В течение десятков лет Ваше имя было тесно связано с умственной жизнью Академии и служило украшением высшего рассадника агрономических знаний, откуда сотни молодых людей, под влиянием Вашей обаятельной личности, уносили в различные уголки обширного отечества веру в науку, человека и прогресс. Эта вера зарождалась здесь, в аудитории, где Вы вводили нас в общение с великими учеными, знакомили нас с методами научного мышления, раскрывали перед нами великие тайны природы и вселяли в нас любовь к самостоятельному изучению законов. Стремление к истине, к свету не только сообщалось нам, Вашим ближайшим ученикам, но, благодаря Вашей отзывчивости на умственные потребности нашего общества, Вы всегда спешили поделиться с ним блестящими завоеваниями науки, и словом, и пером распространяли в популярной, но высокохудожественной форме, новейшие успехи естествознания. Ваши труды и открытия в области науки стяжали Вам громкую известность среди русской интеллигенции. Мы гордимся тем, что можем назвать Вас своим учителем, идеальный образ которого всегда вызывает в нас самые светлые мысли и чувства. Позвольте же выразить Вам нашу любовь и глубокое уважение и пожелать еще много-много лет трудиться на столь благотворном поприще для блага своей родины.
Студенты Петровской академии
Петровская академия, 1891 г.
Ноября 22-го дня».
Любопытная ситуация сложилась в академии после ухода К. А. Тимирязева при преобразовании ее в Московский сельскохозяйственный институт. Когда в институте не нашлось единицы для преподавателя физиологии растений, К. А. Тимирязев отреагировал на это следующим высказыванием: «…И не странно ли, что у нас именно, с той поры, как стали особенно много говорить о подъеме научного земледелия, эти две его научные основы исчезли (речь шла еще об агрономической химии.
Однако эту «нелепую аномалию» прекрасно разрешил его ученик – Д. Н. Прянишников, пригласив на свободную единицу по бактериологии доктора наук Н. Н. Худякова, который в это время в Лейпциге работал ассистентом у физиолога Пфеффера. При поддержке К. А. Тимирязева Н. Н. Худякову разрешили в порядке исключения защитить магистерскую диссертацию в Московском университете (в то время диплом доктора, полученный за границей, не давал права занимать кафедру в России.
С 1 февраля 1892 г. вся преподавательская деятельность К. А. Тимирязева была связана с Московским университетом.
В 1893 г. К. А. Тимирязеву исполняется 50 лет. В «Аттестате», выданном К. А. Тимирязеву 16 апреля 1912 г. и подписанном ректором Императорского Московского университета действительным статским советником и кавалером М. Любавским, говорится: «С разрешения г. Товарища Министра Народного просвещения, сообщенного в предложении г. Попечителя Московскаго Учебнаго Округа, за № 2727, оставлен на службе при Московском Университете на основании статьи 104 Устава Университетов по выслуге им 25 лет в учебной службе с 10 декабря 1893 г. еще на пять лет». 1 января 1898 г. Высочайшим приказом по гражданскому ведомству за № 1 награжден орденом Святого Станислава I степени. 10 декабря этого же года Тимирязева знакомят с приказом, в котором говорится: «За 30-летнюю учебную службу в пенсию полный оклад содержания по три тысячи рублей в год, со дня выслуги 30-летнего срока, и исключение из числа штатных профессоров московского университета».
На протяжении шести лет (с 1892 г. по 1898 г.), приказом министра народного просвещения, Климента Аркадьевича назначают членом физико-математической испытательной комиссии при Московском университете.
Хотя 1898 год для К. А. Тимирязева явился годом исключения из числа штатных профессоров Московского университета, что произошло лишь 10 декабря после озвучения приказа, в целом этот год жизни ученого можно считать одним из триумфальных. Во-первых, накануне Нового года (30 декабря 1897 г.) императором Николаем II был подписан указ о награждении ученого «За отлично-усердную службу и особые труды орденом Святого Станислава первой степени». Это, безусловно, было знаком особого внимания к ученому со стороны царского правительства. Во-вторых, вся общественность отмечала 30-летие научной деятельности Климента Аркадьевича. Ученые и широкие слои населения необъятной России, а также зарубежных стран показали всеобщую любовь к личности выдающегося педагога, ученого и популяризатора научных истин. Каждый по-своему выражал свое восхищение как научным подвигом ученого, так и высоким мастерством педагога, о чем свидетельствуют нижеприведенные материалы.