В 1990 г. под давлением массовых выступлений и вооруженной борьбы, возглавляемой ННК и Объединенным левым фронтом в составе семи коммунистических группировок, была принята новая конституция, согласно которой Непал объявлялся конституционной индусской монархией, принцип секуляризма был отвергнут. Несмотря на то что индусы составляют абсолютное большинство населения страны (89%), в стране проживают также последователи буддизма, ислама и различных местных культов. В 1991 г. состоялись парламентские выборы, на которых ННК одержал убедительную победу.
Выборы 1994 г. принесли победу Объединенной коммунистической партии Непала (КПН-ОМЛ), правительство которой находилось у власти до сентября 1995 г., когда ему был вынесен вотум недоверия. Дальнейшая политическая активность в условиях отсутствия консенсуса между политическими партиями страны выражалась в создании недолговечных искусственных по составу коалиций вокруг двух основных партий.
Коммунистическая партия (объединенная марксистско-ленинская) раскололась: в 1998 г. из нее выделилась новая организация — Коммунистическая партия Непала (марксистско-ленинская) и призвала к созданию революционного движения, направленного на установление в стране республиканского строя.
Другая ультралевая партия — Коммунистическая партия Непала (маоистская) — к этому времени широко развернула вооруженную борьбу за переустройство непальского общества, называемую ее лидерами «народной войной». Она сопровождалась бесчисленными актами насилия, грабежами, поджогами, убийствами и стала угрозой для безопасности и стабильности в стране. Нестабильность особенно усилилась после 2001 г., когда наследный принц Дипендра расстрелял всю королевскую семью, в том числе короля Бирендру, и застрелился сам. 28 мая 2008 г. Учредительное Собрание Непала почти единогласно провозгласило Непал Федеративной Демократической Республикой.
Политическое развитие Непала обнаруживает две противостоящие тенденции: ориентацию на политические процессы в Индии и усвоение ее опыта, с одной стороны, и противодействие мощному соседу — с другой. В целях расширения внешнеполитических связей Непал начал активный диалог с Китаем, что привело к ухудшению отношений между непальской и индийской сторонами в периоды обострения индийско-китайских противоречий.
Непальские правительства развивали торговлю с другими странами во избежание экономической зависимости от Индии. Особо сильно ударил по непальской экономике индийско-непальский конфликт 1989 г., когда срок действия Договора о торговле и транзите не был продлен и у непальской стороны, объявившей действия Индии экономической блокадой, возникли сложности с транспортировкой товаров.
Серьезной проблемой, осложняющей отношения Непала и Индии, является проблема политических беженцев из Бутана, выступавших под лозунгами демократизации своего королевства и создания в нем партийной системы. Конфликтная ситуация, возникшая между Непалом и Бутаном, по мнению непальских политиков, не может быть решена без участия Индии, с которой Бутан имеет Договор о дружбе, заключенный после провозглашения независимости Индии и фактически закрепивший переход контроля над внешними сношениями Бутана, осуществлявшегося англичанами, к Индии.
По договору между Индией и Бутаном от 8 августа 1949 г. Бутан согласился руководствоваться советами правительства Индии в вопросах внешней политики. Королевство Бутан, основанное на установлениях буддизма ламаистского толка, сохранило черты, свойственные традиционной теократии далай-ламы Тибета: ламские монастыри являлись законодателями политических веяний в стране. В 1953 г. в Бутане была создана партия Бутанский национальный конгресс (БНК), выступавшая с требованием создания партийной демократии в стране, однако ее деятельность была запрещена королем. Бутан является отсталой аграрной страной с преобладанием натурального хозяйства и архаичных социальных отношений.
По принятой ООН классификации, Бутан отнесен к числу экономически наименее развитых стран мира. В 1961 г. было начато осуществление первого пятилетнего плана, финансируемого Индией. Реформы вызвали ожесточенное сопротивление крупных землевладельческих кланов и части ламства.