Протестное отношение крестьянства к большевистской власти усилилось после объявления Советским государством хлебной монополии в Туркестанской СР 25 июня 1919 г. В ответ на данное решение на заседании Военного совета Крестьянской армии окончательно оформился разрыв с Советской властью: штаб Крестьянской армии призвал к свержению Туркестанской Советской республики. Так началось крупное крестьянское восстание в Туркестане. С Мадамин-беком был заключен новый договор о совместных действиях против большевиков. В августе в Джалал-Абаде прошло совещание лидеров басмачей и руководителей Крестьянской армии, с участием представителей Колчака. На данном совещании обсуждались конкретные планы действий антибольшевистских сил. 1 сентября 1919 г. Монстров и Мадамин-бек подписали договор об объединении своих войск (всего 20 тыс. человек), которые в сентябре пополнились прибывшими в Фергану казаками белой Семиреченской армии. В начале сентября объединенные силы Мадамин-бека и Монстрова захватили город Ош. Подойдя к городу, части Крестьянской армии запрудили арыки и залили город водой. На сторону Крестьянской армии перешли ряд командиров красных отрядов. Под их влиянием части Памирского отряда, 3 и 4 роты советского полка, стоявшие в Оше, сдались без боя. Еще ранее на сторону Мадамин-бека и Монстрова перешел гарнизон крепости Гульча. Командующий Ферганским фронтом М. В. Сафонов двинулся с отрядом на подкрепление советских войск. В Араванском ущелье он столкнулся с отрядом противника, высланным Монстровым навстречу. Понеся большие потери после трехдневного боя, отряд красных отступил, с трудом выскочив из заготовленной ловушки. 2 сентября 1919 г. РВС Ферганского фронта постановил зачислить в Красную Армию всех красногвардейцев области. Политотдел фронта опубликовал воззвание «К крестьянам Ферганы», призывавшее к борьбе с контрреволюцией.
После взятия Оша отряды Мадамин-бека и Крестьянской армии развили наступление на города Андижан, Скобелев (ныне г. Фергана) и Наманган. Основные силы Монстров и Мадамин-бек бросили на Андижан, осада которого длилась с 10 по 24 сентября. Гарнизон Андижана, состоявший в основном из бывших пленных мадьяр и китайцев, насчитывал около тысячи человек и был хорошо вооружен. Повстанцы разгромили гарнизон Андижана и овладели почти всем городом, кроме крепости. Бои затянулись, что дало возможность красным частям перебросить в Фергану необходимое подкрепление. В помощь вооруженным силам Туркестанской СР с Закаспийского фронта был направлен Казанский сводный полк, прибывший под Андижан 22 сентября. С его помощью осаждавшие город повстанцы были рассеяны, причем крестьянство разбежалось по своим селам и деревням. В бою 24 сентября 1919 г. в окрестностях Андижана погиб председатель РВС Ферганского фронта Д. И. Спасибов. Крестьянский отряд, остававшийся в городе Ош, услышав о поражении под Андижаном, разбежался. 26 сентября 1919 г. советские войска захватили город Ош, а 30 сентября – Джалал-Абад. Остатки крестьянской армии и отрядов Мадамин-бека ушли в горные районы Ферганы. Вскоре Монстров, осознав безвыходность своего положения, вступил в переговоры с представителями Советской власти о сдаче. Мадамин-бек, узнав о предательстве бывшего союзника, напал на отряд Монстрова в одном из поселков. С большим трудом Монстрову удалось бежать, 17 января 1920 г. он явился в Джалал-Абад и сдался. Вслед за ним сдались остальные руководители Крестьянской армии[325]
.В 1919—1920 гг. басмачество распространилось почти всей Средней Азии. Советским войскам приходилось бороться не только с отдельными отрядами басмачей, но и с целыми кочевыми племенами в Туркмении, Киргизии, в Фергане. Борьба с басмачеством в различных районах проходила по-разному. В феврале 1919 г. для борьбы с басмачами был образован Ферганский фронт. В сентябре в Фергану прибыла специальная комиссия из работников Мусульманского бюро компартии Туркестана. Для борьбы с басмачами были выделены 2-я Туркестанская дивизия, три кавалерийских полка и др. части, насчитывавшие 4,5 тыс. штыков и сабель. В январе – марте 1920 г. советскими объединенными войсками был проведен ряд операций по разгрому отрядов Иргаша, Курширмата и др. ЦИК Туркестана объявил амнистию басмачам, которые сложат оружие. 31 января сдались свыше 5 тыс. человек из отрядов Махкам-ходжи, Акбар-али и Парпи. В феврале 2-я Туркестанская дивизия нанесла поражение отрядам Мадамин-бека, а в начале марта его главные силы были окружены. В результате переговоров с представителями Красной Армии Мадамин-беком 6 марта было заключено соглашение, по которому он признал Советскую власть, а часть его отрядов влилась в состав РККА. Так, отряд численностью 1 200 человек включался в состав советских войск как Тюркская советская бригада.