Наполеон приказал префектам срочно оказать содействие снабжению крепостей посредством местных реквизиций, платя или обещая заплатить в ближайшее время за продукты и скот. Так же следовало поступать в отношении дерева и всех материалов, в которых имелась нужда. Маршалы, командовавшие действующими войсками — Виктор в Страсбурге, Мармон в Майнце, Макдональд в Кельне и Везеле, — получили инструкции приступить к реорганизации корпусов и составлению гарнизонов. Подразделения, подходившие из 32-го военного округа, то есть из мест между Гамбургом и Безелем, формировали основу гарнизона Безеля. Четвертый корпус, представлявший собой смесь остатков нескольких корпусов, был предназначен для обороны Майнца под командованием генерала Морана, его бывшего командующего. Генерал Бертран, который командовал этим корпусом в последнее время, был назначен гофмаршалом дворца в награду за преданность. Страсбург получил некоторое количество защитников, к числу которых следовало отнести конскриптов и национальных гвардейцев. Верность Эльзаса позволяла прибегнуть к народному ополчению, которым Наполеон пользоваться не любил, разве что для обороны крепостей.
Артиллерийские кадры, наспех заполненные конс-криптами, обеспечили действующий состав этой армии. Ей выделили хороших командиров, присоединили некоторое количество молодых офицеров-инженеров и предписали всем потратить зиму на организацию. Следует признать, что со стороны офицеров недостатка в усердии не было.
Меры, принятые для трех наиболее значительных крепостей первой линии — Страсбурга, Майнца и Безеля, — были, с некоторыми местными отличиями, исполнены и во всех остальных.
Затем Наполеон занялся действующей армией. К невзгодам, постигшим наши войска после возвращения из Германии, добавилось бедствие еще более ужасное, чем все остальные: тиф. Зародившись в переполненных лазаретах Эльбы, будучи перенесен на Рейн ранеными,
больными и отставшими, он произвел ужасающие опустошения, особенно в Майнце. Четвертый корпус, доведенный до 15 тысяч человек вследствие объединения 4-го, 12-го, 7-го и 16-го корпусов, а вскоре и до 30 тысяч вследствие постепенного присоединения отдельных солдат, потерял за месяц половину действующего состава и теперь насчитывал менее 15 тысяч человек. От военных тиф перекинулся на население. Майнц охватил всеобщий ужас, и по горячему настоянию жителей власти в надежде побороть заразу приказали провести скорейшую эвакуацию вглубь страны. Эта мера повлекла за собой новые бедствия, и на дорогах можно было встретить телеги, нагруженные десятками несчастных, умиравших рядом с трупами, от которых не имели сил оторваться. Вдобавок зараза начала распространяться на вторую линию крепостей, и уже город Мец содрогнулся, узнав о смерти в его лазаретах нескольких солдат, заболевших тифом.
Мармон, взволнованный этим ужасным зрелищем, многое сделал, чтобы уменьшить зло, и прежде всего воспрепятствовал эвакуациям, которые подвергали стольких несчастных опасности погибнуть на дорогах и угрожали заразой городам в глубине страны. Он силой занял все строения, которые можно было превратить в лазареты, и перевозил больных из лазарета в лазарет, не перевозя их из города в город. Реквизиции в округе удовлетворяли нужды больных, и благодаря этим разумным мерам бедствие если не уменьшилось, то по крайней мере, казалось, приостановило свое грозное шествие. Тем не менее один из полков Мармона, 2-й морской, сократился за месяц с 2162 до 1054 человек.
С дозволения Наполеона Мармон вывел из Майнца корпуса, в которых не было необходимости для обороны крепости. Второй корпус под командованием маршала Виктора уже был направлен на Страсбург; 5-й и 11-й корпуса, объединенные под командованием Макдональда, направились на Кельн и Везель. К Вормсу Мармон направил 3-й и 6-й корпуса, которым назначалось служить под его командованием, и оставил в Майнце только 4-й корпус, который должен был поддерживать гарнизон. Наконец, по приказу Наполеона, он забрал из
Майнца гвардию, конницу и пехоту и разделил их между Кайзерслаутерном, Дю Понсом, Саргемином, Саар-луи, Тьонвилем, Люксембургом и Триром.
Затем Наполеон отдал приказы о реорганизации корпусов. Большинство из них стали простыми дивизиями и содействовали тем самым формированию новых корпусов. Исключение составил только 2-й корпус, расквартированный в Страсбурге близ своих сборных пунктов, в которых и собирался найти средство восстановления с наибольшей легкостью и полнотой.