К осени 1944 г. советскому руководству стало ясно, что сопротивление советизации Прибалтики оказалось неожиданно более серьезным и активным, чем можно было ожидать от остатков германских частей и «полицаев»[1678]. С целью усиления контроля 11 ноября 1944 г. были созданы бюро ЦК ВКП(б) по Литве и Эстонии, 29 декабря того же года – по Латвии. В задачу этим органам ставилось в том числе «пресечение деятельности буржуазных националистов и других антисоветских элементов». С целью подготовки кадров для идеологической борьбы с националистами, согласно постановлению ЦК ВКП(б) от 23 января 1945 г., в Москве и Ленинграде были организованы двухмесячные курсы по подготовке партийных работников для Латвийской, Литовской и Эстонской ССР. Перед пропагандистами были поставлены задачи «разъяснить основные принципы советского строя, ленинско-сталинской политики дружбы народов СССР, необходимость соблюдения советских законов и государственной дисциплины, раскрыть перед народом истинное лицо… буржуазных националистов как злейших врагов… народа», обнародовать «факты зверств, издевательств и насилий, творимых презренными буржуазными националистами… привлекать к ответственности соучастников зверств немецких оккупантов», воспитывать население «в духе дружбы народов, уважения к русскому народу и другим народам СССР». В Прибалтике были сформированы группы «советского актива», проведены съезды крестьян, молодежи, интеллигенции, женщин, работников отдельных отраслей промышленности. Работали агитаторы, многомиллионными тиражами были изданы книги, календари, плакаты, портреты вождей и пр.[1679]
Одной из трагических акций, осуществленных советскими властями в заключительный период войны, стали депортации некоторых народов СССР, обусловленные реакцией советского руководства на «поведение» представителей этих народов во время оккупации и после нее. C целью борьбы с бандповстанческим движением в апреле 1943 г. из Карачаевской АО было выселено 673 члена семей «бандглаварей и активных бандитов»[1680]. Однако эта мера советскому руководству показалась недостаточной. 12 и 14 октября 1943 г. были изданы указ Президиума Верховного Совета и постановление СНК СССР о выселении всех карачаевцев в Казахстан и Киргизию. Этот шаг был «обоснован» тем, что «в период оккупации… многие карачаевцы вели себя предательски… а после изгнания оккупантов противодействуют проводимым советской властью мероприятиям, скрывают от органов власти врагов и заброшенных немцами агентов, оказывают им помощь». Всего было депортировано 59 506 карачаевцев[1681]. 27 декабря 1943 г. Карачаевская АО была ликвидирована, а ее территория была поделена между Краснодарским, Ставропольским краями и Грузинской ССР.
Политическое решение о депортации калмыцкого народа было принято еще летом 1943 г.[1682] В декабре того же года Президиум Верховного Совета СССР и Политбюро ЦК ВКП(б) приняли постановление «о ликвидации Калмыцкой АССР и образовании Астраханской области в составе РСФСР». Калмыки, в том числе проживавшие в сопредельных с Калмыцкой АССР регионах, подлежали депортации в Алтайский и Красноярский края, Омскую и Новосибирскую области. «Основанием» для депортации было обвинение калмыков в сотрудничестве с оккупантами, сдача в плен воинов 110-й калмыцкой кавалерийской дивизии, а также бандповстанческие проявления в Калмыкии[1683]. К 3 января 1944 г. было депортировано 93 139 калмыков, а также арестовано 750 чел. из числа «бандпособников, пособников оккупантов, антисоветских элементов»[1684].
Решение о депортации чеченского и ингушского народов, по данным А.М. Некрича, было принято 11 февраля 1943 г., однако И.В. Сталин и другие руководители государства высказались за то, чтобы отложить этот шаг до окончательного изгнания оккупантов с Северного Кавказа[1685]. Акция по депортации была осуществлена в период с 23 по 29 февраля 1944 г., в результате чего в Казахстан и Киргизию было депортировано 520 055 чел., а также арестовано 2016 чел.[1686] 7 марта 1944 г. Президиум Верховного Совета СССР издал указ «О ликвидации Чечено-Ингушской АССР и об административном устройстве ее территории», на основании которого был образован Грозненский округ (с 22 марта 1944 г. – Грозненская область). Южная часть территории Чечено-Ингушетии была передана Грузинской СССР, некоторые восточные районы – Дагестанской АССР, западные районы – Северо-Осетинской АССР. Советское руководство официально «обосновывало» депортацию чеченцев и ингушей наказанием за прогерманское поведение во время войны[1687].