенту в Миддлберг. Требования Кэбелла поддерживал не только Раск, но и Макджордж Банди. Он тоже понимал, что без завоевания господства в воздухе высаживаться слишком рискованно, и пытался убедить в этом Кеннеди. На этот раз Кейбелл говорил с президентом лично. На все их аргументы в необходимости второго воздушного налёта президент снова ответил отказом.
Воздушный налёт, произошедший точно по графику, предоставленному разведкой, убедил маршала Рокоссовского и кубинское руководство, что операция развивается по плану. Также были получены сообщения от агентурной разведки и активистов Коминтерна из Пуэрто-Кабесас, что транспорты с наёмниками покинули порт. После короткого совещания с Фиделем, Раулем и Геварой, Рокоссовский скомандовал Плиеву переходить к финальной фазе подготовки.
На остров Хувентуд был заранее доставлен и замаскирован ракетный комплекс береговой обороны «Редут». Вечером 16 апреля, после наступления темноты, пусковые установки заняли заранее подготовленные позиции на побережье. Ракетные катера пришли в район залива Казонес (Cazones) к западу от места предстоящей высадки, и замаскировались в извилистых закоулках кораллового рифа, ограждающего большую мелководную лагуну Эрвидеро (Hervidero). Катера накрыли маскировочными сетями, чтобы их было сложнее обнаружить с воздуха (АИ).
Под покровом ночи артиллерия и танки кубинской армии заняли оборудованные и замаскированные позиции, с которых было удобно обстреливать районы высадки в Плайя-Ларга и Плайя-Хирон. Район высадки окружали заболоченные джунгли, поэтому для размещения огневых позиций было не так уж много удобных мест.
При маскировке позиций широко использовался советский опыт «ландшафтного дизайна» (АИ, см. гл. 05-15). Обваловки засевались травой, засаживались кустами, и т. д. скрывая позиции от обнаружения с воздуха. Все позиции были подготовлены скрытно, по ночам, ещё летом 1960 года, когда американцы ещё сами не знали, где они будут высаживаться. Фидель тогда был сильно удивлён, но ему тоже не было известно, что американцы на тот момент ещё не определились.