Подстрекаемые прессой, антимасоны решили пойти во власть. Осенью 1827 году были проведены съезды по выдвижению кандидатур антимасонских кандидатов в Законодательное собрание штата Нью-Йорк. Центральным элементом программы был запрет на какие-либо внесудебные клятвы. В августе 1828 года антимасоны выдвинули кандидата в губернаторы. Первый национальный антимасонский съезд был проведен в Филадельфии в 1830 году, в четвертую годовщину похищения Моргана. В 1832 году Уильям Вирт, бывший масон, баллотировался в президенты по антимасонскому списку. В следующем году бывший президент Джон Куинси Адамс был антимасонским кандидатом на пост губернатора Массачусетса. Законы, запрещающие внесудебную присягу, приняли три штата — Вермонт, Массачусетс и Род-Айленд.
Усиливали политическую напряженность взаимное запугивание и насилие. В Род-Айленде в 1831 году вооруженная толпа масонов изгнала антимасонского активиста из Провиденса и преследовала его до самого Массачусетса. В следующем году в Бостоне антимасонская толпа осквернила новый храм и попыталась поджечь его.
Антимасонская партия имела реальные рычаги политического влияния, ведь в те времена начинали создаваться национальные партийные организации, а государственные политические фракции часто занимались своими проблемами. Резонанс был большой хотя бы потому, что крупнейший государственный деятель той эпохи, президент Эндрю Джексон, был бывшим Великим мастером Великой ложи Теннесси. Его же соперник на президентских выборах 1832 года, Генри Клэй, был бывшим Великим мастером в Кентукки.
Однако, как уже говорилось, политическое влияние антимасонства было недолговечным. Его слабость проявилась в президентской кампании Уильяма Вирта в 1832 году. Джексон с легкостью занял первое место, в то время как Вирт стал третьим. За него проголосовал только оплот антимасонства — Вермонт. В движении было много внутренних противоречий: с одной стороны, там были идеалисты-одиночки, которые были убеждены, что вся система управляется масонами, с другой — политические реалисты, которые пытались прийти к приемлемому компромиссу. Но дело было в том, что антимасонство уже казалось излишним: его смертельный враг угасал сам по себе.
Сначала масонство рухнуло в штате Нью-Йорк. Братья уходили в отставку толпами. Триумфальная церемония в Локпорте в 1825 году казалась теперь событием из другой эпохи. В то время в Нью-Йорке было 480 лож примерно с 20 тысячами членов. К 1832 году оставалось всего 82 ложи и едва ли 3 тысячи членов. В Локпорте одна из последних лож была вынуждена собираться тайно, на чердаке.
С конца 1820-х до середины 1830-х годов членов лож стало меньше на две трети по всей стране. В Филадельфии, где Бенджамин Франклин задал импульс раннему масонству, Великая ложа Пенсильвании была вынуждена продать свою штаб-квартиру. Как один человек заметил в 1832 году о возрождении франкмасонства, «с равным успехом они могли надеяться установить в этой просвещенной стране магометанство». Церемонии закладки краеугольных камней прекратились.
По делу Моргана мнения разделены и по сей день. Профессиональные историки, не симпатизирующие масонству, склонны опираться на отчеты того времени: какими бы экзальтированным ни были противники масонов, по их мнению, не вызывает сомнений испорченность франкмасонства самых западных округов штата Нью-Йорк. Современные масонские историки склонны повторять то же, что сказали их нью-йоркские братья после похищения: они рассматривают все дело как классический пример антимасонства и предпочитают верить в то, что Морган сделал из своего исчезновения рекламный трюк. Самый сильный аргумент масонов возвращает нас к фундаментальному вопросу о тайне братства. Масонская тайна, якобы основополагающая для масонского ритуала, на самом деле не более чем театральная выдумка. И вряд ли кто-то будет за эти «тайны» убивать.
Ответ на загадку исчезновения Уильяма Моргана кроется в ложах Королевской арки на западе штата Нью-Йорк, например в Локпорте, к которой принадлежали и Хайрам Хопкинс, и шериф Эли Брюс. Оба осужденных или обвиненных в причастности к заговору были масонами Королевской арки.
Красочные описания возмездия для тех, кто выдаст тайны, были частью ритуала степени Королевской арки: предателю отсекут половину головы, а его мозг оставят под палящими лучами солнца. Но что больше всего обеспокоило общественное мнение во время дела Моргана, так это обещания, которые должны были дать недавно инициированные масоны Королевской арки — по крайней мере, согласно описаниям церемонии, опубликованным отреченными братьями. Наиболее тревожным обязательством было следующее: