Разумеется, Даллес, будучи руководителем берлинской резидентуры, лично не водил военных преступников тайными тропинками, не передавал их из одной явочной квартиры в другую. Он руководил операцией только в самом её начале, дал ей толчок, а в дальнейшем ею занимались уже другие лица, в значительной степени выращенные в его бернском, а затем берлинском аппарате.
Помимо этого, Даллес способствовал переправке в Соединённые Штаты некоторых немецких учёных, прежде всего занятых в отраслях, связанных с созданием новых видов вооружений. Он был одним из разработчиков операции «Пейперклип»
Наряду с главной задачей — использованием труда германских учёных и других специалистов в развитии американской науки, техники и промышленного производства, план «Скрепка» ставил цель воспрепятствовать передаче германскими специалистами соответствующих знаний не только СССР, но и Великобритании262
.В результате осуществления плана «Скрепка» в США уже без участия Даллеса, но в соответствии с планом, в котором он принимал прямое участие, было вывезено более 1400 крупных учёных и инженеров, досье которых сохранились в Национальном архиве Соединённых Штатов263
. Среди них были выдающиеся специалисты в области ракетостроения Вернер фон Браун, Вальтер Дорнбергер, Курт Дебус, Фриц Мюллер, авиаконструкторы Александр Липпиш и Курт Танк, специалисты в области электроники Курт Леховец и Ганс Циглер, медики Вальтер Шрайбер, Курт Блюме, Губертус Штругхольд.При отборе учёных на вывоз в США спецслужбисты стремились избежать возможных будущих скандалов, связанных с участием этих лиц в преступлениях против человечности. В первую очередь это касалось врачей. Агенты УСС стремились проверить, не участвовали ли отбираемые доктора в нацистских экспериментах над людьми. Всё же нескольких весьма неприятных историй избежать не удалось. Это, в частности, касалось Штругхольда, который в США стал известным специалистом в области космической медицины. Однако через много лет, уже после смерти этого человека, выяснились шокирующие детали его участия в экспериментах над людьми в концентрационном лагере Дахау, которые вели к мучениям и гибели заключённых264. Разумеется, к такого рода инцидентам Даллес непосредственно не был причастен, но он имел к ним отношение самим фактом того, что стоял у истоков проекта «Скрепка».