Императрица Феодора тоже простерлась перед старцем и сказала ему: «Помолитесь обо мне, отец, чтобы Бог дал мне сына». Ведь она, пишет автор жития святого Саввы, была бесплодней, чем камень, и желала сына сильней, чем даже империю. Но святой лишь ответил: «Пусть Господь сохранит вас, ваше могущество, прославленной и благочестивой». Феодора повторила свою просьбу снова, затем еще несколько раз, но не растрогала этим старца и ушла, очень огорченная. Тогда придворные, присоединившие к просьбам императрицы свои настойчивые просьбы, стали упрекать Савву в бесчувствии: почему он не ощущает, какое горе причинил императрице? А Савва, объясняя свои отказ, ответил им: «Знайте же, что Бог никогда не позволит этой женщине произвести на свет сына, который будет воспитан в учении Севера и причинит церкви больше бед, чем даже Анастасий».
Этим святой старец дал понять, что знает, каких взглядов придерживается в душе императрица – что она тайно была сторонницей ереси Севера. Феодора действительно всей своей властью поддерживала партию монофизитов, и вскоре, когда в июне 535 года умер патриарх Епифаний, ее влияние помогло подняться на престол епископов Нового Рима одному из ее ставленников, монаху Анфиму, бывшем епископу Трапезунда. Однако этот еретик недолго наслаждался властью. Не только монахи, подчиненные святому Савве, но и монахи Палестины, Синая, Сирии и Константинополя еще раз объединились и встали на защиту православия. Они сразу сообщили папе Агапиту, приехавшему в столицу империи в начале 536 года, о положении, в котором оказалась византийская церковь. Несмотря на сопротивление императора, Анфим был низложен, а на его место назначен Мина.
Этот папа умер вскоре, в апреле 536 года, но его смерть не помешала монахам довести до конца их борьбу против Анфима. В памятной записке, адресованной Юстиниану, они просили исполнить приговор, вынесенный Агапитом, и избавить церковь от заразы, то есть от Анфима и других еретиков: «Хотя это и дерзко с нашей стороны, мы умоляем Вас, Ваша Императорская Власть, именем нашего великого Бога и Спасителя Иисуса Христа, – писали они, – не презирать справедливое суждение этого святого человека (Агапита), а исполнить его и освободить церковь Господа и весь мир от заразы, то есть от Анфима и других еретиков. Теперь, когда этот святой отозван из нашего мира, после Бога именно к Вам, Ваше Благочестие, мы обращаемся с просьбой положить конец этим ошибкам. Выполнив решения, которые он принял согласно законодательству и канонам, и утвердив их своим согласием, запретив на будущее такие дерзкие поступки, Вы почтите блаженную душу этого папы, которая теперь находится ближе к Богу, освободилась от земных и плотских уз, за свои добрые дела заслуженно получила свободный доступ к Богу и просит Его о мире и о Вашем спасении, Ваше Благочестие».
Патриарх Мина тоже получил много просьб, которые вместе с другими прошениями были прочитаны на знаменитом соборе 536 года, где монахи играли важнейшую роль, были настоящей душой собрания, проясняя для его участников вопросы религии и вдохновляя их на решения. Юстиниан в эдикте, обнародованном после этого собора, два раза упомянул о вмешательстве монашеской партии. Напомнив о том, что именно епископы своей властью смещают недостойных людей с должностей, он добавил, что вмешательство императорской власти необходимо, чтобы обеспечить исполнение епископских постановлений. Затем он утвердил решения, принятые Агапитом собором и направленные против Анфима, Севера, Петра Апамейского и Зоара, запретил этим четверым жить в столице, в ее окрестностях и во всех других крупных городах, общаться с кем-либо и проповедовать их извращенное учение. Затем он добавляет отдельно о Севере: «Мы также подтверждаем своей императорской властью обвинительный приговор, справедливо вынесенный Северу всеми епископскими и Патриаршими престолами с согласия монашества… На нем по-прежнему будет лежать проклятие, которое произнесено ему собранием патриархов, епископов и монахов нашей империи».
Примерно в это же время ошибки Оригена привели к большим беспорядкам в палестинских монастырях. Святой Савва в свой последний приезд в Константинополь уже жаловался на это императору и просил, чтобы тот своей властью помог положить конец этому бедствию и восстановить повсюду спокойствие в делах религии.
В начале 538 года в столицу приехали несколько монахов из Иерусалима с большим числом выписок из работ Оригена. Пользуясь поддержкой римского апокрисиария Пелагия и патриарха Мины, они попросили Юстиниана осудить эдиктом ошибки знаменитого александрийского богослова.