Проф. Ѳ. Благовидовъ пишетъ, что “крайнее униженіе св. Сѵнода, явившееся результатомъ учрежденія министерства духовныхъ дѣлъ, — униженіе, оказавшееся, вслѣдствіе характера дѣятельности Голицына, далеко небезопаснымъ для интересовъ самого православія, не могло не вызывать сильнаго, хотя и затаеннаго недовольства произведенною реформою въ средѣ высшей церковной іерархіи”. Большое волненіе вызывало все усиливавшееся увлеченіе Голицына мистицизмомъ. Митр. Амвросій, съ тревогой наблюдавшій происходящее, высказался противъ Голицына, но успѣха не имѣлъ. Въ началѣ 1816 г. онъ, не безъ давленія, отказался отъ управленія петербургской епархіей, оставивъ себѣ только новгородскую. Владыка Амвросій скончался 21 мая 1818 г. въ Новгородѣ и погребенъ въ Софійскомъ соборѣ. Съ 1817 года ему данъ былъ викарій — еп. Филаретъ (Дроздовъ), еп. ревельскій.
Положеніе же обострялось все больше. Все, связанное съ инославіемъ, находило полную поддержку у Голицына, который прикрывалъ даже своимъ авторитетомъ хлыстовскія радѣнія, устраивавшіяся Татариновой. Не препятствовалъ онъ и распространенію скопческой литературы Кондратія Селиванова. Главные посты въ Библейскомъ обществѣ занимали масоны: А. Ѳ. Лабзинъ (директоръ) и В. М. Поповъ (секретарь). Голицынъ запрещалъ духовной цензурѣ пропускать печатныя произведенія противъ вредныхъ сочиненій.
Первымъ началъ открытую борьбу съ явнымъ зломъ архим.