В Уфе против переворота выступил «совет управляющих ведомствами», представлявший собой бывший самарский Комуч (Комитет членов Учредительного собрания), после отступления из Поволжья оставшийся «правительством без территории», к тому же утративший полномочия после создания объединенной Директории и продолжавший существовать на правах общественной организации, во главе с председателем Комуча эсером В.К. Вольским. В своей телеграмме премьеру П.В. Вологодскому «совет управляющих ведомствами» требовал восстановления «законной» власти, в противном случае угрожая ему именем «врага народа», и разослал эту телеграмму автономным правительствам областей и казачьих войск, а также чехам. Уфимцы пытались договориться с генералом В.Г. Болдыревым, но не преуспели в этом: после колебаний тот все же подчинился Колчаку. 30 ноября Верховный правитель отдал приказ об аресте уфимских «мятежников». Не получив никакой поддержки, большинство из них во главе с самим Вольским успели скрыться. Так бесславно закончились две попытки защитить свергнутую демократическую власть в Екатеринбурге и Уфе.
Чтобы предотвратить попытки вооруженных выступлений против новой власти, Колчак 23 ноября издал приказ населению сдать имеющееся на руках оружие, за исключением охотничьих ружей. На хранение револьверов и пистолетов (кроме наганов, в которых нуждалась армия) требовалось персональное разрешение местных военных властей, которое, понятное дело, могло выдаваться далеко не каждому. В начале декабря за попытки нелегальной борьбы с новым режимом по распоряжению Колчака были вновь произведены аресты членов Учредительного собрания.
Тем не менее, вооруженные выступления против власти все же последовали. В ночь на 23 декабря 1918 года большевики подняли в Омске восстание. Они захватили тюрьму, железнодорожный мост через Иртыш и пригород Куломзино. Колчаковская контрразведка была осведомлена о подготовке восстания и накануне приняла своевременные меры, арестовав штаб заговорщиков, чем существенно облегчила власти усмирение восстания. Восстание было жестоко подавлено в тот же день частями омского гарнизона: по официальным данным, 277 повстанцев было убито на месте, 166 расстреляны по приговору военно-полевых судов[159].
При этом от самосуда офицеров погибли освобожденные повстанцами из тюрьмы депутаты Учредительного собрания в количестве 8 человек – Барсов, Брудерер, Лиссау, Локтев, Марковецкий, фон Мекк, Саров и Фомин (полноправным членом Учредительного собрания среди них был один Н.В. Фомин, остальные были в числе кооптированных В.М. Черновым «для кворума» в период пребывания съезда членов Учредительного собрания в Екатеринбурге), хотя эти люди в восстании не участвовали, а после его усмирения по приказу властей добровольно вернулись в тюрьму. Остальные находившиеся в тюрьме депутаты после усмирения восстания были отпущены на свободу.
Как бы то ни было, самосудная расправа с членами Учредительного собрания произвела неблагоприятный для Колчака резонанс, хотя и произошла вопреки его запоздавшему приказу о невыдаче арестованных из тюрьмы без особого распоряжения. Поэтому официальное правительственное сообщение о событиях 23 декабря в Омске было двойственным: с одной стороны, оно выражало благодарность войскам за исполнение своего долга при подавлении восстания, с другой – заверяло общественность в расследовании фактов незаконных самосудных расправ. Была создана следственная комиссия на высоком уровне[160], но ее работа окончилась в целом безрезультатно: виновники хотя и были найдены, но от наказания им удалось ускользнуть. Видимо, не в интересах правительства было портить отношения с преданными режиму офицерами.
После этих событий основная масса эсеров и меньшевиков на Урале и в Сибири, подобно большевикам, переходит к подпольной антиправительственной деятельности. После переворота 18 ноября заседавший в Уфе ЦК партии эсеров принял резолюцию, гласившую: