В романе Дэна Брауна «Происхождение», пятой части серии о Роберте Лэнгдоне, герой оказывается в Барселоне и пытается найти загадочный пароль, ускользая из лап врага. Суперкомпьютерный центр Барселоны несколько раз фигурирует в романе вместе с MareNostrum и Alya Red – многомасштабной моделью сердца, выросшей в результате смешения макроскопических, континуальных моделей кровотока и механики с моделями электрической активности внутри клеток. Эта вдохновляющая многомасштабная смесь электрофизиологии, гидромеханики и механики работает так же, как и настоящий орган.
Это одна из многих моделей, появившихся за последнее десятилетие и основанных на достижениях в области визуализации сердца с помощью МРТ и КТ, которые все ближе подбираются к отражению всего сердца[416]. Йорам Руди из Вашингтонского университета в Сент-Луисе использует моделирование целых органов для прогнозирования электрокардиограммы при летальных аритмиях. Существует также разработанный Dassault Systèmes Simulia Corporation и другими проект «Живое сердце», который создает цифровых двойников сердец пациентов[417], а также исследования Гернота Планка в Медицинском университете Граца, Австрия, и исследования Тошиаки Хисады в Токийском университете[418].
Рисунок 32. Виртуальное сердце Alya Red (compBioMed и Суперкомпьютерный центр Барселоны)
Мариано Васкес, работавший с нами над созданием захватывающего фильма «Виртуальные люди», премьера которого состоялась в Музее науки, входит в число 50 исследователей команды разработчиков Alya в Суперкомпьютерном центре Барселоны. Защитив докторскую диссертацию по моделированию потоков жидкости под одним научным руководителем, с 2004 г. он и Гийом Узо разработали программное обеспечение для моделирования множества многомасштабных мультифизических задач, от образования облаков, до того, как вода обтекает китов. Они назвали свое программное обеспечение в честь звезд, в данном случае Alya, и начали его настраивать: Alya Red использовалась для биомедицины, Alya Green для окружающей среды и т. д. Дочерняя компания Elem Biotech разработала модель для биомедицинских применений (например, чтобы показать, что мелкие частицы лекарств из ингалятора попадают в нужное место в организме) и работала с исследователями из Вашингтонского университета над моделированием родовых схваток, которые, как и сердечные сокращения, являются электромеханическими.
На момент написания их модель сердца Alya Red состояла примерно из 100 миллионов участков клеток, каждый из которых описывался примерно 50 уравнениями с 15 переменными (иногда больше, в зависимости от сложности модели), такими как электрическая активность, перемещение, давление и скорость[419]. Как и в прогнозировании погоды, разделение (дискретизация) сердца на ряд более мелких и лучше управляемых частей дает набор миллиардов связанных конечно-разностных уравнений, которые необходимо решить для запуска модели. По сравнению с тысячами миллионов чисел, которые требуются при работе с моделью Alya Red, для настройки цифрового сердца под пациента нужно не так уж много параметров. Детали интересующего сердца – мужского, женского, молодого, старого, тучного, диабетического и т. д. – получаются из измерений человеческого сердца. Некоторые из них собраны, например, Лабораторией видимого сердца Университета Миннесоты.
Обычно для моделирования 10 ударов сердца требуется 10 часов. В идеальном мире мы хотели бы моделировать человеческое сердце гораздо быстрее, чем реальное, но эти симуляции все еще показательны. В разрезе можно показать, например, как больное сердце теряет способность качать кровь, или что опасная аритмия вызвана сердечными препаратами. Потоки в нормальном сердце можно легко визуализировать при моделировании, изображая их в виде пучков ярких цветов, причем красный, оранжевый и желтый используются для обозначения самых сильных потоков. Для сравнения, потоки крови в пораженных желудочках, уже не синхронизированные должным образом, проявляются как вялые синие и зеленые.
Даже имея базовое виртуальное человеческое сердце, можно многое сделать для помощи в проектировании, разработке и производстве медицинских устройств, что является предметом сотрудничества между компанией Medtronic и Суперкомпьютерным центром Барселоны. Их моделирование показывает, как традиционный кардиостимулятор с электродами, продетыми через вены, может восстановить насосную функцию отказавшего сердца. Оно способно помочь расположить кардиостимулятор и точно настроить его электрический стимул. Моделирование также помогло Medtronic спрогнозировать действие инновационного кардиостимулятора Micra (крошечного цилиндра, который вставляется в сам желудочек), показывая лучшее место для его размещения, а также выяснить, как его закрепить, не повредив сердце, и изучить получившиеся потоки крови.
Рисунок 33. Кардиостимулятор Micra (воспроизведено с разрешения Medtronic)