За окном послышался шум от автомобильного мотора. Это был пущен в ход мотор четырехтонного грузовика «фиат», приготовленного для перевозки тел. Расстрел под шум работающего мотора грузовика, чтобы заглушить выстрелы, был излюбленным приемом чекистов. Этот способ был применен и здесь.
Был 1 час 15 минут ночи, считая по солнечному времени, или 3 часа 15 минут по летнему времени, которое большевики перевели на два часа вперед, когда Юровский вернулся в комнату в сопровождении всей команды палачей. Он направился к государю. Никулин встал ближе к окну, напротив государыни. По другую сторону, лицом к доктору Боткину, находился Горват. Другие стояли по обе стороны от двери. Медведев остался на пороге.
Подойдя к государю, Юровский сказал несколько слов, объявив о предстоящем расстреле. Это было настолько неожиданно, что государь, по-видимому, не сразу понял смысл сказанного. Он привстал со стула и изумленно переспросил: «Что? Что?» Государыня и одна из великих княжон успели перекреститься. В этот момент Юровский поднял револьвер и несколько раз выстрелил в упор сначала в государя и затем в наследника. Почти одновременно начали стрелять и другие.
Великие княжны, стоявшие во втором ряду, видели, как упали их родители, и в ужасе стали кричать. Им суждено было пережить их на несколько страшных мгновений. Расстреливаемые падали один за другим. В течение двух-трех минут было сделано около семидесяти выстрелов. Для большинства мучеников смерть была почти моментальной. Наследник слабо стонал. Юровский прикончил его двумя выстрелами в голову. Великая княжна Анастасия Николаевна оказалась только ранена. Она была зверски добита штыками и прикладами. Анна Демидова, защищаясь от пуль подушками, металась вдоль задней стены из стороны в сторону, пока не упала под ударами штыков. Некоторых из жертв достреливали и докалывали, прежде чем все стихло.
Сквозь голубоватый туман, наполнявшей комнату от множества выстрелов, при слабом освещении одной электрической лампочки, картина убийства представляла ужасающее зрелище.
Комната в доме Ипатьева, где были убиты государь, его семья и лица, разделявшие с ней заключение
Государь упал вперед, близко от государыни. Рядом лежал на спине наследник. Великие княжны лежали вместе, как будто они держали друг друга за руки. Между ними распластался труп маленькой Джимми с проломленным черепом, которую великая княжна Анастасия Николаевна прижимала к себе до последнего момента. Доктор Боткин сделал шаг вперед, прежде чем упасть головой вперед, с поднятой правой рукой. Анна Демидова и Алексей Трупп упали около задней стены. У ног великих княжон лицом вверх лежал Иван Харитонов. У всех убиенных было по несколько ран в разных местах тела, и поэтому крови было особенно много. Она заливала их лица и одежду, стояла лужами на полу и брызгами и пятнами покрывала стены. Казалось, что вся комната залита кровью.
К этому времени в «Дом особого назначения» прибыли Шая Голощекин, Белобородов, Мебиус и Войков. Юровский с Войковым занялись тщательным осмотром убитых. Они переворачивали всех на спину, чтобы удостовериться, не осталось ли еще признаков жизни. При этом они снимали со своих жертв драгоценности: кольца, браслеты, золотые часы. Затем тела были завернуты в заранее приготовленное шинельное сукно и перенесены на носилках, сделанных из двух оглоблей и простыней, на грузовой автомобиль, стоявший у подъезда. За рулем сидел злоказовский рабочий Люханов. С ним вместе сели Юровский, Ермаков и Ваганов.
Под покровом ночи грузовик отъехал от дома Ипатьева, спустился по Вознесенскому проспекту в сторону Главного проспекта и выехал из города через предместье Верх-Исетск. Здесь он свернул на единственную дорогу, ведущую в деревню Коптяки, раскинувшуюся на берегу Исетского озера. Дорога туда идет лесом, пересекая Пермскую и Тагильскую железнодорожные линии. Уже рассветало, когда верстах в пятнадцати от Екатеринбурга и не доезжая четырех верст до Коптяков, в глухом лесу, в урочище Четырех Братьев, грузовик свернул налево от коптяковской дороги и достиг небольшой лесной поляны близ ряда заброшенных рудниковых шахт, называемых Ганина Яма. Здесь тела царственных мучеников были выгружены, разрублены на части, облиты бензином и положены на два больших костра. Кости уничтожались при помощи серной кислоты. Три дня и две ночи убийцы, которым помогали 15 ответственных партийных коммунистов, специально мобилизованных для этой цели, творили свою дьявольскую работу под непосредственным руководством Юровского, по указаниям Войкова и под наблюдением Голощекина и Белобородова, несколько раз приезжавших из Екатеринбурга в лес.
Наконец к вечеру 6/19 июля все было кончено. Убийцы старательно уничтожили следы костров. Пепел и все то, что осталось от сожженных тел, бросили в шахту, которая была затем взорвана ручными гранатами, а наверху на площадке у шахты перекопали землю и забросали ее листьями и мхом, чтобы ничто не могло указать на совершенное здесь преступление.
Карта окрестностей Екатеринбурга. Крестом обозначена Ганина Яма