В Национальном собрании были не одни только сторонники Кемаля, в связи с чем он создал парламентскую группу обществ защиты прав Анатолии и Румелии из примерно 200 депутатов. А его оппоненты, отвергавшие идею республики и обвинявшие Кемаля в стремлении к личной диктатуре, создали в парламенте т. н. «Вторую группу» из 120 депутатов. В нее вошли как сторонники султаната, так и некоторые младотурки.
9 апреля в Бандырме был высажен с английского миноносца отряд Анзавура, насчитывавший более тысячи человек. Его действия преследовали цель восстановить власть султана в районах Бандырмы, Балыкесира, Кютахьи и Эскишехира. Поддержавшие Кемаля партизанские отряды разгромили отряд Анзавура. С немногими уцелевшими Анзавур бежал на английском корабле в Адапазары, где 13 апреля 1920 года офицер Генерального штаба Хайри-бей поднял восстание черкесов и абазинцев районов Болу и Дюздже. Число повстанцев превышало 4 тысяч. В начале мая они соединились с частями «халифатской армии» Анзавура, занявшей Адапазары и Гейве. 24-я пехотная дивизия, дислоцированная в Гейве, перешла на сторону восставших, которые стали хозяевами положения на большей части Северо-Западной Анатолии. Лояльная Стамбулу «армия халифата» состояла преимущественно из черкесов, грузин, албанцев, курдов и арабов. К концу июня она была разбита и распущена.
19–26 апреля 1920 года прошла конференция в Сан-Ремо, на которой страны Антанты распределили мандаты на управление бывшими провинциями Оттоманской империи и санкционировали оккупацию Грецией Адрианополя и Восточной Фракии. В Анатолии интервенты поддержали борьбу против националистов национальных меньшинств. Против кемалистов сражались ополчения курдских племен и черкесские отряды. При этом вожди черкесов, Черкес Этем и Ахмет Анзавур, воевали как с националистами-турками, так и с греческими интервентами. Также отряды армянских войск совершали рейды через границу и пытались захватить район Эрзурума. 22 июня 1920 года греческая армия начала новое наступление и в июле захватила Бандырму и Бурсу. Греки также оккупировали Фракию. Ганизон Адрианополя (Эдирне) капитулировал.
7 июня Национальное собрание приняло закон, объявлявший недействительными все обязательства и соглашения, подписанные султанским правительством, начиная с 16 апреля 1920 года, когда была официально провозглашена оккупация Стамбула союзниками.
Из партизанских отрядов Кемаль-паша сформировал летучие отряды и кавалерийскую дивизию, задачей которых на первых порах стала борьба с курдскими и черкесскими повстанцами.
Отряды формирующейся новой турецкой армии атаковали оборонительные укрепления англичан на Измитском полуострове, но под огнем английского флота вынуждены были отступить.
А вот в Южной Анатолии в борьбе против французов у турок дела шли значительно лучше. В конце января 1920 года они, нанеся поражение французской дивизии, освободили Марат и Урфу. В течение девяти месяцев французы не могли взять город Антеп. Отряды движения сопротивления действовали в Тарсусе, Адане, Позанты, Сисе, Османие и Мерсине.
Кемаль оказался в сложном положении, но сумел с честью из него выйти. Он направил посланника в Москву, чтобы попросить оружие для борьбы против «западных империалистов». Ленин пошел навстречу Ататюрку и разрешил поставки оружия со складов бывшего Кавказского фронта. Кемаль послал войска для подавления восстания черкесов, что удалось сделать без большого труда, поскольку иррегулярные черкесские формирования не могли противостоять обученным немцами регулярным турецким полкам. Карабекир 15 июня был назначен командующим Восточным фронтом, противостоявшим армянам, а несколько позже Али Фуад возглавил Западный фронт, противостоявший грекам. Когда союзники разгромили националистические группы в Стамбуле, Кемаль объединил всех государственных служащих в Организацию национальной обороны. Ее задачей стала поддержка национального правительства в Анкаре. Деятельность НКО облегчалась тем, что практически все работники почты и телеграфа оказались на стороне Кемаля. Он также начал попеременно отзывать в Анкару войска с фронта, чтобы организовать их обучение и подготовку.
22 июня 1920 года началось генеральное наступление греческой армии, не испытывавшей недостатка в вооружениях и боеприпасах, поступивших главным образом из Англии. Основная группировка греческих войск наступала из Измира в глубь Анатолии. Вспомогательная группировка вступила в Восточную Фракию и захватила Адрианополь, гарнизон которого капитулировал. Через восемнадцать дней греки прошли 400 км вплоть до Эскишехира, в 200 километрах от Анкары. В их руках оказалась значительная часть Западной Анатолии.