Первой получила «амнистию» Луизиана. Когда бóльшая часть ее территории была занята и 10 % белого населения принесли присягу на верность США, президент разрешил проведение в штате выборов. Луизианские представители первыми из штатов юга появились в Конгрессе. Они, однако, приняты не были. Большинство депутатов проголосовало за то, что Луизиана возвратит себе права штата только после того, как присягу принесет большинство населения.
Разумеется, наиболее радикальным мероприятием первого, вступительного этапа реконструкции являлось освобождение рабов. Прокламация Линкольна на этот счет законодательным документом не являлась и носила временный характер. В связи с этим для закрепления нового статуса черного населения и в целом характера государства Линкольн внес в Конгресс проект 13-й поправки к Конституции, которая гласила: «В Соединенных Штатах или в каком-либо месте, подчиненном их юрисдикции, не должно существовать ни рабства, ни подневольного услужения, кроме тех случаев, когда это является наказанием за преступление, за которое лицо было надлежащим образом осуждено».
Поправка была утверждена Конгрессом 31 января 1865 г., то есть в тот промежуток, когда Линкольн одновременно являлся действовавшим и избранным на новый срок президентом. Она была ратифицирована 27 штатами — необходимым количеством для ее вступления в силу, к началу декабря того же года и стала составной частью Конституции. Любопытно, что ратификация ее остальными штатами затянулась более чем на полтора столетия. В Кентукки ратификация прошла в 1976 г., в Миссисипи — в 1995-м. При этом руководство Миссисипи по неизвестным причинам не позаботилось о направлении соответствующего документа в Федеральный реестр США. И только в феврале 2013 г. начавшийся быстро и затянувшийся на долгие годы процесс юридического оформления 13-й поправки завершился, когда офис Федерального реестра США официально сообщил о получении законно оформленного документа штата Миссисипи.
Процесс реконструкции продолжался. В марте 1865 г. по распоряжению Линкольна федеральные власти начали образовывать бюро помощи освобожденным рабам и беженцам. Эти органы помогали в получении жилища и одежды, подыскивали работу, выделяли конфискованные у рабовладельцев-повстанцев земли для сдачи в аренду, а затем и в собственность освобожденным.
Наиболее радикальные республиканцы и бывшие аболиционисты требовали лишить всех бывших граждан Конфедерации, не доказавших свою оппозиционность к ней, избирательных прав сроком на пять лет. Линкольн выступил против столь кардинальной меры, полагая, что она явно будет способствовать произволу, сведению личных счетов. Уже 8 декабря 1864 г. он опубликовал прокламацию об амнистии, которой объявлялось помилование и предоставление гражданских прав тем взрослым белым жителям штатов Конфедерации, которые не участвовали в работе госучреждений, не обращались жестоко с пленными, а затем принесли клятву на верность Союзу. В результате решением Конгресса избирательного права были лишены только военные и гражданские лидеры Конфедерации, в центре и на местах. Всего этому наказанию, не очень суровому, но унизительному, было подвергнуто от 10 до 15 тыс. человек.
Перед президентом стоял нелегкий вопрос о предоставлении избирательного права освобожденным рабам. Таковых всего насчитывалось около 4 млн человек. Наделение их правом голоса явно усилило бы позиции юга в Конгрессе США и при выборах президента. Если учесть, что подавляющее большинство бывших рабов были безграмотными, не разбирались в политике, находились в той или иной степени в наследственно сложившейся, привычной зависимости от бывших владельцев, это могло привести к неожиданным и нежелательным с точки зрения республиканцев и их лидера последствиям.
Линкольн не торопился с решением вопроса о предоставлении черным избирательного права. Он стоял на той позиции, что делать это следует лишь в перспективе, сроки которой не определялись. Он говорил, что избирательное право надо предоставлять не всем цветным сразу, а сперва только ветеранам войны и «наиболее разумным» в гражданском смысле. Именно в таком духе он выступил 11 апреля 1865 г., за три дня до покушения на него. При его жизни вопрос так и не получил разрешения. В проблеме избирательного права Авраам Линкольн, в противовес республиканским радикалам и различным левым группам, проявил разумную осторожность, отлично понимая, что безграмотный человек в политике совершенно не разбирается, что он легко может стать безвольным элементом толпы, манипулируемой правящими или оппозиционными политиканами, преследующими свои, зачастую далекие от общечеловеческих ценностей цели. Линкольн понимал и фактически передал соответствующий завет потомкам, что, прежде чем доверять безграмотным влияние на государственные дела, этих людей необходимо просветить.