В 1211 году борьба эстонцев против захватчиков усилилась и приобрела еще больший размах. Ранней весной 1211 года немцы вторглись в Сакалу, разорили ее и окружили крепость Вильянди, которую после героической обороны эстонцы были вынуждены сдать. За этим, однако, последовали многочисленные походы эстонцев против врага. Борьбу жителей южной Эстонии начали активно поддерживать сааремасцы, приплывавшие на своих кораблях под Ригу и на реку Гауя. В 1211 году был совершен крупный объединенный поход на укрепленный замок Каупо, старейшины крещеных ливов, в Турайде; этот поход должен был явиться первым этапом в осуществлении военного плана, направленного против Риги. Однако на помощь Каупо пришло недавно присланное из Германии войско и эстонцы потерпели неудачу. Опустошительные набеги врагов и повальные болезни, свирепствовавшие в 1211-1212 годах, ослабили силы эстонцев, ливов и латышей. Покоренные немцами ливы и латыши заключили с эстонцами перемирие. Епископ и орден также заключили с эстонцами договор о перемирии на три года, чтобы укрепить свои завоевания. Однако еще до истечения срока перемирия епископские и орденские войска стали снова разорять эстонские земли. Эстонцы ответили на это несколькими военными походами, но в 1215-1216 годах захватчики подчинили своей власти несколько земель южной Эстонии. Зимой 1216 года немцы предприняли через замерзшие проливы набег на Сааремаа, но потерпели поражение. Крестоносцы непрерывно получали подкрепления, и это позволяло им вторгаться все дальше и дальше в эстонские земли, вследствие чего к 1217 году Уганди оказалась в такой же зависимости от захватчиков, как ливы и латгалы.
Завоевание южной Эстонии немцами ставило под серьезную угрозу русские территории, особенно Новгород. Новгород и Псков стали готовить отпор захватчикам. В 1217 году было собрано большое войско, русские призвали и эстонцев присоединиться к нему. В ответ на этот призыв под Отепя собралось не только ополчение из непокоренных эстонских земель, но и жители тех земель, которым уже было навязано христианство. Благодаря победе объединенного русско-эстонского войска под Отепя лахвптчики были изгнаны из Уганди и потеряли свою власть и над рядом друтих земель.
Осенью 1217 года эстонцы начали готовиться к большому военному походу и призвали новгородского князи присоединиться к ним. Проведав об этом, немцы поспешили опередить русское войско. В сражении близ Вильянди эстонцы потерпели поражение. В 1218 году объединенные силы эстонцев и русских нанесли серьезный удар врагу в земле Уганди.
Видя, что немецких войск не хватает для борьбы с русскими и эстонцами, епископ Альберт обратился за помощью к датскому королю Вальдемару II. Датчане уже и ранее совершали разбойничьи набеги на восточное побережье Балтийского моря. В 1219 году датский король во главе крупного войска предпринял набег на северную Эстонию. Эстонцы оказали упорное сопротивление, но после ожесточенной борьбы были покорены. На эстонцев теперь наступали с двух сторон — с юга немцы, с севера датчане, и к 1220 году жители всей материковой части эстонских земель подпали под иго завоевателей. Несмотря на это, борьба с захватчиками продолжалась, теперь уже по почину сааремасцев. Договорившись о разделе покоренных земель, захватчики повели усиленное наступление с целью покорить и Сааремаа, но встретили упорное сопротивление.
Сааремасцы, захватив и разрушив построенную датчанами каменную крепость на Сааремаа, призвали жителей материковой части Эстонии к восстанию против феодально-католического ига. Всеэстонское восстание 1222-1223 годов было кульминационным пунктом освободительной борьбы эстонского народа. Восставшие обратились за помощью к русским, и те прислали в эстонские крепости свои войска. Но длившаяся годами борьба значительно ослабила силы эстонцев, а русские не могли оказать им в полной мере действенную помощь из-за того, что сами подверглись в 1223 году татаро-монгольскому нашествию. В 1224 году епископ Альберт прибыл из Германии с вновь навербованным войском крестоносцев, и немцы предприняли новое наступление. Был осажден главный центр восстания эстонцев и опорный пункт Новгорода в Эстонии — Тарту. После долгой, ожесточенной борьбы крепость пала, ее защитники погибли все до единого. Захватчики снова стали упрочивать свою власть, В 1227 году был покорен и остров Сааремаа.
Завоевание эстонских земель было завершено, но восстания эстонцев продолжались, поддержанные борьбой русских против немецких захватчиков.
***
Роман Метсанурка «На реке Юмере», повествующий о сопротивлении древних эстонцев чужеземмным завоевателям-феодалам, отображает только один из эпизодов этой упорной, десятилетиями длившейся борьбы. Действие романа охватывает короткий отрезок времени — от начального периода этой борьбы до битвы на Юмере в 1210 году, окончившейся победой эстонцев.