В это же время царевна Софья Алексеевна убедилась, что потехи брата с конюхами принимают значение гораздо важнее того, чем она предполагала. Она увидела, что создаваемое войско растёт, крепнет силами и будет ей служить главною помехою для достижения её целей самодержавия. Она замыслила принять страшное решение: убить царственного брата и его мать и сжечь потешные сёла.
Но подобный план не мог бы иметь успеха без большой партии сторонников, и она решила её составить; изучив достоинства всех, она сочла, что нет никого достойнее, чтобы стать во главе её, чем князь Голицын.
Царевна в сие время женила брата своего Иоанна на Прасковье Фёдоровне Салтыковой (1684 г., января 9).
Трудность была в том, чтобы заставить Голицына согласиться на убийство двух царей, на которое она твёрдо решилась, считая, что этим обеспечит власть себе, своему будущему мужу и их детям. Князь (Ie prince), более опытный и менее влюблённый, (чем она) представил ей весь ужас этого замысла, и заставил её принять другой план, более благоразумный, и, очевидно, более надёжный. Он состоял в том, чтобы женить царя Ивана, и ввиду его бессилия дать его жене любовника, которого она полюбила бы на благо государству, которому она дала бы наследников. А когда у этого монарха появятся дети и у царя Петра не станет больше ни друзей, ни креатур, в этом случае они повенчаются, и, чтобы их брак был признан всем миром, они добьются избрания патриархом отца Сильвестра (Медведева), польского монаха греческой веры, человека очень опытного, который тут же предложит направить посольство в Рим для объединения церквей. Когда это удастся, то это вызовет одобрение и уважение. Затем они принудят Петра сделаться священником, а Ивана – громко сетовать на распущенность его жены, чтобы показать, что дети рождены ею не от него, потом постригут её в монастырь и добьются, чтобы Иван женился вновь, но так, чтобы они были уверены, что у них не будет детей. Этим путём, без убийства и без боязни Божьей кары, они станут во главе государства при жизни этого несчастного и после его смерти, так как в царской семье больше не останется мужских наследников.
И понеже царевна Софья Алексеевна была великаго ума и великой политик, хотя себя укрепить вечно в правлении под именем своего брата царя Иоанна Алексеевича, взяла резолюцию его, брата своего, женить. И женила на дочери Фёдора Салтыкова, из добраго шляхетства, которой был тогда воеводою в Енисейске, в Сибирском королевстве. И сию женитьбу в том виде учинила, чтоб видеть сыновей от брата своего и наследников к короне.
Января 10.1684. Император Иоанн Алексеевич частным образом (как обычно) женился на Прасковье Фёдоровне Салтыковой, её отец прежде звался Александром, а на сей раз сменил [имя] на Теодор или Фёдор, как здесь произносят сие.
Из донесения австрийского посла Иоганна Эбегарда Гевеля от 7–8 февраля 1684 г.: «Иван очень слабого здоровья, напротив, Пётр исполнен силы, здоровья, ума и блестящих надежд. Сестра обоих, Софья, в руках которой всё правление, по-видимому, навязала Ивану жену, надеясь, что он произведёт потомство и тем самым устранит своего брата от надежды на престол, но на первое плохая надежда, так как Иван нездоров и недалёк… Да и невозможно, чтобы долго подобные отношения братьев могли продолжаться. На стороне Петра большая часть бояр и сенаторов; только сестра Софья, 26-ти лет, великого ума и способностей, поддерживает старшего брата. Но никому не тайна, что старший по слабому состоянию умственных и физических сил, неспособен к управлению. Это признают сами бояре и частенько об этом вздыхают…».
(Московиты) имеют большую склонность к поездкам на богомолье. Царь Иван, будучи полностью парализованным (на него страшно смотреть. Ему около 28 лет), проводит в них всю жизнь.