Ранее, вскоре после смерти отца, Кристиан II обратился к императору Максимилиану I, предложив свою кандидатуру в качестве жениха одной из его внучек. Через несколько недель был заключен брак с младшей внучкой Изабеллой (Елизаветой). Всего через день после того, как двенадцатилетняя девочка узнала о помолвке, она номинально вышла замуж в Брюсселе, пока ее муж праздновал коронацию в Копенгагене (на бракосочетании Кристиана представлял его посланец). За пышной церемонией последовало символическое укладывание молодой невесты в постель с заместителем короля, одетым в его полный доспех, после чего последовали дни экстравагантных развлечений, турниров, балов и пиров. Будучи совсем юной, Изабелла уехала в Данию на следующий год, в конце концов прибыв в свою новую страну в июле 1515 г. после ужасного путешествия по морю, когда ее жизнь постоянно находилась в опасности. По прибытии она описала в письме к тете и опекунше, герцогине Савойской Маргарет, «бедствия» и «большие испытания», пережитые ею во время десятидневного переезда. А через некоторое время в переписке с сестрой она обстоятельно изложила жестокую реальность жизни женщин, отправленных за границу в качестве пешек в дипломатической игре:
Достаточно сложно выйти замуж за человека, лица которого ты никогда не видела, которого ты не знаешь и не любишь, и, что еще хуже, придется покинуть дом и родню и последовать за незнакомцем на край земли, даже не умея говорить на его языке [1].
Однако, когда 12 августа состоялась ее тщательно продуманная свадебная церемония и коронация, ей, несмотря на усталость, повезло больше, чем многим, поскольку ее муж был молод, очарователен и хорош собой; позже Альбрехт Дюрер назвал его «мужественным и красивым». Источники того времени также говорят о красоте и тихом нраве Изабеллы, о любви к ней датчан и всех, кто встречал ее. Хотя Кристиан II поначалу был доволен своей молодой женой, он несколькими годами ранее влюбился в юную дочь голландского купца по имени Дивеке Сигбритсдаттер (то есть дочь мещанки Сигбритты), которую встретил на рынке в Бергене. Очарованный Дивеке, король приблизил ее и ее коварную мать ко двору, и чем больше становилось их влияние, тем больше королева отодвигалась на второй план. Когда новости о поведении Кристиана достигли императора, он был потрясен и в ярости написал своему внуку, будущему Карлу V. Осуждая «постыдную жизнь» датского короля с его любовницей, он требовал, чтобы Карл сделал выговор его зятю за страдания, причиненные молодой жене. Кристиан, разъяренный этими нападками, продолжал игнорировать Изабеллу, и вместо того, чтобы прислушаться к критике, закрыл Эресунн для кораблей, прибывающих из императорских голландских провинций. Однако его уважение к Изабелле со временем росло, особенно после неожиданной смерти Дивеке в 1517 г. Если верить слухам, ее отравили. Виновного в ее убийстве впоследствии якобы нашли и казнили. Тем не менее ненавидимая людьми мать Дивеке, несмотря на смерть дочери, в течение многих лет оставалась влиятельным лицом и советником при дворе, и Изабелла с этим мирилась. В конце концов Сигбритта потеряла благосклонность короля. Согласно некоторым свидетельствам, ее сожгли заживо по обвинению в колдовстве. Изабелла к тому времени заслужила большее уважение мужа и назначалась регентом всякий раз, когда он отсутствовал в Дании, например по случаю своей кровавой коронации в Стокгольме.