Инициативе Вашингтона было сделано грандиозное паблисити по всем правилам американской рекламы. Его призывы к неграм прекратить борьбу за свои права, искать пути компромиссного решения всех спорных проблем обеспечили Вашингтону активную поддержку и помощь со стороны финансового капитала.
Работы Дюбуа в значительной мере противоречили политике Букера Вашингтона. Вашингтон мог давать высокую оценку отдельным достижениям Дюбуа, как это было сделано в приведенном выше высказывании о работе Атлантского университета по исследованию негритянских ремесленников, но в целом Дюбуа и Вашингтон уже тогда шли принципиально различными путями.
Дюбуа все больше приходил к выводу, что, несмотря на всю важность его научных исследований для негров, он невольно оказывался в значительной мере в стороне от тех проблем, которые больше всего волновали негритянский народ. «Я понял, — писал Дюбуа, — что невозможно оставаться спокойным, хладнокровным и объективным ученым в то время, когда негров линчуют, убивают и заставляют умирать от голода». А когда Дюбуа приходил к какому-либо выводу, он с присущей ему энергией, настойчивостью и прямотой добивался реализации того, что он считал справедливым.
Принципиальные различия во взглядах на негритянскую проблему, нетерпимость Вашингтона ко всем инакомыслящим, полное отсутствие у Дюбуа склонности к компромиссам по принципиальным вопросам — все это предопределило неизбежность столкновения между Вашингтоном и Дюбуа. В 1903 году между ними произошла первая серьезная размолвка, которая в 1908 году привела к окончательному разрыву.
Разрыв с Вашингтоном, за спиной которого стояли мощные и влиятельные силы, имел роковые последствия для Дюбуа. Прошло всего два года после этого, и он был вынужден прекратить свою работу в Атлантском университете.
В своей работе он наталкивался на серьезное противодействие и со стороны федеральных организаций. В 1906 году Дюбуа обратился к федеральному уполномоченному по вопросам труда Нейлу с предложением провести тщательное историческое и социологическое исследование негров Черного пояса, района Юга, где негры составляли большинство населения.
С двумя своими помощниками Дюбуа проделал огромную работу по исследованию многочисленных документов и опросу населения. Это была не только тяжелая, но и опасная работа. В заповеднике расизма, где работали Дюбуа и его сотрудники, можно было столкнуться с любой неожиданностью и даже стать жертвой суда Линча. Во всяком случае имели место случаи, когда сотрудников Дюбуа встречали выстрелами из ружей.
Надо было иметь незаурядное мужество, чтобы в таких условиях вести работу и закончить ее. Исследование было доведено до конца и отправлено в Федеральное бюро по вопросам труда. После долгих бюрократических проволочек чиновники из бюро, сославшись на то, что в отчете «затронуты политические проблемы», отказались опубликовать его и уничтожили единственный экземпляр рукописи отчета.
Так погибло одно из лучших, наиболее тщательно подготовленных социологических исследований Дюбуа. И это был не единственный случай.
Безвозвратно погибли для науки исследования, которые проводил Дюбуа в период своей работы в Атлантском университете, в штате Джорджия. В январе 1959 года в Москве на встрече с советскими учеными, работающими над проблемами истории Америки, Дюбуа рассказал о том, что вместе со своими учениками он тщательно исследовал один из округов штата Джорджия. Была проделана работа очень большого объема: история этого округа исследовалась на огромном историческом отрезке времени, начиная от появления здесь первых колонизаторов и до начала XX века. Помимо исследования документальных источников, проводился тщательный опрос многих жителей. Обобщенный и обработанный материал в виде отчета о проделанной работе был направлен в Федеральное бюро по вопросам труда, где он и нашел свою гибель. Федеральные чиновники не только не выполнили свое обещание опубликовать это исследование, но даже отказались вернуть рукопись. После этого случая, говорил Дюбуа, мы всегда печатали материалы своих исследований в университетском бюллетене.
Дюбуа подчеркнул, что причиной уничтожения его исследования в Федеральном бюро являлось то, что в этой работе речь шла о неграх. А эти Материалы в США никогда не торопились публиковать, а нередко грубейшим образом пытаются даже уничтожить сведения о всех событиях в истории США, связанных с неграми. Дюбуа рассказал, например, интересный факт, связанный с историей столицы США. Основателем Вашингтона был негр Грех. Но в библиотеке конгресса США была вырезана статья из хранящейся там газеты 1793 года, в которой сообщалось об этом факте.