Хотя в Токио все подсудимые были признаны виновными и семеро из них повешены, непреложным фактом остается то, что осуждению подверглись только 25 главных японских военных преступников, но гораздо большее число даже не привлекались к ответственности. Американцы посчитали выгодным для своих политических интересов спасти от ответственности подлинных хозяев милитаристской Японии. Неудивительно, что многие военные преступники остались безнаказанными, и многие из них вновь заняли ключевые позиции в экономике и правительственных органах Японии.
В отличие от Нюрнбергского процесса, на котором многие организации германского фашизма были признаны преступными, на Токийском процессе, опять же под давлением американцев, даже не ставился вопрос о преступных организациях японского милитаризма.
В приговоре в известной мере умалялась роль японского правительства в случившейся катастрофе, а отсюда — и мера ответственности правительства. Совершенно замалчивалась преступная роль монополий в агрессивных войнах. Возникает вопрос, почему одних преступников постигла меньшая кара, чем других?
Обращали на себя внимание некоторые противоречия между выводами трибунала и им же установленными фактами. Так, приговор констатирует, что между гитлеровской Германией и милитаристской Японией существовал военный союз, что они являлись агрессивными государствами и преследовали цель установить господство над другими народами мира. Наличие сговора между Германией и Японией зафиксировано.
Трибунал установил факты согласования деятельности штабов этих агрессивных государств, наличие военно-стратегического контакта между ними, в особенности после нападения Германии на Советский Союз. И несмотря на это, трибунал посчитал недоказанным наличие совместного заговора Японии и Германии против мира, из чего следовало, что генштабисты Японии в порядке личной инициативы сговаривались с нацистскими генштабистами, а правительство Японии тут ни при чем…
Судья Радхабинод Пэл из Индии, выражая свое несогласие с решением суда, высказал мнение, что исключение проблемы западного колониализма и применения Соединенными Штатами атомной бомбы из списка преступлений означает «неудачу трибунала в обеспечении чего-либо иного, кроме предоставления победителям возможности отмщения».
Несмотря на ряд недостатков, приговор Токийского трибунала представляет собой акт исторического значения, который был встречен с одобрением мировой демократической общественностью.
Двадцать второго ноября 1948 года генерал Макартур утвердил приговор в целом, заявив при этом, что он «не может найти никакого технического упущения или упущений в ходе самого судебного разбирательства, чтобы оправдать вмешательство в приговор». Однако вместо того, чтобы выполнить требование Устава и отдать приказ о приведении приговора в исполнение, Макартур принял апелляции осужденных Хироты и Доихары для направления в Верховный суд США и в связи с этим отложил исполнение приговора в отношении всех осужденных. Примеру Доихары и Хироты незамедлительно последовали Кидо, Ока, Сато, СимадаиТого.
Верховный суд США 6 декабря 1948 года большинством в пять голосов против четырех решил принять к рассмотрению апелляционные жалобы, а само рассмотрение назначил на 16 декабря.
Такое беспрецедентное незаконное вмешательство Верховного суда США в дело, рассмотренное Международным судом, вызвало негодование даже в некоторых японских кругах, не говоря уже о возмущении в других странах. Член Токийского трибунала от Китая судья Мэй Жо-дао заявил: «Если решение, вынесенное Международным трибуналом, представляющим одиннадцать держав, подлежит пересмотру со стороны национального суда, каким бы высоким он ни был, то существует справедливое опасение, что любое международное решение и действие могут быть таким же образом подвергнуто пересмотру и изменению одной страной».
Помощник обвинителя от Китая по поводу распоряжения Макартура сказал, что ни один национальный Верховный суд не имеет права пересматривать решения Международного трибунала и что Макартур превысил свои полномочия и злоупотребил своей властью, ущемляя при этом права других наций.
Незаконные действия Макартура подверглись резкой критике в прессе Филиппин. Один из вашингтонских корреспондентов вынужден был признать, что решение Верховного суда США пересмотреть приговор, вынесенный Токийским трибуналом, означает вмешательство в международные дела.
Самоуправство Макартура и незаконное решение американского суда являлись ярким выражением тенденций реакционных кругов Вашингтона к бесцеремонному навязыванию своей воли другим государствам. «Вмешательство США в дело японских военных преступников, — отмечала «Правда» 21 декабря 1948 года, — это вызов демократии, миру, безопасности народов; вторжение Верховного суда США в компетенции Международного трибунала — новое доказательство пренебрежения вершителей судеб в США к международным соглашениям, к международному праву, к международным обязательствам».