Дѣло его было успѣшно продолжено его сотрудникомъ и преемникомъ, прот. Стефаномъ Ландышевымъ,
окончившимъ нижегородскую семинарію, и послѣдующими начальниками миссіи, въ особенности архим. Владиміромъ (Петровымъ), однимъ изъ выдающихся русскихъ миссіонеровъ (1828-1897). Сынъ простого донского казака, онъ окончилъ кіевскую дух. академію, принявъ на четвертомъ курсѣ монашество. Былъ инспекторомъ иркутской и новой томской семинарій, а затѣмъ инспекторомъ петербургской академіи, гдѣ, въ санѣ архимандрита, читалъ лекціи по догматическому богословію. Въ это время онъ принималъ живое участіе въ учрежденіи въ Петербургѣ миссіонерскаго общества для содѣйствія миссіямъ алтайской и забайкальской. Въ 1865 г. архим. Владиміръ былъ назначенъ начальникомъ алтайской миссіи и строителемъ Благовѣщенскаго мон. въ алтайскихъ горахъ, учрежденнаго въ 1864 г. Кузнецкій и бійскій округа, въ которыхъ работала миссія, занимали пространство верстъ 1000 въ длину и отъ 300 до 700 въ ширину. Населенія было всего 40000, изъ нихъ двѣ трети кочевниковъ. “Здѣсь на Алтаѣ”, писалъ арх. Владиміръ, “съ трудомъ пробираясь, верхомъ на конѣ, ища заблудшихъ овецъ стада Божія, миссіонеръ въ теченіе цѣлыхъ сутокъ, и то не всегда, можетъ встрѣтить едва нѣсколько душъ, со своими одиночными юртами запрятавшихся то въ глубинѣ лѣсной, то на удаленномъ отъ проѣзжей тропы нагорномъ скатѣ.” Только окраины миссіи граничили съ русскимъ населеніемъ, да и то, большей частью, раскольничьимъ. Приходскія церкви находились въ большомъ отдаленіи. Вслѣдствіе этого на миссіонерѣ лежало попеченіе не только объ обращеніи язычниковъ, но и объ исполненіи обязанностей приходскаго священника для новообращенныхъ. Въ почти пустынной мѣстности, среди дикой природы, при полномъ бездорожьѣ, арх. Владиміръ верхомъ на конѣ объѣзжалъ инородческія кочевья и несъ язычникамъ проповѣдь о Христѣ. Онъ не щадилъ себя — мерзъ, тонулъ, голодалъ, нерѣдко питаясь при своихъ поѣздкахъ одними кореньями и травами. Миссіонерство его было глубоко-внутреннимъ, искреннимъ. За 18 лѣтъ служенія миссіи арх. Владиміръ открылъ болѣе 10 начальныхъ школъ, при чемъ число учениковъ упятерилось. Основалъ онъ въ Улалѣ центральное миссіонерское училище, съ обученіемъ иконописанію, переплетному мастерству и сельскому хозяйству. Переводилъ онъ и всячески содѣйствовалъ переводамъ на алтайскій языкъ церковныхъ и религіозно-нравственныхъ книгъ. При немъ построено 28 церквей и молитвенныхъ домовъ, устроены свѣчной заводъ и типографія, а также миссіонерская больница и аптека. Основалъ онъ 19 новокрещенскихъ селеній, въ которыхъ устанавливалась осѣдлая жизнь.Въ 1880 г. арх. Владиміръ былъ хиротонисанъ въ епископа бійскаго,
викарія томской епархіи, съ оставленіемъ начальникомъ миссіи. Онъ переселился въ Бійскъ. Въ 1883 г. онъ былъ назначенъ епископомъ томскимъ и тамъ продолжалъ свою просвѣтительную дѣятельность. Занимая потомъ каѳедры ставропольскую и нижегородскую, онъ въ 1897 г. скончался будучи архіепископомъ казанскимъ. Всюду онъ развивалъ большую работу. Въ Ставрополѣ имъ былъ организованъ миссіонерскій станъ среди калмыковъ и выстроены для новообращенныхъ храмъ, школы и избы для осѣдлаго житія. Въ Казани, развивая дѣятельность, существовавшихъ миссіонерскихъ учрежденій, онъ посѣщалъ инородческія селенія.Къ 1895 г. алтайская миссія
имѣла 14 становъ, до 47 церквей и молитвенныхъ домовъ, 2 монастыря, приходское попечительство и многія благотворительныя учрежденія. Около своихъ становъ миссія посадила на осѣдлое жительство болѣе 10000 кочевниковъ. Въ дальнѣйшемъ, огромную дѣятельность развилъ начальникъ миссіи архим. Макарій (Невскій), называвшійся “апостоломъ Алтая”, бывшій затѣмъ архіеп. томскимъ и митрополитомъ московскимъ. Побѣдоносцевъ, упоминая въ краткой запискѣ, составленной въ 1892 г. для Наслѣдника Цесаревича Николая Александровича, предпринимавшаго поѣздку въ Японію и Сибирь, объ еп. японскомъ Николаѣ и архим. Макаріи (Глухаревѣ), писалъ: “Нынѣшній Макарій (Невскій) — достойный ихъ послѣдователь. Прилагаю нѣсколько книжекъ — отчеты миссіи: — стоитъ Вашему Высочеству пробѣжать ихъ. Вы увидите, какъ идетъ это дѣло и какихъ требуетъ самоотверженныхъ трудовъ ...”.Въ 1882 г. изъ Алтайской миссіи была выдѣлена новая миссія Киргизская,
съ центромъ въ Семипалатинскѣ. Въ царствованіе имп. Николая I возникли также миссіи: Обдорская (1832), Кондинская (1844), Туруханская (1850), закрытая въ 1872 г. Въ царствованіе имп. Александра II возникли миссіи: Сургутская (1867), въ Минусинскомъ округѣ (1876), входившемъ въ южную часть Енисейской епархіи, Семирѣченская (1868), сосредоточенная около миссіонерскаго братства въ г. Вѣрномъ (съ 1871 г. миссія числилась въ Туркестанской епархіи).