Смерть Лжедмитрия II имела огромное значение для дальнейшего развития событий. Движение, направленное против поляков и русских изменников, смогло освободиться от авантюристического элемента, связанного с личностью самозваного претендента. Теперь основным лозунгом противников польского владычества стало изгнание иноземцев из Москвы и созыв Земского собора для выборов нового законного царя. Лица, ранее поддерживавшие поляков из страха перед самозванцем, теперь стали переходить на сторону их противников. Вместе с тем анархические элементы потеряли свою главную опору; лишившись идеи поддержки «законного царя», они превратились в обыкновенных разбойников. Сын Марины Мнишек и Лжедмитрия II Иван, получивший в Москве прозвище «Воренок», был слишком мал, чтобы стать вождем движения. Согласно «Новому летописцу», сторонники самозванца в Калуге отказались присягнуть королевичу Владиславу и объявили, что примут присягу тому царю, который «будет на Московском государстве».
В городах (Рязани, Калуге, Владимире, Суздале, Ярославле, Костроме, Нижнем Новгороде и других) стало формироваться освободительное движение, которое принято называть Первым ополчением. В масштабах всей страны такое движение рождалось впервые. Историк Я.В. Леонтьев считает, что с масштабами формирования Первого ополчения вполне сравнима самоорганизация и организация северного ополчения князя М.В. Скопина-Шуйского, и, таким образом, Первое ополчение должно иметь иное наименование — Второе, а Нижегородское ополчение Минина и Пожарского следует именовать Третьим, а не Вторым. Эта точка зрения имеет свою аргументацию, но разделяется не всеми историками. Вне зависимости оттого, насколько сходны или различны ополчения Скопина-Шуйского и Первое ополчение П.П. Ляпунова и его сподвижников, следует отметить, что Первое (согласно традиционной терминологии) ополчение поднималось без какого-то либо участия царской власти. Ранее служилые люди шли в походы тогда, когда их призывал государь. Волею царя был послан в Новгород и Скопин-Шуйский, где он уже застал поднимающуюся волну противостояния тушинцам. После низложения Василия Шуйского, когда царский престол в Москве опустел, на борьбу с иноземцами, хозяйничавшими в Москве, патриоты поднялись самостоятельно. Испытав многочисленные бедствия от междоусобной войны и вражеских нашествий, люди пришли к идее объединения против захватчиков, разорявших страну под знаменами самозванцев и нового государя — «королевича Владислава». Главной политической идеей Первого, а затем и Второго ополчений было прекращение споров и вражды, совместная борьба с польско-литовским нашествием и избрание законного государя волей всего государства, «всей земли». Первому ополчению не удалось исполнить этой миссии, но его пример был очень важен как попытка народа объединиться ради восстановления государственного порядка. Нельзя также забывать и о том, что Первое ополчение, испытав внутренний кризис, не распалось окончательно, и наиболее организованные его части под командованием князя ДТ. Трубецкого принимали участие в освобождении Москвы от польско-литовских захватчиков.
Организацию Первого ополчения возглавил воевода думный дворянин Прокопий Петрович Ляпунов, имя которого не раз упоминалось ранее. Один из видных вождей болотниковского движения, Ляпунов был неформальным лидером мощной корпорации рязанских дворян и детей боярских. Во время декабрьских боев под Москвой Ляпунов перешел на сторону Василия Шуйского и до 1610 г. твердо поддерживал царя и боролся с шайками тушинцев и поляками. Во время наивысших успехов князя М.В. Скопина-Шуйского Ляпунов начал интриговать с тем, чтобы на престоле оказался этот молодой воевода. Князь Михаил Васильевич в гневе отказал Ляпунову, однако об этот донесли царю Василию, и, возможно, этот донос решил судьбу победоносного воеводы. После смерти князя Скопина-Шуйского Ляпунов выступил против царя Василия и поддержал планы его низвержения, которое и было осуществлено заговорщиками во главе с братом Ляпунова Захарием. После вступления польско-литовского гарнизона в Москву и последовавшей за этим смерти самозванца Ляпунов встал во главе освободительного движения.
Организация ополчения началась в Рязани, к которой вскоре присоединился и Нижний Новгород, на протяжении Смуты последовательно стоявший против различных «воров». По городам шла активная переписка, местные «миры» объединялись под началом городовых воевод, не признававших «королевича Владислава». География участников Первого ополчения весьма широка — Рязань, Калуга, Тула, Коломна, Михайлов, Шацк, Муром, Нижний Новгород, Владимир, Суздаль, Ярославль, Ростов, Устюг, Вологда, Кострома, Романов, Галич.