Минирование подступов к берегам, портам и стратегически-важным участкам побережья Балтийского моря продолжалось. В 1915 году началась борьба за Рижский залив, так как сухопутные силы неприятеля стали продвигаться к Виндаве, а впоследствии и к Риге. За успешные постановки минных заграждений Высочайшим приказом по Морскому ведомству от 18 апреля 1915 года вице-адмирал В. А. Канин был награжден георгиевским оружием. В приказе указывалось, что этой награды он удостоен «в воздаяние доблести, проявленной при выполнении операции большого боевого значения в исключительно тяжелых условиях». А уже на следующий день, 19 апреля, по приказу Василия Александровича был впервые загражден минами вход в Рижский залив через Ирбенский пролив. В ночь на 24 апреля «Новик» с 4 миноносцами типа «Сибирский Стрелок», в сопровождении 8 миноносцев типа «Стерегущий», поставили заграждение против и южнее Либавы.
После смерти адмирала Н. О. Эссена вице-адмирал В. А. Канин Высочайшим повелением от 7 мая 1915 года был назначен на должность командующего флотом Балтийского моря. Этот флот под его руководством в конце кампании 1915 года провел ряд успешных операций на морском театре и по содействию войскам приморского фланга в Курляндии.
Так, 19 июня у входа в Данцигский залив русская подводная лодка атаковала германский линкор «Поммерн» и серьезно его повредила. 3 августа произошло сражение между эскадренным миноносцем «Новик» с эскадренными миноносцами противника «Фау S9» и «100». Бой длился 17 минут, после чего тяжело поврежденные германские суда закрылись дымовой завесой. Первый миноносец выкинулся на берег и был взорван своей командой, второму удалось дойти до своих сил. 11 октября 1915 года от удара русской подводной лодкой у Либавы был взорван и погиб германский броненосный крейсер «Принц Адальберт».
Василий Александрович постоянно докладывал императору о победах, одержанных Балтийским флотом над противником. Николай II, который к тому времени уже принял на себя должность Верховного главнокомандующего, непременно сообщал о них представителям союзных армий, которые постоянно находились при Ставке. При отсутствии существенных побед на суше победы на море были очень кстати. Имя адмирала В. А. Канина произносилось с большим уважением. 6 июля 1915 года он был награжден орденом Св. Анны 1-й степени, а 28 сентября того же года – орденом Св. Владимира 2-й степени с мечами.
28 октября 1915 года император с наследником цесаревичем Алексеем прибыл в Ревель. На станции их встречали морской министр генерал-адъютант И. К. Григорович, а также командующий Балтийским флотом вице-адмирал В. А. Канин, комендант Морской крепости императора Петра Великого вице-адмирал А. М. Герасимов и эстляндский губернатор генерал-майор Н. П. Коростовец. Пропустив почетный караул, Николай II с наследником отбыл в автомобиле на полигон Морской крепости императора Петра Великого и осмотрел там части гарнизона и крепостные сооружения. Затем его величество проследовал в порт, где обошел, здороваясь, молодых солдат Приморского фронта крепости и поднялся затем на транспорт «Европа», встреченный офицерами и командами русских и английских подводных лодок. Во время этого посещения Николай II «лично удостоил награждением ордена Святого Георгия 4-й степени двух командиров английских подводных лодок и Георгиевскими крестами нижних чинов».
На следующий день Канин доложил императору, что группа крейсеров под командой адмирала Бахирева с полным грузом шаровых мин на верхних палубах вышла в южную часть Балтийского моря, где поставила большое минное заграждение южнее острова Готланд.
В ночь с 7 на 8 ноября наши миноносцы «Охотник» (брейд-вымпел начальника минной дивизии капитана 1-го ранга Колчака) и «Страшный», при поддержке «Новика», потопили германское сторожевое судно у банки Спаун, в 45 милях от Виндавы. Были взяты в плен подобранные с воды офицер и 21 человек команды.
22 ноября крейсера с дредноутами снова повторили поход в южную часть Балтийского моря, продолжив поставленное ранее заграждение общей длиной в 31 милю, на котором впоследствии взорвался неприятельский крейсер. В ночь на 4 декабря «Новик» и вошедшие в строй новые нефтяные миноносцы «Победитель» и «Забияка» поставили большое заграждение у Виндавы, на месте уничтоженного перед тем сторожевого судна. Через несколько часов, ранним утром 4 декабря на нем взорвались и погибли германский крейсер «Бремен» и большой эскадренный миноносец, спасены лишь 100 человек.
21 марта 1916 года В. А. Канин был награжден французским орденом Почетного легиона большого офицерского креста, а 10 апреля произведен в адмиралы Российского флота «за отличие по службе».