С вечера 16 апреля радиостанция ЦРУ на островке Большой Сисне в архипелаге Суон начала передавать шифрованное сообщение, адресованное кубинским контрреволюционерам:
«Внимание, внимание, следите внимательно за радугой. Рыба поднимется очень скоро... небо голубое... рыба красная. Следите внимательно за радугой.»
Это был сигнал для начала операции. В 1.15 минут ночи 17 апреля радиостанция начала передавать текст «бюллетеня №1». В это же время, в Пуэрто-Кабесас в Никарагуа шесть бомбардировщиков B-26 стояли на взлётной полосе, готовые к нанесению второго удара по авиационным базам Кастро: Камагуэй, Сан-Антонио-де-лос-Баньос, Кампо-Либертад, Санта-Клара, а также Манагуа, армейской базе, на которой фоторазведчик U-2 сфотографировал более сорока тяжёлых танков.
Самолёты должны были вылететь из Хэппи-Вэлли в 1 час 40 минут ночи, нанести удар перед рассветом и закончить тем самым уничтожение авиации Кастро. Лётчики бригады в самолётах В-26 ещё не знали, что президент отменил воздушный удар. Но когда наступило время вылета, а разрешения на взлёт не последовало, они поняли, что что-то неладно.
В 1 час 55 минут лётчикам сообщили, что по приказу из Вашингтона их задание отменяется. Вместо удара по авиационным базам им было приказано лететь к участкам высадки и обеспечить их прикрытие с воздуха. Разочарованные пилоты самолётов В-26 выбрались из кабин. В деревянном здании штаба был проведён новый инструктаж, так как было получено другое задание.
В 3:00 началась высадка первого эшелона. С корабля-дока «Сан Маркос» в начале вторжения на воду спустили 3 десантных катера для перевозки на берег танков, и 4 малые десантные баржи с тяжёлым вооружением и грузовиками. Из-за обилия рифов в прибрежной полосе 3 десантных судна сели на мель. В результате высадка на время задержалась. Над заливом Свиней, в чистом небе светила полная луна, и все десантные корабли были видны с берега, как на ладони.
Американцы также предприняли отвлекающий манёвр. Вертолётоносец «Боксер» с кораблями охранения занял позицию вблизи побережья провинции Пинар-дель-Рио, недалеко от основных объектов – Гаваны, порта Мариэль и ракетных позиций. Их маневры были недвусмысленны: с кораблей спускались на воду шлюпки, в них грузились морские пехотинцы. И Фидель, и Че сначала были убеждены, что атака в Заливе Свиней – отвлекающий маневр, а настоящее сражение начнется в провинции Пинар–дель–Рио.
К тому моменту в штабе Фиделя уже была разведывательная информация о том, что «правительство», сформированное из членов «Кубинского революционного совета», находится на одном из аэродромов Майами в ожидании вылета на Кубу.
Рокоссовский убеждал Фиделя, Рауля и Че, что главный удар будет на южном побережье, но Фидель не спешил бросить в Залив Свиней все свои силы. В итоге Че Гевара выехал в Пинар-дель-Рио, а Фидель, прислушавшись к доводам маршала, возглавил основные силы вблизи залива Кочинос. Камило Сьенфуэгос отправился в провинцию Ориенте, чтобы возглавить противодесантную оборону там (АИ). Рауль Кастро координировал все действия из Гаваны.
Однако вскоре стало ясно, что действия американцев носят провокационный характер. Десантные суда у Пинар-Дель-Рио оставались в нейтральных водах, ни на метр не приближаясь к кубинскому берегу.
Когда «бригада 2506» высаживалась на берег, Кастро сообщили о вторжении. Фидель приказал самолётам Т-33 и «Си Фьюри» до рассвета вылететь в район залива Кочинос.
В 4 часа утра, как раз в то время, когда генерал Кейбелл излагал в Вашингтоне свои просьбы государственному секретарю Раску, 5-я рота бригады вступила в бой с противником. Как рассказал позже на допросе участник высадки Марио Абриль:
«В 4 часа утра мы встретились с ротой милисиано Кастро. Они наступали, выкрикивая ругательства и стреляя. Нам пришлось залечь и ждать. Мы начали перекликаться с ними через болото. Мы им кричали: «Сдавайтесь!» Они отвечали, что будут бить нас. Когда они начали кричать: «Родина или смерть!», мы открыли огонь»
.В 5 часов 15 минут утра передатчик ЦРУ на острове Суон вновь начал посылать в эфир антикастровские призывы.
В Нью-Йорке сотрудники ЦРУ по телефону продиктовали Джонсу текст «бюллетеня № 2»: