Важную роль в повышении качества воспитательной работы, подчинении ее непосредственным задачам укрепления боеспособности войск в этот период сыграли новые уставы. Во все боевые уставы РККА были введены специальные главы о политической работе в боевой обстановке. Политуправлением Красной Армии были изданы специальные указания по проведению партийно-политической работы в боевых условиях: наставление Полевая служба политорганов, Временное положение о строении и работе войсковых партийных организаций в военное время и другие.
Одним из мероприятий, проведенных во время военной реформы, было сокращение штата Политического управления с 894 человек на 1 января 1922 г. до 118 человек в ноябре 1924 г. Политуправление Реввоенсовета СССР 28 марта 1924 г. было переименовано в Политическое управление РККА.
На 1 апреля 1925 г. политический состав РККА насчитывал 14 807 человек (средний – 9572, старший – 3837, высший – 1398 человек), что составляло 20,3 % общей численности начсостава и 2,9 % всего личного состава РККА.
В сентябре 1925 г. было утверждено новое Положение о Политическом управлении РККА (ПУ РККА), в котором указывалось, что политуправление, работающее на правах военного отдела ЦУ партии, является центральным директивным органом, призванным руководить всей партийно-политической работой в вооруженных силах. Согласно новому положению ПУ РККА имело в своей организационной структуре следующие отделы: организационно-распределительный, агитационно-пропагандистский, морской, мобилизационной подготовки, информационно-статистический, административно-хозяйственный и секретариат.
При Политическом управлении РККА находилась также конфликтная комиссия, секретарь которой утверждался ЦК партии. Конфликтная комиссия политуправления всю свою работу строила в тесной связи с Центральной контрольной комиссией, ее решения представлялись на утверждение Центральной контрольной комиссии.
В это же время утверждается новое Положение о Военном совете округа, флота, армии, флотилии. В состав Военного совета входил военный политработник и секретарь местного партийного комитета.
В этот период в жизни армии и флота большую роль играли военно-политические совещания, созданные еще в середине 1925 г. как постоянные совещательные органы при командовании дивизии, корпуса, округа. При Политуправлении РККА в 1925 г. было создано Центральное военно-политическое совещание как постоянный совещательный орган. Совещания рассматривали важнейшие вопросы жизни Красной Армии и Флота, представляли командованию свои рекомендации по актуальным вопросам укрепления вооруженных сил и улучшению партийно-политической работы.
В сентябре 1925 г. было утверждено и новое Положение о политуправлении округа как об органе практического руководства партийно-политической работой в пределах округа. Было утверждено также новое Положение о политотделе соединения. В этот период был также реорганизован и партийно-политический аппарат воинской части.
Принятие Положения о Политуправлении РККА, о политуправлении округа, политотделе дивизии улучшило структуру партийно-политического аппарата Красной Армии и Флота, направляло его деятельность на решение новых сложных задач, связанных с реорганизацией вооруженных сил.
Таким образом, в период проведения военной реформы вместе с перестройкой вооруженных сил была осуществлена перестройка партийных организаций и всего партийно-политического аппарата, четко были определены его место и роль в системе органов военного управления.
Одним из важнейших вопросов военной реформы было введение единоначалия в вооруженных силах. Этот вопрос встал уже в 1920 г. Приказом Реввоенсовета Республики № 117 от 23 января 1920 г. «Об учреждении единой структуры политорганов Красной Армии» единоначалие вводилось в батальонах. Должность помощника командира по политчасти в батальонах при этом отсутствовала, а политработой в полку руководили комиссар и его помощник.
В этом же приказе указывалось, что должности комиссаров сохраняются лишь в отдельных, наиболее важных штабах, управлениях, учреждениях и крупных отделах, и по усмотрению соответствующих революционных военных советов (Реввоенсоветов). Приказ № 117 вводил единоначалие и для беспартийного начальствующего состава (начсостава), сохраняя комиссаров в наиболее важных учреждениях и отделах.
Единоначалие в ряде случаев стало вводиться приказами Реввоенсоветов фронтов. Наиболее активным и последовательным сторонником его введения оставался М.В. Фрунзе. Приказом № 31 от 24 января 1920 г. войскам Туркестанского фронта за подписью М.В. Фрунзе было объявлено Положение об упразднении в частях военных комиссаров при начальниках и командирах – членах РКП(б) и назначении к ним помощников по политической работе.