Во всех организациях ОУН бандеровцев после разгрома УПА была проведена «чистка» от лиц, которых оуновцы считали ненадежными и малоустойчивыми. Из захваченных органами государственном безопасности отчетов видно, что в целом ряде районов во время «чистки» самими главарями уничтожено по 200–300 рядовых участников банд и оуновских организаций. Уничтожались участники банд и подполья, заподозренные в связях с органами государственной безопасности, а для этот достаточно было кому-либо из них без ведома организации появиться в райцентре.
Уничтожались также участники, вызывавшие сомнение в смысле их устойчивости и преданности подполью. Главарям ОУН было предложено удалить из организации всех членов, бежавших из-под стражи и освобожденных из-под ареста, демобилизованных из Советской Армии, освобожденных по броне от мобилизации, бежавших из мест спецпоселений и т. д. В виде исключения разрешалось оставлять только тех из них, которые практической вражеской работой доказали свою преданность ОУН.
Основной смысл перестройки бандеровского подполья заключался в том, чтобы в целях продолжения вражеской деятельности против Советского государства сконцентрировать все людские ресурсы ОУН в руках главарей «Тереховых», т. е. территориальных организаций, и через них принять решительные меры к усилению конспирации и ограждению организаций от провала.
После разгрома УПА и перестройки бандеровцами своего подполья бандеровская организация украинских националистов в западных областях Украины представляла собой широко разветвленную сеть сельских, кустовых, районных, надрайонных, окружных и краевых организаций. Сельские и районные организации ОУН, как правило, были построены в соответствии с административно-территориальным делением Украины. Кустовые, надрайонные, окружные и краевые организации ОУН размещались. без всякой связи с существующим территориальным делением. Руководящие звенья оуновского подполья нередко укрывались на стыках районов и областей, т. е. в таких местах, где появление чекистско-войсковых групп, обычно действующих в пределах определенного района или области, менее вероятно.
Структура бандеровского подполья в первые годы после освобождения территории Украины от немецко-фашистских захватчиков. После бегства оуновских главарей в 1944 году за границу, на территории западных областей Украины был создан центральный «провод» ОУН бандеровцев, в составе которого имелись следующие референтуры (отделы): организационная, так называемая «Служба безопасности» (СБ), пропаганды, военная, «учебно-воспитательная» и финансово-хозяйственная.
В бандеровской организации украинских националистов до 1945 года существовали на правах референтур также женская и молодежная секции и гак называемый «Украинский красный крест». Женская и молодежная секции действовали недолго и в связи с ликвидацией УПА были упразднены. Был ликвидирован также и «Украинский красный крест», который составлял специальное звено в оуновской организации.
Главарем центрального «провода» ОУН бандеровцев в западных областях Украины был Шухевич. Одновременно он являлся одним из членов зарубежного центрального «провода» ОУН бандеровцев в Мюнхене и председателем «генерального секретариата» УГВР. В марте 1950 года в одном из сел, недалеко от гор. Львова, Шухевич был обнаружен оперативными работниками и при попытке к бегству убит.