Весь объем перестроченных работ по приспособлению переданных Военному ведомству домов успешно завершили в 1898 году. Здания торжественно освятили и отметили окончание строительства. Среди радостных праздничных поздравлений в тот день неоднократно звучало искреннее уверенное пожелание: «Многия лета!» К сожалению, Военное министерство России просуществовало в этих зданиях недолго – всего 19 лет, наполненных огорчениями, народными волнениями, поражением в Русско-японской и Первой мировой войнах и государственными переворотами в феврале и октябре 1917 года. За 19 лет в этих домах на Мойке чередой сменилось семь военных министров-генералов, одновременно являвшихся членами Государственного совета великой Российской империи. Подобная кадровая чехарда удивляла многих в годы царствования последнего главы дома Романовых – императора Николая Александровича. По повелению Николая II в один из труднейших периодов российской истории началась непонятная для всех вереница назначений и смещений в короткие сроки опытных заслуженных генералов на самом ответственном тогда государственном посту – военного министра.
Первым из семи министров-генералов, поселившихся на Мойке в домах № 67–69, стал Алексей Николаевич Куропаткин, состоявший в должности военного министра в 1898–1904 годах. За время своего управления Военным министерством генерал Куропаткин пытался улучшить командный состав русской армии, условия службы и быта офицеров и даже ввел новые правила чинопроизводства. Он разработал положение к поднятию общего уровня образования офицерского корпуса, ввел изменения в программу положения Академии Генерального штаба и коренным образом перестроил ее штат.
Генерал пытался поднять нравственный уровень солдат, отменил телесные наказания и улучшил казарменное положение рядовых. А. Н. Куропаткин потребовал увеличения комплекса мероприятий по готовности войск к военным действиям. Преобразовал штабы военных округов по образцу западных пограничных военных округов и упразднил особые финские войска, кроме Гвардейского финского батальона, входившего в состав Гвардейской стрелковой бригады. При нем артиллерийские части перевооружили ручным огнестрельным оружием и 76-мм скорострельными пушками и были оперативно сформированы первые пулеметные роты. В казачьих войсках по инициативе министра было улучшено материальное положение офицеров и поднято благосостояние рядовых казаков. Перед Русско-японской войной А. Н. Куропаткин был отстранен от должности военного министра и направлен в качестве главнокомандующего всеми сухопутными и морскими вооруженными силами, действующими против Японии, исполняя эту должность с октября 1904 по 3 марта 1905 года. После поражения русских войск при Мукдене генерала Куропаткина отстранили от должности главнокомандующего русскими вооруженными силами.
Во время Первой мировой войны генерал А. Н. Куропаткин командовал Гренадерским корпусом, в 1916 году – 5-й армией Северного фронта, а затем и всем Северным фронтом. С 22 июля 1916 года его назначают туркестанским генерал-губернатором и командующим Туркестанским военным округом.
После Февральской революции права Куропаткина как командующего войсками подтвердил телеграммой военный министр Временного правительства Гучков. После Октябрьской революции Алексей Николаевич преподавал в сельской школе и заведовал волостной библиотекой в селе Шешурино Тверской области.
В 1904–1905 годах преемником А. Н. Куропаткина на посту военного министра Российской империи становится генерал Виктор Викторович Сахаров. Однако, не прослужив и одного года, Сахаров был отставлен от этой должности и направлен императором Николаем II в командировку для подавления аграрных беспорядков в Саратовской губернии. 22 ноября 1905 года генерал Сахаров был застрелен эсеровской террористкой Биценко в Саратове, в доме губернатора П. А. Столыпина, будущего министра внутренних дел и с 1906 года председателя российского Совета министров.
Его преемником в июне 1905 года назначается российский военный деятель, генерал, участник Русско-турецкой войны 1877–1878 годов, член Совета государственной обороны и член Государственного совета (с 3 ноября 1905 года) Александр Федорович Редигер. По его инициативе и под непосредственным руководством составлен детальный общий аналитический очерк деятельности военного министра за 1881–1890 годы. Им же за четырехлетний период пребывания на посту военного министра подготовлены служебные записки для императора по работе военной администрации, мобилизации войск, полевому управлению русской армией и комплектованию вооруженных сил страны в мирное и военное время.