Но вот дальше Октавиан, успокоивший жителей Александрии, которые в большинстве своем приветствовали его как освободителя и спасителя, дал себе волю. Британский историк Артур Вейгалл, принимавший участие в раскопках в Египте, в "Клеопатре. Последняя царица Египта" рассказывает о деяниях Октавиана следующее: удалился в свои покои, где, словно в издевку, издал приказ немедленно перебить тех придворных Клеопатры и Антония, которые не нравились Арию. Несчастный Антилл, сын Антония, выданный своим вероломным учителем Теодором Октавиану, был немедленно казнен в храме, возведенном Клеопатрой в честь Юлия Цезаря, где Антоний нашел убежище. Когда палач отрубил мальчику голову, Теодор ухитрился украсть драгоценный камень, который Антилл носил на шее, но кража была раскрыта, и Теодора доставили к Октавиану, который тотчас приказал распять его на кресте. Под стражу были взяты двое детей Клеопатры, Птолемей и Клеопатра Селена, которые все еще находились в Александрии. Октавиан, видимо, дал понять Клеопатре, что, если она попытается убить себя, он казнит ее двоих детей. Так он мог гарантировать себе, что она не станет лишать себя жизни, так как, по словам Плутарха, "перед этим аргументом ее намерение (убить себя) пошатнулось и ослабло".
Вскоре после того, как Клеопатра попала "под домашний арест" в своем мавзолее и от нее было спрятано все, при помощи чего она могла совершить цареубийство, по тайному приказу Октавиана из мавзолея были перевезены в его лагерь все ранее хранившиеся там сокровища. То есть если ранее в различных источниках упоминается, что царица взяла с собой в мавзолей сокровища (что вполне соответствует традициям древнеегипетских фараонов), то в дальнейших событиях в немногочисленном большинстве источников речь идет только о самой Клеопатре (которая пыталась дважды себя убить), но не о ее прежних сокровищах. При этом возле царицы остались его служанки, чтобы, следуя негласному распоряжению Октавиана, она дожила до его триумфа, "дабы она не отчаялась и не причинила себе вреда". Поэтому и с ее младшими детьми обращались достойно.
Клеопатре разрешили подготовить к погребению Марка Антония, предоставив для этого все необходимое: ладан, кедровое масло и корицу. На бальзамирование его тела ушло два дня, причем римляне не вмешивалась как в подготовке, так и в самой церемонии погребения. Октавиан решил продемонстрировать всем посмертное уважение к Марку Антонию, несмотря на его враждебные действия (точнее, попытки их) против Рима. Мертвый соперник, покончивший с собой и потерявший не только власть, но и друзей, ему был не страшен.
3 августа 30 года до н. э. Клеопатра в сопровождении своих верных служанок Ирады и Хармион собственноручно погребла Марка Антония. По тогдашней местной традиции женщины, потерявшие мужей, на похоронах всячески проявляли свое неутешное горе, и, судя по описаниям очевидцев, Клеопатра на стала исключением — она кричала и билась в конвульсиях, и царапала себя ногтями, и поэтому к концу похорон ее грудь воспалилась и покрылась язвами от чрезмерных проявлений скорби, упоминается также лихорадка. К тому же царица вовсе не собиралась бороться со своей болезнью, пока не получит каких-то гарантий на будущее. Поэтому она стала отказываться от пищи. Своему личному врачу Олимпу, находившемуся при ней много лет, она заявила, что так может тихо умереть без какого-либо участия римлян. По всей видимости, у Клеопатры тогда еще оставалась надежда, что Египет все-таки достанется после ее смерти детям.
Но кто-то из римлян, охранявших египетскую царицу, доложил Октавиану, что с ней творится неладное и он может потерять самый главный приз своего будущего триумфа. Чем он мог прервать эту голодовку и желание смерти? Тут показное благородство изменило Октавиану, и он "стал угрожать ей расправою с детьми", после чего Клеопатре ничего не оставалось, как начать есть и лечиться. Но взамен она потребовала личной встречи с Октавианом, ибо только он мог дать ей и детям какие-то гарантии на будущее.