Поворотный момент наступил позже, в ноябре 2016 года, когда д-р Адриана Мело продемонстрировала, что амниотическая жидкость беременной женщины содержала вирус Зика18,19. Вскоре после этого образцы тканей мозга двух недоразвитых плодов оказались положительными на вирус Зика. Впоследствии активные научные исследования подтвердили связь между вирусной инфекцией Зика и гибелью плода, микроцефалией, инфекцией нейрональных клеток-предшественников головного мозга, периферических нейронов и пороками развития после рождения20-30. Таким образом, широко распространенная эпидемия лихорадки Зика, о которой сообщалось в течение 2015–2016 годов в Центральной Америке и Карибском бассейне, показала, что беременные женщины, у которых в конце первого триместра беременности были выявлены лихорадочные заболевания и сыпь, имели высокий риск рождения потомства с врожденными аномалиями и проблемами развития. В других исследованиях с использованием ультразвуковых методов на 29-й неделе беременности в мозге плодов у некоторых из этих матерей была обнаружена микроцефалия, связанная с отложениями кальция. Точно так же у плодов, абортированных по просьбе матерей, наблюдались микроцефалия и кальцификация коры головного мозга и его серого вещества. В ходе исследований вирус Зика был обнаружен с помощью молекулярного анализа. Когда позже вирус Зика секвенировали, бразильские образцы оказались близки (>95 %) к азиатским штаммам вируса Зика. Путем заражения плода была вертикальная передача вируса Зика через сперму и влагалищные жидкости28,29, а внутриматочная секвестрация была, по-видимому, источником этого вируса, обнаруженного в амниотической жидкости плода с микроцефалией. У нескольких выживших детей отмечалась умственная отсталость и пороки развития. Хотя в мозге и плацентарных тканях обнаруживали вирус и отложения кальция, в других органах плода не было отмечено присутствия вируса или патологического повреждения. При тестировании на макаках-резусах вирусемия Зика продолжалась в течение десяти дней после заражения, но персистировала в омывающих мозг жидкостях (спинномозговая жидкость) в течение 42 дней, а в лимфатических узлах – до 72 дней31. Кроме того, повышенное содержание вируса Зика отмечалось у пациентов с синдромом Гийена – Барре.
В начале 2016 года ВОЗ заявила, что рост числа врожденных дефектов и других неврологических состояний предположительно связан с вирусом Зика и что вирусная инфекция Зика может быть классифицирована как чрезвычайная ситуация в области здравоохранения во всем мире. К 1 февраля ВОЗ объявила, что вспышки инфекций Зика достигли критического уровня32. Призывы были направлены на усиление эпидемиологического надзора и исследований, на сосредоточение усилий по борьбе с распространением вируса и на разработку коммерческих диагностических тестов для выявления этого вируса (ничего из этого не осуществлялось). В качестве целей были указаны производство и использование препарата(-ов) против вируса Зика и вакцины (которых не существовало). Вероятность того, что специфические врожденные дефекты (в первую очередь микроцефалия) были связаны с вирусом Зика, а не с неизвестным вирусом, становилась все более очевидной. У меньшей части зараженных вирусом Зика людей заражение приводило к легкой инфекции в течение нескольких дней. У этих инфицированных пациентов были незначительно повышенная температура, сыпь и покраснение глаз, но они редко нуждались в госпитализации. У большинства же из тех, у кого был получен положительный результат на эту инфекцию (на самом деле это более 80 %), вообще не было симптомов. Но теперь работники общественного здравоохранения все больше убеждались в опасности вируса Зика из-за его вероятной связи с микроцефалией и синдромом Гийена – Барре. В конце концов органы здравоохранения пришли к выводу, что были инфицированы 1,5 миллиона бразильцев. В штате Пернамбуку, Бразилия, обычно регистрировалось 150 случаев микроцефалии в год, но в тот год было зарегистрировано 270 случаев. Из этих 270 новорожденных с микроцефалией 6 имели подтвержденную связь с инфекцией Зика. Вскоре число зараженных возросло более чем до трех с половиной тысяч. Тем не менее ВОЗ заявляла, что торговлю с Бразилией и поездки туда не следует ограничивать. Напротив, американский центр по контролю заболеваний перечислил районы Бразилии, куда следует избегать поездок беременным женщинам, но запрет по-прежнему не был введен. Тем не менее свидетельство об опасности вируса Зика заставило президента Бразилии Дилму Руссефф издать чрезвычайный указ для работников здравоохранения и направить армейские части для осушения заболоченных территорий, чтобы уничтожить места размножения комаров, тем самым сократив их численность. Одновременно в рамках общественной просветительской кампании было рекомендовано избегать комаров, ликвидировать места их размножения и носить одежду с длинными рукавами, полностью покрывающую тело.