Князь Гогенлоэ доблестно руководил войсками под огнем. Перестроив разбежавшийся полк Заница, он решил штыковой атакой захватить с полком Цастрова деревню Фирценхейлиген, надеясь этим добиться победы. Между тем ему сообщили о появлении новых неприятельских колонн, о том, что генерал Хольцендорф в схватке с превосходящими силами не в состоянии последовать за ним, но генерал Рюхель тем не менее готов присоединиться к нему со своим корпусом. Тогда, решив дожидаться этой мощной поддержки, он атаковал Фирценхейлиген с помощью артиллерии, прежде чем переходить к штыковой атаке. Одновременно он слал гонца за гонцом к Рюхелю, торопя его и обещая победу, если он прибудет вовремя, ибо князю казалось, что французы готовы отступить. Напрасная иллюзия кипучей, но слепой отваги! В эту минуту фортуна распорядилась иначе. Из Иссерштедтского леса появился, наконец, Ожеро с дивизией Дежардена, освободил левый фланг Нея и начал ружейную перестрелку с саксонцами, оборонявшими Шнеке, в то время как генерал Эделе атаковал их на дороге из Йены в Веймар. На другом конце поля битвы корпус Сульта, прогнав из леса Клозевица остатки бригады Черрини и стрелков Пелета и далеко оттеснив подразделение Хольцендорфа, пустил в ход на фланге пруссаков свои пушки. Наполеон, увидев прогресс на обоих флангах и узнав о прибытии войск, остававшихся позади, не побоялся вовлечь в дело все силы, имевшиеся на участке, включая гвардию, и отдал приказ выдвигаться вперед. Непреодолимый порыв сообщился всей линии. Французы потеснили пруссаков, опрокинув их с наклонного участка, который спускается от Ландграфенберга к долине Ильма. Полк Гогенлоэ и гренадеры Хана из дивизии Граверта были почти полностью уничтожены огнем и штыками. Генерал Граверт получил серьезное ранение. Ни один корпус не выдержал. Под градом картечи бригада Черрини отступила к резерву Дигерна, который тщетно противопоставлял свои пять батальонов движению французов. Вскоре его резерв был атакован, окружен со всех сторон и рассеян. Корпус Тауенцина, ненадолго присоединявшийся к сражению, оказался вовлечен, как и все остальные, во всеобщее беспорядочное бегство. Прусская кавалерия пыталась атаковать, чтобы прикрыть свою пехоту, но французские егеря и гусары противостояли ей и опьяненные победой непрестанно возобновляли атаки. Ужасающая резня сопровождала беспорядочное бегство пруссаков, пленников брали на каждом шагу, артиллерию захватывали целыми батареями.
Среди этого великого смятения появился, наконец, но слишком поздно, генерал Рюхель. Он двигался двумя пехотными линиями с кавалерией на флангах, шагом взбираясь на плоскогорье, спускающееся под уклоном от Ландграфенберга к Ильму. Пока он поднимался, вокруг него потоком шли вниз пруссаки и преследующие их французы. Таким образом, не успел он появиться на поле битвы, как его встретило нечто вроде бури. Пока он, с сердцем, упавшим при виде такого разгрома, продвигался вперед, французы обрушились на него с победной безудержностью. Прикрывавшая его левый фланг кавалерия была рассеяна первой. Этот неудачливый генерал, неразумный, но пламенный друг своей страны, сам подставился под удар. Пораженный пулей в грудь, он был унесен своими солдатами. Его пехота, лишившись прикрытия кавалерии, подверглась атаке с фланга войсками Сульта, а с фронта – войсками Ланна и Нея. Охваченные ужасом батальоны на крайнем левом фланге разбежались и вовлекли в свое бегство остальной армейский корпус. В довершение бед галопом примчались французские драгуны и кирасиры под предводительством Мюрата, которым не терпелось принять участие в сражении. Они окружали несчастные разбегавшиеся батальоны, рубили саблями тех, кто пытался сопротивляться, и преследовали остальных до берегов Ильма, где захватили большое количество пленных.
На поле боя остались только две саксонские бригады Бургсдорфа и Нероффа. Они храбро обороняли Шнеке, были вытеснены со своих позиций и отступали, построившись в два каре, с трех сторон представлявшие пехоту и с одной – артиллерию, повернутую назад. Они отступали, останавливаясь, давая залпы из своих пушек и затем возобновляя движение. Артиллерия Ожеро следовала за ними, забрасывая их ядрами, а туча французских стрелков осыпала их ружейным огнем. Мюрат, оттеснив остатки корпуса Рюхеля, бросил на саксонцев в атаку своих драгун и кирасиров. Драгуны прорвали первую бригаду, генерал д’Опуль с кирасирами – вторую. У несчастных не было иного выхода, кроме как сдаться в плен. Прусский батальон Богуславски был, в свою очередь, прорван, и его постигла та же участь. Доблестный генерал Цешвиц, примчавшийся с саксонской кавалерией на помощь своей пехоте, напрасно надеялся ее поддержать; ему пришлось отойти, уступив всеобщему бегству.