Уже первый полноценный сезон под руководством Пачеко принес команде второе место: впереди оказался лишь «Порту». В стан «клетчатых» после неудачного сезона в «Бенфике» вернулся Эрвин Санчес, на фланге блистал вингер Мартелинью, а гибкая схема игры, когда прямо во время матча построение игроков менялось с 4–4–2 на 4–3–3, позволяло «Боавиште» подстраиваться под любого соперника. По итогам сезона клуб попал в третий отборочный раунд Лиги чемпионов, но борьба на несколько фронтов и завышенные ожидания плохо сказались на форме команды Пачеко. «Спортинг» и «Бенфика» отвоевали свои позиции, и в своем втором полноценном сезоне Пачеко с командой занял четвертое место, снова в тени большой тройки.
В Европе «Боавишта» одолела «Брондбю» и прошла в групповой этап ЛЧ, отнявший у команды много сил, которых и не осталось на чемпионат. «Русенборг», «Боруссия Дортмунд» и «Фейеноорд» были сложными соперниками для португальского клуба, который тем не менее сумел обыграть немцев на своем поле с минимальным счетом. Пачеко усвоил урок и учел проблемы, возникающие при участии команды в нескольких интенсивных турнирах. Впереди «Боавишту» ждал главный год в ее истории.
В сезоне 2000/01 команда Хайме Пачеко до конца прошла путь от одной из лучших до самой лучшей. Это была упорнейшая кампания, в которой два клуба из Порту быстро оторвались от остальных и вели борьбу между собой до самого конца. В последнем туре «Боавишта» и «Порту» играли между собой в Дерби да Инвикта, и долгое время казалось, что судьба чемпионства решится именно в этом матче. На протяжении всего сезона «клетчатые» играли с невероятно сбалансированным подходом, уделяя одинаково пристальное внимание как атаке, так и обороне. В команде не было ярко выраженного голеадора, и на счету лучшего бомбардира клуба по итогам сезона было всего 11 забитых мячей. При этом «Боавишта» наколотила 63 гола в 34 матчах (второй результат чемпионата) и пропустила 22, став лучшей в Португалии по этому показателю.
Это означало, что игроки Пачеко атаковали и оборонялись все вместе, что, несомненно, шло на пользу команде, а отменная физическая подготовка позволяла футболистам покрывать за матч огромные расстояния. В предпоследнем туре «Боавишта» обыграла «Авеш» и обеспечила себе отрыв от «Порту» на четыре очка. Даже поражение от принципиального соперника в дерби в последнем туре не омрачило праздника фанатам скромного клуба, впервые за 55 лет прервавшего гегемонию команд большой португальской тройки. Город из синего превратился в клетчатый, а самые разгоряченные болельщики ночью проникли на стадион «Порту», чтобы спеть гимн «Боавишты» с зажженными файерами прямо перед фанатской трибуной «драконов».
Два года спустя Дерби да Инвикта чуть было не случилось в финале Кубка УЕФА. «Порту» Жозе Моуринью уничтожил в одной второй «Лацио», а «Боавишта» выбила из турнира ПСЖ (да-да!) «Герту» и «Малагу» и сыграла вничью с «Селтиком» в первом полуфинальном матче, но гол Хенрика Ларссона на 79-й минуте ответной встречи остановил команду Пачеко в шаге от игры в Севилье, где забивали Дерлей, Аленичев и тот же Ларссон, а Моуринью впервые покорил Европу.
К сожалению для болельщиков «Боавишты», солидные выступления в Европе скрыли гниль, начавшую разъедать клуб изнутри. Решение построить новый стадион к Евро-2004 и Португальская федерация футбола, которая отказалась от своего обещания предоставить средства для части проекта, оставили клуб с серьезными финансовыми проблемами. Из клуба ушло несколько ведущих игроков, и сезон он завершил на 10-м месте. После этого провала пост тренера команды покинул Хайме Пачеко, которого заменил Эрвин Санчес.
В 2008 году «Боавишту» выкинули во второй дивизион из-за ее роли в скандале «Апито Дурадо» («Золотой свисток»), громком деле с запугиванием португальских арбитров. Жоау Лоурейру было запрещено участвовать в футбольной жизни страны, его отцу также были предъявлены обвинения. Год спустя «Боавишта» оказалась в третьем дивизионе.
Лишь в 2014 году, когда чемпионат Португалии расширили на две команды, а апелляционный суд отменил наказание «клетчатых», клуб вернулся в высший эшелон местного футбола. Кроме того, на свой пост вернулся Лоурейру, который тут же заключил сделку с кредиторами клуба, в результате которого его долги сократились вдвое.
К удивлению многих, «Боавиште» удалось спастись от вылета в первом сезоне после возвращения. С тех пор клуб остается середняком португальского футбола, плавая между восьмой и десятой строчкой турнирной таблицы, а на его место нарушителя спокойствия большой тройки пришла «Брага», пару раз завершавшая сезон на третьем и втором местах, но на победу в лиге она так и не наиграла.
Даже самые оголтелые фанаты «Боавишты» признают, что шансы их клуба вернуться на призовые места в ближайшее время выглядят нереальными. Но любой из них по-прежнему уверен, что Порту когда-нибудь обязательно вновь будет украшен клетчатыми черно-белыми флагами, а большая тройка станет большой четверкой – пусть даже всего на один сезон.