Между тем в освященном ранее среднем нефе проводились службы. 20 января 1742 г. состоялось крещение трех персиан и двух турков «в тутошней Села Царского каменной церкви Знамения Пресвятой Богородицы». Восприемницей была сама императрица. В мае 1743 г. она «соизволила быть в церкви Святого Чудотворца Николая у литургии и обедни», часто присутствуя на богослужениях и в последующие годы[131].
8 мая 1746 г. освятили боковые приделы: южный – во имя Святой Великомученицы Екатерины, перенесенный из главной апсиды, и северный – во имя Святых и Праведных Захарии и Елисаветы. Работы в главной апсиде закончили через год. Солею и пол алтарной части по Высочайшему указу надлежало обить зеленым сукном, иконостас «прикрыть вновь зеленым глянцовитым грунтом, как сделано в новопостроенных двух приделах и кои иконы не весьма искусно написаны те переписать, так и карнизы… вызолотить и это сверх нынешнего украшения до резьбы и золочения в приличных местах надлежит во всем исправить»[132].
Большой иконостас шириной в три сажени имел вид ширмы, поставленной с изломами. Царские врата и сень украшала резьба, над ними находился образ «Вечери Тайныя», «вокруг резьба золоченая» овальной формы. В круглых золоченых рамах помещались четыре праздничные иконы («Благовещение Пресвятой Богородицы», «Введение во храм», «Преображение Господне» и «Сошествие Святого Духа»). На иконостасе имелись резные позолоченные скульптуры шести ангелов и двух пророков («Вверху ангелов резных золоченых шесть пророков два»). Резное убранство иконостаса включало сияние и императорскую корону с крестом над царскими вратами[133].
В конце мая 1747 г. с участием императрицы совершилось торжественное перенесение из Петербурга в Село Сарское трехдневным крестным ходом иконы Божией Матери Знамение. Главную святыню храма поместили в верхнем ярусе иконостатса над царскими вратами под осенявшей ее императорской.
Эту икону поднес в 1652 г. царю Алексею Михайловичу святой Афанасий, патриарх Константинопольский. Написанный на деревянной доске древневизантийский, по свидетельству Ф.П. Солнцева, образ представлял собой поясное изображение Богоматери с двумя огневидными серафимами по сторонам и с Предвечным младенцем в медальоне на груди. Размеры ее составляли один аршин пятнадцать вершков длины и один аршин восемь вершков в ширину. После воцарения Елизавета в 1741 г. соорудила ризу из своих собственных драгоценностей, весом в двадцать семь с половиной фунтов червонного золота. На боковых полях с двух сторон по ее велению добавили по два клейма с изображением Апостола Андрея и Преподобного Алексия человека Божьего, а под ними Пророка Захарии и праведницы Елисаветы[134]. В период эпидемии холеры 5 июля 1831 г. икону по желанию прихожан сняли с иконостаса и, по совершении крестного хода вокруг города, установили в отдельном киоте перед правым клиросом.
Чудотворному Царскосельскому образу Божьей Матери Знамение посвящено стихотворение А.С. Пушкина:
С иконой связывают спасение от пожаров Большого Екатерининского дворца в 1820 и 1863 гг. В 1859 г. на ней были написаны еще два изображения – св. Николая Мирликийского и мученицы царицы Александры, соименных святых императора Николая I и его супруги[135]. Эта икона привлекала много паломников. В 1879 г. икону канонизировали как чудотворную.
До окончания строительства Большого Воскресенского храма Знаменская церковь служила постоянной придворной церковью, а ее настоятель Иоанн Авраамиев освящал закладку не только дворцовой, но и других церквей в окрестностях Царского Села.
Чудотворная икона почиталась членами царствующего дома, часто посещавшими Царскосельский храм. От дворца к нему соорудили мостки, обнесенные балюстрадой и покрывавшиеся красным сукном во время Высочайших выходов. Императрица Елизавета предполагала устроить пышный подъезд к храму от Царскосельской перспективной дороги, поручив в 1751 г. Растрелли сочинить план и фасад каменной колокольни, «дабы оная была в виде триумфальных ворот и под нее б мог быть поезд на четыре стороны»[136].