В целом за войну потери греков составили 19 362 убитых, 18 095 пропавших без вести, 48 880 раненых, 4878 погибших от небоевых причин, 35 тыс. пленных. Сколько греков из числа пропавших без вести оказалось среди пленных, неизвестно, равно как и количество умерших в плену. Потери турок в войне с Грецией 1919–1922 годов составили 9167 убитых, 2474 умерших от ран и от небоевых причин, 31 097 раненых, 11 150 пропавших без вести и 6522 пленных. Сколько пропавших без вести оказалось среди пленных, неизвестно. В ходе обмена пленными в 1923 году в Грецию вернулось около 10 тыс. тех, кто был зарегистрирован как бывший военнопленный. Однако не исключено, что ряд военнопленных вернулись в общем потоке репатриируемых из Турции греков, предпочитая не заявлять, что были в плену. Греция захватила 22 071 гражданских и военных пленных, в том числе 520 офицеров и 6002 солдат. В 1923 году в ходе обмена населением в Турцию вернулись 329 офицеров, 6002 солдата и 9410 гражданских пленных. 191 офицер и 6149 гражданских турецких пленных умерли. Очевидно, умерло и несколько тысяч пленных турецких солдат. Их могло быть до 5 тыс. человек, если считать число умерших пленных приблизительно равным разности между общим числом пропавших без вести и числом вернувшихся из плена военнослужащих.
Хотя сопротивление греческих войск прекратилось, под иностранной оккупацией оставались Стамбул, Эдирне и Восточная Фракия. Кемаль двинул свои войска дальше на север. 23 сентября турецкая кавалерия вторглась в нейтральную зону проливов. Пять дней спустя 2-я кавалерийская дивизия вплотную подошла к позициям англичан в Дарданеллах. Но ни Англия, ни Франция, измученные Первой мировой войной, новой войны не хотели. Кризис был разрешен дипломатическим путем.
Черчилль, убежденный, что турки готовы начать наступление 30 сентября, потребовал у своих представителей в Стамбуле предъявить туркам ультиматум. Но всё же англичане сознавали, что турки вряд ли будут сражаться с ними, поскольку их главная цель – перемирие.
Всем журналистам, поспешившим в Измир взять интервью у Кемаля, он заявил: «Восточная Фракия вплоть до реки Марица должна принадлежать Турции, а греки должны эвакуироваться оттуда в течение тридцати дней после заключения перемирия».
Освободив Анатолию, турецкая армия попыталась переправиться на европейский берег, с тем чтобы закончить освобождение всей страны, включая проливы, Стамбул и Восточную Фракию, но английское командование воспротивилось этому, пригрозив продолжением военных действий, на этот раз уже с участием британских войск. Но на самом деле почти никто в Лондоне ввязываться в серьезную войну не хотел, и Кемаль это учитывал. Уладить конфликт взялся хорошо известный туркам по переговорам 1921 года французский дипломат Франклен-Буйон. От имени всех держав Антанты он заверил Кемаля, что Турция получит Восточную Фракию без боя, после чего Кемаль согласился на перемирие и приостановил продвижение войск.
После обмена нотами англичане, французы и турки согласились начать переговоры о перемирии. Они начались 3 октября 1922 года в городе Муданья, порте, находящемся рядом с Бурсой на берегу Мраморного моря. Турцию представлял командующий Западным фронтом Исмет-паша, а Антанту – верховные комиссары Англии, Франции и Италии в Стамбуле. Греческие делегаты фактически не участвовали в переговорах, и их голос никто не слушал. Греческая армия перестала существовать, и Греция была не в состоянии продолжать войну, даже с помощью союзников. Достижение турецких целей облегчалось тем, что после катастрофы в Анатолии в Греции произошел антивоенный переворот, свергнувший короля Константина, и никто в Греции в принципе не желал продолжения войны. Кемаль приказал Исмету не делать в ходе переговоров никаких уступок. Тем не менее державы Антанты сопротивлялись немедленной передаче Восточной Фракии туркам. Тогда Исмет-паша по согласованию с Кемалем прервал переговоры, а его армия возобновила продвижение к проливам. В результате переговоры возобновились, и стороны договорились о том, что в Восточную Фракию прибудет кемалистская администрация и жандармерия, а эвакуация союзниками войск из Стамбула произойдет после заключения окончательного мирного договора. 10 октября Кемаль потребовал от Исмета подписать договор о перемирии. Он повторил дословно то, что говорил в Национальном собрании: «Миссия нашей армии завершена. Теперь необходимо урегулировать проблемы дипломатическим путем». На вопли некоторых возмущенных парламентариев, что у них украли победу, Кемаль не обращает внимания.
11 октября 1922 года Муданийское перемирие было подписано. Правда, его отказались подписать греки, но это ничего не меняло. Согласно условиям перемирия, греческие войска немедленно покинули Восточную Фракию и туда возвратилась турецкая жандармерия. Стамбул, Эдирне и проливы оставались под оккупацией союзников вплоть до заключения мира, но и там вводилась кемалистская гражданская администрация.