Для того чтобы пробить путь из Минска на юг, 2 июля командование 9-й армии отдало приказ танковой дивизии, развернутой в районе Марьиной Горки, нанести удар на Столбцы. Кроме того, штаб армии безуспешно попытался сформировать из отставших от своих подразделений солдат войсковую группу для обороны Минска. Но отставшие солдаты и офицеры исчезали быстрее, чем их удавалось собрать вместе. С севера к Минску подходили войска советской 5-й гвардейской танковой армии. В кольце окружения оказались и некоторые немецкие части, которым удалось вырваться из котла в районе Бобруйска. Часть из них теперь пыталась проследовать через Минск на Молодечно по железной дороге. Большинство же, еле передвигая ноги, по жаре и пыли брело в сторону Столбцов в пешем порядке. Все части 4-й армии, кроме арьергардов, переправились через Березину, однако ее передовые части были остановлены восточнее Минска. Днем штаб 4-й армии отправился в Молодечно для того, чтобы попытаться удержать проходивший там участок железной дороги. Танковой дивизии из состава 9-й армии не удалось пробиться в Столбцы, куда советские войска вошли еще утром. Но некоторым частям удалось переправиться через Неман ниже по течению и вырваться из окружения.
На следующий день войска К.К. Рокоссовского и И.Д. Черняховского заняли Минск. 9-я армия снова безуспешно попыталась организовать переправу в районе Столбцов. 4 июля русские начали наступление на Барановичи, что заставило командование 9-й армии сосредоточить усилия на этом направлении. После этого пробиться из окружения удалось лишь отдельным солдатам и небольшим группам, которым, иногда с помощью польских крестьян, удавалось найти дорогу через Налибокскую пущу.
За 12 дней боев группа армий «Центр» лишилась 25 дивизий. Из имевшихся в ее составе 165 тыс. солдат и офицеров 4-я армия потеряла 130 тыс. (только в котле к востоку от Минска было окружено 105 тыс., 70 тыс. из которых было убито, 35 тыс. пленено. – Ред.), 3-я танковая армия потеряла 10 дивизий. 9-я армия избегала окружения достаточно долго для того, чтобы из него удалось ускользнуть нескольким тысячам, возможно, 10–15 тыс. солдатам и офицерам. К тому времени, когда штаб 9-й армии вышел к Барановичам, у него не осталось достаточно людей и аппаратуры связи для того, чтобы организовать командование дивизиями, направленными на север из
2-й армии. После попытки в течение нескольких дней организовать командование через радиосеть 2-й армии штаб был выведен в тыл для реорганизации.
К 1 июля В. Модель был уверен, что самым дальним рубежом на востоке, где ему удастся организовать оборону, будет рубеж между Барановичами и Молодечно. Он возлагал некоторые надежды на то, что удастся использовать для обороны часть полевых укреплений и траншей, сохранившихся со времен Первой мировой войны, но все равно обратился к Гитлеру с просьбой перебросить для обороны Молодечно несколько дивизий из группы армий «Север». Наибольшее беспокойство вызывал левый фланг немецкой обороны. Между северным флангом оборонительного рубежа, который волевым решением Гитлера должен был проходить в районе Полоцка, и левым флангом обороны 3-й танковой армии в районе Минска зияла брешь шириной 80 км. Почти такая же брешь отделяла правый фланг
3-й танковой армии от короткого оборонительного рубежа, организованного 4-й армией в районе Молодечно. В любой момент по желанию русских 3-я танковая армия могла быть без особого труда окружена или просто уничтожена, после чего перед противником открывался бы путь на Ригу и к побережью Балтийского моря.
Несмотря на то что В. Модель назвал это «бесполезным экспериментом», Гитлер продолжал настаивать на том, чтобы группа армий «Север» удерживала Полоцк и ударом на юго-запад восстановила контакт с 3-й танковой армией. Командующий группой армий «Север» Г. Линдеман докладывал, что при том условии, что войска будут продолжать на фланге оборонять Полоцк, в его распоряжении остается всего две дивизии, чего явно недостаточно для организации наступления. Когда 3 июля Г. Линдеман получил разрешение значительно отступить в районе Полоцка, он продолжал настаивать на том, что его войска не смогут атаковать, Гитлер сместил его и назначил на его место генерала Й. Фриснера.