Превращение Фив в независимое жреческое княжество имело своим следствием не только падение империи, но также, разумеется, и распад царства. Отныне жрецы – князья Фив. Верховные жрецы Амона либо правят всей страной, либо поддерживают независимость Фив. Так как первое им редко удавалось, то результатом было постоянное распадение и разделение, что продолжалось в более или менее выраженной форме 450 лет или более того, считая с возвышения Херихора и Несубанебдеда в конце XI столетия. Дипломатичный Херихор поддерживал фикцию соединенных Обеих Стран, владыкой которых он называл себя, как если бы он действительно ими правил. С изумительной лживостью уснащал он свою титулатуру ссылками на свое вселенское могущество и утверждал, что сирийские князья ежедневно склоняются ниц перед его мощью. К счастью, мы хорошо осведомлены из повести о злоключениях Унуамона в Доре и Библе о том, как в действительности относились сирийские царьки к Херихору. Теория и практика управления верховного жреца были не таковы, чтобы вызвать к себе уважение сирийцев. Основанное им государство было чистейшей теократией. Уже в дни Тутмоса III и Хатшепсут мы находим замечательные примеры вмешательства Амона в правительственные дела. Сам Тутмос III был коронован по повелению оракула бога, Хатшепсут по его приказанию воздвигла свои обелиски и отправила флот в Пунт. Но эти и тому подобные примеры вмешательства бога происходили в исключительных случаях. При теократическом правлении Херихора подобные оракулы стали неотъемлемой частью правительственного механизма. Все, чего верховный жрец хотел достигнуть законным путем, могло быть санкционировано в любое время специальным оракулом бога, и благодаря особому устройству священное изображение, перед лицом которого верховный жрец возвещал свою волю, неизменно подтверждало ее сильным кивком или даже словами. Все завещания и передачи имущества, исходившие от членов семейства верховного жреца, основывались на оракулах Амона, и гражданские документы стали, таким образом, божественными декретами. Политические изгнанники возвращались назад в силу оракула бога. Уголовные дела судились перед его лицом, и на основании его решений уличенные в преступлении предавались смерти. При разборе дела храмового служащего, несомненно, фаворита верховного жреца два документа были положены перед богом: один – объявляющий привлеченного к суду виновным в растрате храмовых доходов, а другой – свидетельствующий о его невиновности в этом преступлении. Бог схватил последний документ и тем возвестил невиновность обвиняемого. Жреческое плутовство, управлявшее, если нужно, наперекор закону и справедливости, давало возможность верховному жрецу сообщать божественную санкцию всему, что он желал осуществить.
Херихор был, вероятно, уже стариком при своем вступлении на престол (1090 г. до н. э.). Он ненадолго пережил Рамсеса XII, и после его смерти его сын Пианхи, также человек уже немолодой, не был в силах отстоять независимость Фив против Несубанебдеда из Таниса, который на короткое время распространил свою власть на всю страну. Манефон, не знающий ничего о независимости Фив, называет его первым царем XXI династии. За Пианхи быстро следовал его сын, Пинеджем I, и в то время, когда он правил в Фивах более или менее независимо, но без царских титулов, Несубанебдеда сменил на престоле в Танисе Псебханен I, вероятно, его сын. Хотя и неспособный вернуть себе царственное положение своего деда, Пинеджем I выказал при управлении Фиванским княжеством значительную энергию. Он продолжал постройку храма Хонсу, восстановил некоторые из древнейших храмов и, не будучи в состоянии предохранить царские тела в западных усыпальницах от дальнейших посягательств, начал переносить их в гробницу, которая могла лучше охраняться, а именно в гробницу Сети I. Затем он сделал ловкий дипломатический шаг, взяв себе в жены дочь танисского князя Псебханена I. Таким путем после смерти последнего (1067 г. до н. э.) он приобрел через жену корону Таниса и верховную власть над объединенным Египтом. Он назначил своего сына верховным жрецом в Фивы, но как он, так и его второй брат, отправлявший позднее ту же должность, вскоре умерли. Третий сын, Менхеперра, занявший вслед за ними положение верховного жреца, прибыл в 25-й год правления своего отца в Фивы, где встретил и подавил некоторое выказанное ему противодействие. Политическая сумятица эпохи обнаруживается из того факта, что он должен был немедленно появиться перед Амоном и получить оракул, разрешавший ему вернуть группу политических ссыльных, отправленных в один из оазисов. В точности неизвестно, кто были эти ссыльные, но можно подозревать, что возвращены они были в угоду фиванцам, ставшим столь же беспокойными, как в дни восстаний, которыми прославились Фивы при Птолемеях.