Университет не уступал. Тщетно Александр метал буллу за буллой против упорствующих, грозя им всевозможными наказаниями; тщетно, в конце концов, обратился он к Людовику Святому, ища поддержки светской власти. Парижское духовенство, очень довольное случаем увеличить временную непопулярность нищенствующих, громило их со всех кафедр и даже нападало на них, пуская в ход удары и угрозы; дошло до того, что монахи почти не решались выходить на улицу и выпрашивать свое дневное пропитание. Не обращая внимания на то, что Папа просил короля посадить Вильгельма в тюрьму, последний издал памфлет Depericulis novissimorum temporum, в котором он горячо излагал основания своих взглядов на нищенствующую братию. Он доказывал в нем, что Папа не имел права преступать заветы пророков и апостолов и что последние были бы уличены в заблуждениях, если бы был ниспровергнут существующий в Церкви порядок и было бы разрешено проповедовать и исповедовать бродягам-лицемерам и лжепророкам. Все, живущие нищенством, – лжецы, льстецы, клеветники, воры и враги правосудия. Всякий, утверждающий, что Иисус был нищим, отрицает, что он был Мессия; это – ересиарх, разрушающий основы всей христианской веры. Здоровый и сильный человек совершает святотатство, когда берет от бедных милостыню на свои личные нужды; если Церковь позволила это монахам, то она впала в ошибку, которую нужно скорее исправить. Епископы обязаны очистить свои епархии от этих святош; они легко могут сделать это, и если они этого не делают, то на их головы падет кровь тех, кто погибнет вследствие их небрежения.
Святой Фома Аквинат и св. Бонавентура возражали на эти ядовитые нападки. Первый в трактате Contra impugnantes religionem доказал с искусством тонкого схоластика, что братья имели право поучать, проповедовать, исповедовать и жить, не работая; он опроверг обвинения, направленные против их нравственности и их захватов, а также взгляд на них как на предтечу Антихриста. Он старался также установить, что они имели право бороться с клевещу щими на них, искать защиту в судах и даже, в случае надобности, охранять себя оружием и карать своих преследователей. Бонавентура в своем трактате De paupertate Christi утверждал, что пример Христа является решительным доказательством в пользу бедности и нищеты, а в своих Libellus apologeticus и Tractatus quia fratres minores praediceiit он воспользовался приемом противника и откровенно и энергично раскрыл недостатки, пороки, грехи, разврат и упадок белого духовенства. Еретики, видя, как крупные представители Церкви раскрывают подноготную друг о друге, могли считать и себя вправе на это, а верные имели полное основание задаваться вопросом: может ли подобное, белое или черное, духовенство привести их к спасению?
Эта словесная воина не дала положительных результатов, и разрешение кризиса пришло с другой стороны. Как только появилось сочинение Вильгельма, Людовик Святой представил экземпляры его Папе Александру; со своей стороны, университет послал в Рим депутацию с Вильгельмом во главе просить об осуждении "Вечного Евангелия". На защиту своих орденов выступили Альберт Великий и Бонавентура; возник горячий спор. "Вечное Евангелие" и "Введение" в него были осуждены с некоторыми оговорками особой комиссией, собравшейся в июле 1255 года в Ананьи; с другой стороны, булла Romanus pontifex объявила 5 октября 1256 года, что книга Вильгельма де Сент-Амура полна лжи, обмана и соблазна, что она гнусна и зла. Было приказано сжечь ее перед курией и перед университетом; все экземпляры должны были быть доставлены и уничтожены в течение недели, и всякий, кто стал бы защищать изложенное в них, приравнивался к мятежникам.
Посланные Людовиком Святым и университетом делегаты были принуждены подписаться под этим решением и признать за нищенствующими право проповедовать, исповедовать и жить милостыней на счет других. Отказался подписаться один только Вильгельм. Мало того, Александр предложил всем профессорам и проповедникам воздерживаться от нападок на нищенствующих и отказаться от обидных слов, произнесенных по их адресу, под угрозой потери, в случае неисполнения этого, своих бенефиций. Но этот последний указ исполнялся очень слабо.