Владыка Филаретъ, не смотря на всѣ препятствія и личныя непріятности, упорно работалъ и поставилъ дѣло на твердую почву. Онъ открылъ много новыхъ приходовъ, вызвалъ значительное число нужныхъ для священническихъ мѣстъ людей, первый опредѣлилъ образъ дѣйствій духовенства въ такой сложной и трудной обстановкѣ. Еп. Филарету удалось прилично устроить матеріальное положеніе духовенства и создать въ разныхъ мѣстахъ инородческія школы. Въ 1847 г. въ Ригѣ открыто было духовное училище, съ преподаваніемъ мѣстныхъ языковъ для воспитанія духовныхъ дѣятелей въ краѣ изъ русскихъ и инородцевъ. Владыка Филаретъ работалъ до полнаго истощенія силъ, порою не имѣя времени для вкушенія пищи и сна. Нѣмецкая партія всячески старалась избавиться отъ такого опаснаго для нея іерарха. Въ 1848 г. владыка Филаретъ былъ переведенъ въ Харьковъ,
въ 1857 г. возведенъ во архіепископа. Съ 1859 г. онъ былъ перемѣщенъ въ Черниговъ, гдѣ и закончилъ свою столь полезную для Церкви и Россіи жизнь въ 1866 году.На положеніе дѣлъ въ Прибалтійскомъ
краѣ было обращено особенное вниманіе благодаря печатнымъ трудамъ Юрія Ѳеод. Самарина (1819-76), одного изъ основоположниковъ славянофильства. Принадлежа къ родовитой и богатой дворянской семьѣ, москвичъ, онъ окончилъ московскій университетъ. Сначала увлекался философіей Гегеля, затѣмъ же всецѣло принялъ богословскія православныя воззрѣнія извѣстнаго славянофила А. С. Хомякова. Написалъ замѣчательную диссертацію о Стефанѣ Яворскомъ и Ѳеофанѣ Прокоповичѣ. Въ 1847 г. онъ служилъ по министерству внутреннихъ дѣлъ въ Ригѣ, состоя при генералъ-губернаторѣ. Палена замѣнилъ Е. А. Головинъ, немногимъ отличавшійся отъ своего предшественника. Слухи о насильственномъ присоединеніи къ Православію эстовъ и латышей и о возбужденіи ихъ православнымъ духовенствомъ противъ помѣщиковъ побудили его написать въ 1849 г. “Письма изъ Риги”, въ которыхъ обсуждалось отношеніе къ Россіи прибалтійскихъ нѣмцевъ. Письма эти, распространявшіеся въ рукописи, вызвали неудовольствіе въ нѣкоторыхъ вліятельныхъ кругахъ. Какъ должностное лицо, онъ былъ привлеченъ по обвиненію въ разглашеніи служебныхъ тайнъ. Благодаря личному вмѣшательству имп. Николая I, имѣвшаго и личную бесѣду съ нимъ, дѣло ограничилось для него 10-дневнымъ арестомъ и переводомъ на службу въ Симбирскъ. Въ своихъ “Письмахъ”, Самаринъ указывалъ, что задачи Россіи заключаются въ поднятіи и укрѣпленіи расположенныхъ къ ней эстовъ и латышей. Этому вопросу посвященъ былъ частично и его трудъ “Окраины Россіи”, напечатанный впервые въ Берлинѣ (1868-76). Самаринымъ написанъ также замѣчательный полемическій трудъ противъ іезуитовъ: “Іезуиты и ихъ отношеніе къ Россіи”.Преемникомъ владыки Филарета былъ извѣстный іерархъ второй пол. XIX вѣка, Платонъ (Городецкій),
впослѣдствіи митрополитъ кіевскій и галицкій (1803-1891). Въ 1848 же году онъ былъ назначенъ епископомъ въ Ригу, являясь викаріемъ псковской епархіи. Съ 1850 г. онъ сталъ во главѣ самостоятельной рижской епархіи, получивъ позднѣе титулъ архіепископа. Владыка Платонъ дѣятельно заботился объ укрѣпленіи Православія въ краѣ. Благодаря его примирительному образу дѣйствій и просвѣтительной дѣятельности, православная церковь въ Прибалтійскомъ краѣ заняла подобающее ей мѣсто. Владыка Платонъ почти удвоилъ число церквей, обратилъ еще большее вниманіе на поднятіе благосостоянія духовенства. Рижское дух. училище было преобразовано въ семинарію, въ которую онъ прилагалъ старанія привлечь природныхъ эстовъ и латышей. За время его управленія паства увеличилась на 41000 человѣкъ. Въ 1867 г. архіеп. Платонъ возглавилъ Донскую епархію.Новое большое движеніе эстовъ и латышей въ православіе появилось въ началѣ 80-хъ годовъ со вступленіемъ на престолъ имп. Александра 111,
поддерживавшаго во всѣхъ западныхъ окраинахъ имперіи православныя и русскія начала. Измѣнилось и направленіе мѣстной администраціи. Среди ея своимъ твердыми церковными и русскими взглядами выдѣлялся эстляндскій губернаторъ, кн. С. В. Шаховской. Супруга его, дочь извѣстнаго сподвижника имп. Александра II, военнаго министра Милютина, основала въ Люхтицѣ, Эстляндской г., въ 1892 г. женскій мон., при которомъ были устроены школа, пріютъ, мастерскія иконописная, золотошвейная, швальня.